| Determination of the Cellular Ion Concentration in Saccharomyces cerevisiae Using ICP-AES
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Author:
Date:
2020-08-20
[Abstract] The yeast Saccharomyces cerevisiae has been perceived over decades as a highly valuable model organism for the investigation of ion homeostasis. Indeed, many of the genes and biological systems that function in yeast ion homeostasis are conserved throughout unicellular eukaryotes to humans. In this context, measurement of the yeast cellular ionic content provides information regarding yeast response to gene deletion or exposure to chemicals for instance. We propose here a protocol that we tested for the analysis of 12 elements (Ba2+, Ca2+, Cd2+, Co2+ ...
[摘要] [摘要] 酵母酿酒酵母已被感知了几十年，作为离子稳态的调查一个非常有价值的模型生物。实际上，在整个酵母的单细胞真核生物中，在酵母离子稳态中起作用的许多基因和生物系统都是保守的。在这种情况下，酵母细胞离子含量的测量提供了有关酵母对例如基因缺失或暴露于化学物质的反应的信息。我们在这里提出一种测试过的协议，用于分析12种元素（Ba 2 + ，Ca 2 + ，Cd 2 + ，Co 2 + ，Cu 2 + ，Fe 2 + ，K 2 + ，Mg 电感耦合等离子体原子发射光谱法（ICP-AES）测定酵母中的2 + ，Mn 2 + ，Na + ，Ni 2 + ，Zn 2+ ）。这项技术能够确定一个生物样品中许多离子的细胞含量。
[背景 ] 酵母已被广泛用于研究基因缺失，细胞外环境的修改，或异源蛋白的生产，例如后的离子响应。在这种情况下，具有监测酵母细胞离子状态的方法是非常重要的。ICP-AES使用来自惰性气体（如氩气）的高能等离子体非常快速地燃烧分析物。从分析物发出的颜色表示存在的元素，光谱信号的强度表示这些元素的浓度。与其他技术（例如分光光度法，原子吸收光谱法和原子荧光光谱法）相比，ICP-AES是一种多离子分析方法，涉及简单且快速的过程，且检测限相对较低（Dahlquist和Knoll，1978年）。此处描述的方法适用于Ba 2 + ，Ca 2 + ，Cd 2 + ...
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| Protocol for the Isolation and Super-resolution dSTORM Imaging of RyR2 in Cardiac Myocytes
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Author:
Date:
2018-08-05
[Abstract] Since its inception, super-resolution microscopy has played an increasingly important role in the discovery and characterization of nanoscale biological structure. dSTORM, which is one of the most commonly applied methods, relies on stochastic photoswitching of fluorophores to recreate a super-resolution image. The cardiac field has particularly benefitted from the application of this technique, as it has enabled sub-diffraction-limit visualization of calcium release units (CRUs) and the fundamental structures that trigger contraction. Acquisition of such images requires careful, reproducible ...
[摘要] 自成立以来，超分辨率显微镜在纳米级生物结构的发现和表征中发挥着越来越重要的作用。 dSTORM是最常用的方法之一，它依赖于荧光团的随机光切换来重建超分辨率图像。心脏场特别受益于该技术的应用，因为它已经实现了钙释放单元（CRU）的子衍射极限可视化和触发收缩的基本结构。获取这些图像需要仔细，可重复的样品制备，并且在实验期间保持一致的成像条件。在这里，我们提出了生产心肌细胞中Ca 2 + 释放通道Ryanodine Receptor type-2（RyR2）的dSTORM图像的标准化方法。所提出的方案特别关注涉及原发性心肌细胞分离，样品制备和成像的步骤，其中提供了针对实验溶液和显微镜设置的细节。本讨论之后是各种分析技术的概述，以识别集群和CRU中的RyR2组织
【背景】近年来，超分辨率显微镜的普及率迅速提高。已经描述了各种超分辨率技术，其使光学分辨率远低于光的衍射极限，在某些情况下接近可通过电子显微镜获得的光学分辨率。总之，这些技术的出现导致了纳米级生物结构，结构域和蛋白质相互作用的新研究的爆炸式增长。一种流行的超分辨率技术是直接随机光学显微镜（dSTORM），与标准共聚焦显微镜相比，它将相对简单的样品处理的优势与分辨率提高了约10倍（van de Linde ...
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| Crude Preparation of Lipopolysaccharide from Helicobacter pylori for Silver Staining and Western Blot
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Author:
Date:
2017-10-20
[Abstract] This protocol provides an easy and rapid method to prepare lipopolysaccharide from the gastric pathogen Helicobacter pylori for visualization on acrylamide gels by silver staining and for detecting the presence of Lewis antigens by Western blot. The silver staining is a four-step procedure, involving a 20 min-oxidation step, a 10 min-silver staining step, a 2-10 min color development step and finally a 1-min color termination step. Lipopolysaccharide from H. pylori wild-type and corresponding mutants analyzed by this method are described in a recent publication (Li et al. ...
[摘要] 该方案提供了一种从胃病原幽门螺杆菌制备脂多糖的简便快速方法，用于通过银染显示丙烯酰胺凝胶，并通过Western印迹检测Lewis抗原的存在。 银染是四步法，包括20分钟氧化步骤，10分钟银染色步骤，2-10分钟显色步骤，最后是1分钟颜色终止步骤。 来自H的脂多糖。 在最近的出版物（Li等人，2017）中描述了通过该方法分析的野生型和相应的突变体的幽门螺杆菌。 这种用于银染的LPS的粗制剂也适用于其他革兰氏阴性细菌。
【背景】脂多糖（LPS）是一种大而可变的复合糖脂，其组成了大多数革兰氏阴性细菌外膜的外叶。 它通常由三个结构域组成：称为脂质A（或内毒素）的疏水结构域，其嵌入外膜中; 相对保守的非重复核 - 低聚糖; 和从细胞延伸到外部环境的可变O-抗原。 H的独特功能。 幽门螺杆菌脂多糖O抗原是模拟人Lewis抗原的岩藻糖基化寡糖结构的存在。 从革兰氏阴性细菌大规模提取高纯度的LPS是劳动密集型和耗时的。 在这里，在这个协议中，我们详细地描述了使用来自胃病原幽门螺杆菌的容易和快速的粗制备制剂用于通过银染和Lewis抗原通过蛋白质印迹进行表达。
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