| Using Seed Chipping to Genotype Maize Kernels
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Author:
Date:
2020-03-20
[Abstract] Zea mays (maize) is an important model organism for studying monocot growth and development. Genotyping maize in the greenhouse or field can be time consuming and costly. Here, we describe a method to remove or chip a small amount of the endosperm from a maize kernel to genotype the kernel prior to planting. The seed chip is removed with a razor blade for DNA extraction and subsequent genotyping. When done correctly, seeds germinate normally and the kernel genotype can be determined before planting thus saving time, money, and field space.
[摘要] [摘要] 玉米玉米（玉米） 是一种重要的模式生物的研究单子叶植物的生长和发育。基因分型玉米中的温室或字段可以是时间消耗和昂贵的。在这里，我们描述了一个方法来去除或芯片一个小数额的的胚乳从一个玉米的内核，以基因型 该内核之前以种植。所述种子芯片被除去与一个剃刀刀片用于DNA 提取和随后的基因分型。当完成正确，种子发芽正常，并在内核基因型可以被确定之前播种从而节省了时间，金钱，和现场的空间。
[背景 ] 玉米是一个农业重要的作物是被种植在整个的世界。它具有许多用途，包括人类消费，动物饲料，和乙醇生产（Ranum 等人，2014） 。玉米是也是一个有用的模型用于研究一个宽范围的生物学问题，包括植物驯化，单子叶植物的生长和发育，病虫害抗性，以及基因组进化（Strable 和斯坎伦，2009） 。尽管玉米有许多科学和工业用途，这是一个大工厂是需要显著空间中任意一个温室或田间到增长。在除了对所述成本的保持一个温室或田间，相当大的努力是需要以执行涉及交叉和收集植物材料用于基因分型和其他分析。由于到这些因素，将能以基因型玉米内核之前以种植是有价值的。这个协议描述的过程的种子碎裂，其中一个小片的胚乳被除去与一个剃刀刀片以被用于对DNA 提取和基因分型。这个协议是一个修饰的一个方法，其中内核是浸泡在水中之前到碎裂（高等人，2008） ...
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| Analysis of Metals in Whole Cells, Thylakoids and Photosynthetic Protein Complexes in Synechocystis sp. PCC6803
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Date:
2018-06-20
[Abstract] Metals are essential in many biological processes, including oxygenic photosynthesis. Here we described a method to measure the metal pool in whole cells and thylakoids, including the bioactive pool in intact photosynthetic protein complexes in the model oxygenic cyanobacterium Synechocystis PCC6803. In the first part of the protocol, whole cells and thylakoid membranes are carefully prepared, in which the total metal concentrations are measured by inductively coupled plasma triple-quadrupole mass spectrometry (ICP-QQQ-MS). In the second part of the protocol, isolated thylakoids are ...
[摘要] 金属在许多生物过程中是必不可少的，包括含氧光合作用。 在这里我们描述了测量全细胞和类囊体中金属库的方法，包括模型含氧蓝藻PCH6803中完整光合蛋白复合体中的生物活性库。 在方案的第一部分中，仔细制备全细胞和类囊体膜，其中通过电感耦合等离子体三重四极杆质谱（ICP-MS / MS）测量总金属浓度。 在该方案的第二部分，分离的类囊体被溶解以释放完整的膜蛋白和金属结合蛋白复合物。 将这些完整的光合蛋白复合物进行尺寸排阻色谱（SEC），并通过ICP-MS / MS进行连接分析尺寸分离的复合物中的金属结合。
【背景】氧光合作用的过程需要金属，因为它们在光合电子传递链中作为辅因子和催化剂的基本功能。光合装置需要Fe-S簇，血红素桥Fe和非血红素Fe形式的铁（Fe），可溶性移动电子载体蛋白质质体蓝素中的铜（Cu），叶绿素中的镁（Mg）， ...
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| Small-scale DNA Extraction Method for Maize and Other Plants
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Author:
Date:
2018-03-20
[Abstract] Corn, or maize, is a major cereal crop and model monocot. Two of its benefits are ease of pollination and tractable genetics. For a comparison of development between maize and the dicot model, Arabidopsis, see Lunde and Hake, 2005. For an example of how this protocol might be used for a double mutant analysis see Lunde and Hake, 2009. Here, we provide a protocol for easy DNA extraction without phenol or chloroform. Therefore, this protocol is suitable for use in schools or laboratories that lack fume hoods.
[摘要] 玉米或玉米是主要的谷类作物和模式单子叶植物。 它的两个好处是易于授粉和易处理的遗传。 为了比较玉米和双子叶植物模型之间的发育，拟南芥参见Lunde和Hake，2005。关于该方案如何用于双突变体分析的例子参见Lunde和Hake，2009。 在这里，我们提供了一个简单的DNA提取方案，无需苯酚或氯仿。 因此，该协议适用于缺乏通风橱的学校或实验室。
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