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Ethylenediamine tetraacetic acid disodium salt dihydrate

乙二胺四乙酸二钠盐二水合物

公司名称: Carl Roth
产品编号: 8043
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Preparation of Sequencing RNA Libraries through Chemical Cross-linking Coupled to Affinity Purification (cCLAP) in Saccharomyces cerevisiae
Author:
Date:
2018-10-05
[Abstract]  Ribonucleoprotein particles (mRNPs) are complexes consisting of mRNAs and RNA-binding proteins (RBPs) which control mRNA transcription localization, turnover, and translation. Some mRNAs within the mRNPs have been shown to undergo degradation or storage. Those transcripts can lack general mRNA elements, like the poly(A) tail or 5’ cap structure, which prevent their identification through the application of widely-used approaches like oligo(dT) purification. Here, we describe a modified cross-linking affinity purification protocol (cCLAP) based on existing cross-linking and immunoprecipitation ... [摘要]  核糖核蛋白颗粒(mRNP)是由mRNA和RNA结合蛋白(RBP)组成的复合物,其控制mRNA转录定位,转换和翻译。已显示mRNP内的一些mRNA经历降解或储存。那些转录物可能缺乏一般的mRNA元件,如poly(A)尾或5'帽结构,这通过应用广泛使用的方法如oligo(dT)纯化来阻止它们的鉴定。在这里,我们描述了基于现有的交联和免疫沉淀(CLIP)方法的修饰的交联亲和纯化方案(cCLAP),以分离mRNP中可被去腺苷酸化,去除和/或部分降解的mRNA,从而开启了检测不同的可能性。非编码RNA(ncRNA)的类型。分离后,将RNA进行衔接子连接,然后进行下一代测序(NGS)。由于快速有效的交联和淬灭步骤,该方案也适用于瞬时诱导的mRNP颗粒。实例包括由外在应激物触发的处理体(PB)或应力颗粒(SG)。其重现性和广泛应用使该方案成为研究特定RNP的RNA组成的有用且有力的工具。
【背景】mRNP内转录物的表征对于理解细胞转录和转录后过程至关重要。通过交联和免疫沉淀,然后通过RNA-Seq从mRNP颗粒中分离RNA已经成为鉴定mRNA靶标的常用方法(Tagwerker et al。,2006; Hafner et al。,2010; Kishore et al。,2011)。 ...

Quantitative Determination of Poly-β-hydroxybutyrate in Synechocystis sp. PCC 6803
Author:
Date:
2017-07-20
[Abstract]  Cyanobacteria synthesize a variety of chemically-different, high-value biopolymers such as glycogen (polyglucose), poly-β-hydroxybutyrate (PHB), cyanophycin (polyamide of arginine and aspartic acid) and volutin (polyphosphate) under excess conditions. Especially under unbalanced C to N ratios, glycogen and in some cyanobacterial genera also PHB are massively accumulated in the progression of the general nitrogen stress response. Several different technologies have been established for in situ and in vitro PHB analysis from different microbial sources. In this ... [摘要]  蓝细菌合成各种化学上不同的高价值生物聚合物,如糖原(polyglucose),poly-β-β-羟基丁酸酯(PHB),蓝藻素(精氨酸和天冬氨酸的聚酰胺)和挥发物(多磷酸盐) 在超额条件下。 特别是在不平衡的C至N比下,糖原和一些蓝藻属中,PHB在一般氮应激反应进程中大量积累。 已经针对不同微生物来源的原位实验和/或从体外分析,建立了几种不同的技术。 在该协议中,描述了用于蓝藻(Stechocystis)的PHB定量的快速可靠的分光光度法。 如(Damrow等人,2016)中描述的氮缺乏的PCC 6803。
【背景】非重氮营养蓝细菌,例如集胞藻(Synechocystis) PCC 6803通过漂白来解决缺乏组合的氮源,这是一种被称为褪绿的过程(Allen和Smith,1969)。这种驯化反应的特征在于四个主要的结构和形态变化:(i)类囊体层之间的电子致密糖原夹杂物(直径约40nm)的大量积累伴随着(ii)藻糖酵母天线复合物的降解, (iii)类囊体膜层的拆卸,包括数量减少和包装密度,和(iv)形成不同的电子透明PHB颗粒(直径约400-500nm)(Damrow等人,2016)。由于不存在分解代谢酶和PHB缺陷型突变体的明显表型,所以在几种物种中合成的蓝细菌PHB代谢的生理功能是相当不透明的(Beck等人,2012; van ,2010; Damrow等人,2016; ...

Phototaxis Assays of Synechocystis sp. PCC 6803 at Macroscopic and Microscopic Scales
Author:
Date:
2017-06-05
[Abstract]  Phototaxis is a mechanism that allows cyanobacteria to respond to fluctuations in the quality and quantity of illumination by moving either towards or away from a light source. Phototactic movement on low concentration agar or agarose plates can be analyzed at macroscopic and microscopic scales representing group behavior and single cell motility, respectively. Here, we describe a detailed procedure for phototaxis assays on both scales using the unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. [摘要]  Phototaxis是允许蓝细菌通过朝向或远离光源移动来响应照明质量和数量的波动的机制。分别在低浓度琼脂或琼脂糖平板上的光镜移动可以分别表示组织行为和单细胞运动性的宏观和微观尺度。在这里,我们描述了使用单细胞蓝细菌集胞藻的两种鳞片上的光趋化测定的详细程序。 PCC 6803。

背景 模型生物 Synechocystis sp。 PCC 6803使用伸缩型IV皮脂(T4P)以潮汐表面移动,称为抽动动力。两个分泌的ATP酶(PilB和PilT)负责扩增和缩回菌毛装置,从而将细胞向前拉。集胞藻 sp。 PCC 6803拥有覆盖整个可见光谱的各种光感受器。光的吸收可以根据波长和强度刺激正或负光趋向性。最近,已经证明,单细胞集胞藻 PCC 6803能够通过将光聚焦在远侧的尖锐焦点上来直接检测单向照明(Schuergers等人,2016)。此外,显示抽动运动的方向与运动ATPase PilB的特定近端定位相关(Schuergers等人,2015)。提出了一种模型,即聚焦导致对运动装置的局部抑制,从而确定单个细胞作为远离焦点的光电响应的移动方向(Schuergers等人,2016) )。

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