| Assay for Assessing Mucin Binding to Bacteria and Bacterial Proteins
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Author:
Date:
2021-03-05
[Abstract] Legionella pneumophila, a Gram-negative bacterium and the causative agent of Legionnaires’ disease, exports over 300 effector proteins/virulence factors, through its type II (T2SS) and type IV secretion systems (T4SS). One such T2SS virulence factor, ChiA, not only functions as a chitinase, but also as a novel mucinase, which we believe aids ChiA-dependent virulence during lung infection. Previously published protocols manipulated wild-type L. pneumophila strain 130b and its chiA mutant to express plasmid-encoded GFP. Similarly, earlier studies demonstrated that wheat germ agglutinin ...
[摘要] [摘要]嗜肺军团杆菌是革兰氏阴性细菌，是军团菌病的病原体，通过其II型（T2SS）和IV型分泌系统（T4SS）出口了300多种效应蛋白/毒力因子。一种这样的T2SS毒力因子ChiA不仅起几丁质酶的作用，而且还起新型粘蛋白酶的作用，我们认为它可以在肺部感染期间帮助ChiA依赖性毒力。以前发表的协议操纵野生型肺炎嗜血杆菌130b菌株及其chiA突变体，以表达质粒编码的GFP。同样，较早的研究表明，小麦胚芽凝集素（WGA）可以进行荧光标记，并可以与粘蛋白结合。 在当前方案中，将GFP标记的细菌与II型和III型猪胃粘蛋白孵育，然后用TexasRed标记的WGA进行标记，并通过流式细胞术进行分析，以测量在有或没有HLA的情况下细菌与粘蛋白的结合。内源性ChiA。另外，我们分析了纯化的ChiA与II型和III型猪胃粘蛋白的结合。该方案将细菌和直接蛋白结合到粘蛋白上，并且是第一个使用WGA和流式细胞术分析革兰氏阴性细菌与粘蛋白结合的方法。
图形摘要：
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评估细菌和蛋白质与粘蛋白结合的策略
[背景技术]嗜肺军团菌（LPN ），革兰氏阴性细菌，是军团病，肺炎的严重形式的病原体。L ...
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| Analysis of Metals in Whole Cells, Thylakoids and Photosynthetic Protein Complexes in Synechocystis sp. PCC6803
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Author:
Date:
2018-06-20
[Abstract] Metals are essential in many biological processes, including oxygenic photosynthesis. Here we described a method to measure the metal pool in whole cells and thylakoids, including the bioactive pool in intact photosynthetic protein complexes in the model oxygenic cyanobacterium Synechocystis PCC6803. In the first part of the protocol, whole cells and thylakoid membranes are carefully prepared, in which the total metal concentrations are measured by inductively coupled plasma triple-quadrupole mass spectrometry (ICP-QQQ-MS). In the second part of the protocol, isolated thylakoids are ...
[摘要] 金属在许多生物过程中是必不可少的，包括含氧光合作用。 在这里我们描述了测量全细胞和类囊体中金属库的方法，包括模型含氧蓝藻PCH6803中完整光合蛋白复合体中的生物活性库。 在方案的第一部分中，仔细制备全细胞和类囊体膜，其中通过电感耦合等离子体三重四极杆质谱（ICP-MS / MS）测量总金属浓度。 在该方案的第二部分，分离的类囊体被溶解以释放完整的膜蛋白和金属结合蛋白复合物。 将这些完整的光合蛋白复合物进行尺寸排阻色谱（SEC），并通过ICP-MS / MS进行连接分析尺寸分离的复合物中的金属结合。
【背景】氧光合作用的过程需要金属，因为它们在光合电子传递链中作为辅因子和催化剂的基本功能。光合装置需要Fe-S簇，血红素桥Fe和非血红素Fe形式的铁（Fe），可溶性移动电子载体蛋白质质体蓝素中的铜（Cu），叶绿素中的镁（Mg）， ...
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| Protocol for RYMV Inoculation and Resistance Evaluation in Rice Seedlings
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Author:
Date:
2018-06-05
[Abstract] Rice yellow mottle virus (RYMV), a mechanically transmitted virus that causes serious damage to cultivated rice plants, is endemic to Africa. Varietal selection for resistance is considered to be the most effective and sustainable management strategy. Standardized resistance evaluation procedures are required for the identification and characterization of resistance sources. This paper describes a protocol for mechanical inoculation of rice seedlings with RYMV and two methods of resistance evaluation – one based on a symptom severity index and the other on virus detection through ...
[摘要] 非洲特有的稻黄斑驳病毒（RYMV）是一种机械传播的病毒，对栽培稻株造成严重损害。 品种抗性选择被认为是最有效和可持续的管理策略。 需要标准化的阻力评估程序来识别和表征阻力源。 本文介绍了利用RYMV机械接种水稻幼苗的方案，以及两种抗性评估方法 - 一种基于症状严重性指数，另一种基于双抗体夹心酶联免疫吸附试验（DAS-ELISA）进行病毒检测。
【背景】RYMV是非洲水稻生产的主要生物限制因素（Séréet al。，2013），在非洲和马达加斯加的大多数水稻生产国都有报道。它不能通过种子传播（Konaté等人，2001; Allarangaye等人，2006），而是通过昆虫载体（特别是甲虫）和农业作业期间的接触传播Bakker，1974;Traoré等人，2006），尤其是在将苗床的苗移植到田间时。该病毒非常稳定，能够在大米和野生禾本科（Bakker，1974）宿主中以高浓度繁殖。
监测苗床RYMV发病率和品种选择是管理RYMV最有效和可持续的方式。存在两种表型的抗性 - 部分抗性，其特征在于症状出现延迟（Albar等人，1998）和高抗性，其特征在于使用DAS-ELISA不存在病毒检测（Ndjiondjop et al。，1999）。虽然部分抗性在水稻品种中广泛分布，但栽培水稻品种仅有少数品种O.水稻和 O。 glaberrima ...
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