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Magnesium chloride

氯化镁

公司名称: Sigma-Aldrich
产品编号: M8266
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Company-protocol()
Other protocol()

Isolation of Chromatin-bound Proteins from Subcellular Fractions for Biochemical Analysis
Author:
Date:
2018-10-05
[Abstract]  Shuttling of proteins between different cellular compartments controls their proteostasis and can contribute in some cases to regulate their activity. Biochemical analysis of chromatin-bound proteins, such as transcription factors, is often difficult because of their low yield and due to the interference from nucleic acids. This protocol describes a method to efficiently fractionate cells combined with a mechanical (i.e., sonication) or an enzymatic treatment (i.e., benzonase) that facilitates analysis of chromatin-bound protein extracts by Western blot analysis or by ... [摘要]  在不同细胞区室之间穿梭蛋白质控制它们的蛋白质稳态,并且在某些情况下可以有助于调节它们的活性。 染色质结合蛋白(例如转录因子)的生化分析通常是困难的,因为它们的产率低并且由于核酸的干扰。 该协议描述了一种有效分离细胞的方法,结合机械(即,超声处理)或酶处理(即,benzonase),有助于分析染色质结合蛋白提取物 通过蛋白质印迹分析或蛋白质下拉分析。 该方法对于富集特定亚细胞级分内的特定蛋白质以研究特定的翻译后修饰模式或鉴定特定的蛋白质 - 蛋白质相互作用可能是有价值的。
【背景】许多染色质结合蛋白的活性和翻译后调节研究很少,因为在分离它们进行生化分析时存在技术困难。这甚至是转录因子的情况,例如基本的螺旋 - 环 - 螺旋(bHLH)转录因子,其通常在组织或细胞模型中具有稀缺的时间和空间表达模式(Dennis 等。,2018)。当生物材料的量成为研究分子途径的障碍时,协议细化有助于解除技术限制(Gillotin和Guillemot,2016)。在我们最近的研究中,我们努力了解神经元bHLH转录因子Ascl1的蛋白水解是如何在神经元分化的细胞模型中调节的(Gillotin et ...

High-throughput Microscopic Analysis of Salmonella Invasion of Host Cells
Author:
Date:
2018-09-20
[Abstract]  Salmonella is a Gram-negative bacterium causing a gastro-enteric disease called salmonellosis. During the first phase of infection, Salmonella uses its flagella to swim near the surface of the epithelial cells and to target specific site of infection. In order to study the selection criteria that determine which host cells are targeted by the pathogen, and to analyze the relation between infecting Salmonella (i.e., cooperation or competition), we have established a high-throughput microscopic assay of HeLa cells sequentially infected with fluorescent ... [摘要]  沙门氏菌是革兰氏阴性细菌,引起称为沙门氏菌病的胃肠疾病。在感染的第一阶段,沙门氏菌使用其鞭毛在上皮细胞表面附近游泳并靶向特定的感染部位。为了研究确定哪种宿主细胞被病原体靶向的选择标准,并分析感染沙门氏菌( ie ,合作或竞争)之间的关系,我们有建立了对荧光细菌依次感染的HeLa细胞的高通量显微镜检测。使用自动化图像分析管道,我们定量表征了感染和未感染细胞的众多参数。基于此,我们建立了一个预测模型,使我们能够识别宿主细胞易受感染的参数。我们发现宿主细胞易损性有两个来源:病原体诱导的细胞易感性从沙门氏菌摄取中出现并持续存在于感染过程的后期阶段;以及与细胞固有属性相关的宿主细胞固有的脆弱性,例如局部细胞拥挤和胆固醇含量。我们的方法基于形态学或分子宿主细胞参数预测单层上皮细胞中沙门氏菌感染的概率。在这里,我们提供了工作流程的详细描述,包括基于计算机的分析管道。我们的方法有可能应用于研究宿主 - 病原体相互作用的其他组合。

【背景】鼠伤寒沙门氏菌血清型鼠伤寒沙门氏菌通过摄入受污染的食物或水感染宿主,引起沙门氏菌病。一旦细菌到达肠道的远端回肠,它们就会侵入广泛的宿主细胞,包括肠上皮细胞(Watson和Holden,2010)。在宿主细胞入侵的第一阶段,沙门氏菌选择其目标,使用其鞭毛游泳并扫描上皮表面(Misselwitz et ...

Isothermal Titration Calorimetry: A Biophysical Method to Characterize the Interaction between Label-free Biomolecules in Solution
Author:
Date:
2018-08-05
[Abstract]  This protocol can be applied to analyze the direct interaction between a soluble protein and a target ligand molecule using Isothermal Titration Calorimetry (ITC, Malvern). ITC allows the biophysical characterization of binding between label-free, non-immobilized and in-solution biomolecules by providing the stoichiometry of the interaction, the equilibrium binding constants and the thermodynamic parameters. ITC monitors heat changes (released and/or absorbed) caused by macromolecular interactions with no restrictions of buffer and molecular weight of the macromolecules. [摘要]  该方案可用于使用等温滴定量热法(ITC,Malvern)分析可溶性蛋白质和靶配体分子之间的直接相互作用。 ITC允许通过提供相互作用的化学计量,平衡结合常数和热力学参数来对无标记,非固定和溶液内生物分子之间的结合进行生物物理表征。 ITC监测由大分子相互作用引起的热变化(释放和/或吸收),而不限制大分子的缓冲液和分子量。

【背景】大分子相互作用是关键的细胞事件,因为它们形成信号转导途径的基础。因此,大分子相互作用是研究的重要领域,因为它们允许更深入地理解作为生理学和病理生理学过程基础的分子机制,以及能够调节引起疾病的大分子结合事件的药物的合理设计。

在这种情况下,等温滴定量热法(ITC)是一种用于表征大分子相互作用的强大技术。 ITC确定两个分子结合时发生的热变化。可以吸收热量(吸热反应)或释放(放热反应)。 ITC通过确定由仪器的加热器提供给参比和样品池的差异功率来监测这种热变化,这是在结合反应期间抵消两个电池之间的任何温差所需的,使得参考之间没有温度差异。和样品细胞(图1)。

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