| Live Cell Imaging of Male Meiosis in Arabidopsis by a Landmark-based System
|
|
Author:
Date:
2020-05-05
[Abstract] Live cell imaging has tremendously promoted our understanding of cellular and subcellular processes such as cell division. Here, we present a step-by-step protocol for a robust and easy-to-use live cell imaging approach to study male meiosis in the plant Arabidopsis thaliana as recently established. Our method relies on the concomitant analysis of two reporter genes that highlight chromosome configurations and microtubule dynamics. In combination, these reporter genes allowed the discrimination of five cellular parameters: cell shape, microtubule array, nucleus position, nucleolus ...
[摘要] [摘要 ] 活细胞成像极大地促进了我们对细胞分裂等亚细胞过程的了解。在此，我们提出了一种循序渐进的方案，以一种可靠且易于使用的活细胞成像方法来研究雄性减数分裂。植物拟南芥。由于最近建立了我们的方法依赖于伴随分析中的两个报告基因，突出染色体构和微管动态组合，这些记者基因准许入住歧视五细胞参数：细胞形状，微管阵列，核POSITI 在，核仁位置，染色质凝聚，这些参数可以采用不同的国家，例如，该核位置可以是中央或外侧。分析如何紧密这些国家有关联产生了里程碑阶段，反过来允许定量和定性的解剖减数分裂过程我们设想，这种方法还可以为细胞分化分析提供有价值的标准 减数分裂之外的增强过程。
[背景 ] 减数分裂是一种特殊的细胞分裂周期，有两个主要目的：首先，减数分裂母细胞的DNA含量降低一半，在二倍体生物体中会导致单倍体减数分裂产物。有性繁殖的生物，以便在受精过程中融合了两个配子后，恢复了原始的基因组大小。其次，减数分裂通过亲本染色体（同源染色体或短同源）之间的DNA片段交换（称为减数分裂重组）促进了遗传多样性。通过生成新的但完整的染色体集，其中每个染色体随机存在母亲或父亲的同系物（如果是二倍体生物体）。因此，减数分裂对于不同领域的研究很有趣，从细胞生物学和生殖生物学，从遗传学到进化生物学（Wijn ker 和Schnittger ，2013； Mercier ...
|
|
|
| Implementation of Blue Light Switchable Bacterial Adhesion for Design of Biofilms
|
|
Author:
Date:
2018-06-20
[Abstract] Control of bacterial adhesions to a substrate with high precision in space and time is important to form a well-defined biofilm. Here, we present a method to engineer bacteria such that they adhere specifically to substrates under blue light through the photoswitchable proteins nMag and pMag. This provides exquisite spatiotemporal remote control over these interactions. The engineered bacteria express pMag protein on the surface so that they can adhere to substrates with nMag protein immobilization under blue light, and reversibly detach in the dark. This process can be repeatedly turned on ...
[摘要] 在空间和时间上高精度地控制细菌粘附到基底对于形成明确的生物膜是重要的。 在这里，我们提出了一种方法来设计细菌，使其在蓝光下通过光可切换蛋白质nMag和pMag特异性地粘附在基底上。 这为这些交互提供了精妙的时空遥控。 工程菌在表面上表达pMag蛋白，以便它们可以在蓝光下与nMag蛋白固定化的基质粘附，并在黑暗中可逆地分离。 该过程可以重复开启和关闭。 此外，通过在细菌表面表达不同的pMag蛋白质并改变光强度可以调节细菌粘附性质。 该协议提供了可高度空间和时间分辨率的细菌粘附的光可切换，可逆和可调控制，这使我们能够以极大的灵活性在基底上图案化细菌。
【背景】控制生物膜形成对于了解细菌在自然发生的生物膜中的社会相互作用至关重要（Flemming et。，2016）。这对生物膜在生物催化，生物传感和废物处理中的生物技术应用也特别重要（Zhou等人，2013; Jensen等人，2016）。生物膜的形成始终始于细菌与底物的粘附，这决定了生物膜中的空间组织（Liu等人，2016; Nadell等人，2016）。已经提出了许多策略来控制细菌粘附，例如通过脂质体融合利用生物正交反应基团修饰细菌表面（Elahipanah等，2016），将粘附分子固定在基质上（Sankaran等，等），2015; Zhang等人，2016; ...
|
|
|
| Visualising Differential Growth of Arabidopsis Epidermal Pavement Cells Using Thin Plate Spline Analysis
|
|
Author:
Date:
2016-11-20
[Abstract] Epidermal pavement cells in Arabidopsis leaves and cotyledons develop from relatively simple shapes to form complex cells that have multiple undulations of varying sizes. Analyzing the growth of individual parts of the cell wall boundaries over time is essential to understanding how pavement cells develop their complex shapes. Thin plate spline analysis is a method for visualizing the change of size and shape of objects through warping or deformation of a regular mesh and can be applied to understand cell wall growth. This protocol describes the application of thin plate spline ...
[摘要] 拟南芥叶和子叶中的表皮铺路细胞从相对简单的形状发育而形成具有不同大小的多个起伏的复合细胞。分析细胞壁边界的各个部分随时间的生长对理解铺路细胞如何发展其复杂形状是至关重要的。薄板样条分析是通过规则网格的翘曲或变形来可视化物体的尺寸和形状的变化的方法，并且可以用于理解细胞壁生长。该协议描述了薄板样条分析的应用，以便随时间可视化单个路面细胞的发育。
[背景] 了解细胞生长的空间模式提供了洞察植物细胞如何形成不同的形状。拟南芥子叶和叶的表皮铺路细胞是用于研究复杂细胞如何生长的良好模型系统，因为它们的细胞壁边界从最初为简单弧的边界开始形成不同大小的多个起伏（Armor et al。，2015; Fu et al。，2005）。通过将外部施加的标记物固定到细胞例如藻类氮细胞节间（Green等人，1970），根细胞（Shaw等人， ，2000）和毛状体（Schwab等人，2003）。然而，从外部施加的界标测量细胞生长有时是不可行的，例如当外部施加的荧光标记物的强荧光会遮蔽细胞内荧光标记的细胞骨架元件时（Armor等人，2015）。显示定义数量的同源界标随时间或在不同物体之间的变化位置的薄板样条分析先前已用于分析诸如人类头骨的物体的三维大小和形状的变化（Rosas和Bastir，2002; Gunz ，2014）和叶子（Polder et al ...
|
|
|