| Nab Escaping AAV Mutants Isolated from Mouse Muscles
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Author:
Date:
2018-05-05
[Abstract] Neutralizing antibodies (Nabs) are a major challenge in clinical trials of adeno-associated virus (AAV) vector gene therapy, because Nabs are able to inhibit AAV transduction in patients. We have successfully isolated several novel Nab-escaped AAV chimeric capsids in mice by administrating a mixture of AAV shuffled library and patient serum. These AAV chimeric capsid mutants enhanced Nab evasion from patient serum with a high muscle transduction efficacy. In this protocol, we describe the procedures for selection of the Nab-escaped AAV chimeric capsid, including isolation and characterization ...
[摘要] 中和抗体（Nabs）是腺相关病毒（AAV）载体基因治疗的临床试验中的主要挑战，因为Nab能够抑制患者中的AAV转导。 我们已经成功地分离了几种新型Nab逃逸的AAV嵌合衣壳，通过给予AAV混洗库和患者血清的混合物。 这些AAV嵌合衣壳突变体增强了来自患有高肌肉转导功效的患者血清的Nab逃避。 在该协议中，我们描述了选择Nab逃逸的AAV嵌合衣壳的程序，包括在小鼠肌肉中分离和鉴定Nab逃逸的AAV突变体。
【背景】腺相关病毒（AAV）载体已被用于许多临床前研究和临床试验。使用AAV基因疗法已经接受了许多疾病的最终治疗。然而，在未来的临床试验中，循环中的中和抗体的存在对AAV载体的应用提出了主要挑战。已经探索过许多方法来逃避Nab的活动。在此，我们描述了从AAV改组库中选择Nab逃逸突变体的定向进化方法。
DNA改组是产生不同突变体的强大策略。通过连续几轮的表型选择，DNA改组文库的特点是质量更高，目标多样化。来自AAV改组文库的衣壳突变体的高通量选择已被用作探索具有靶向特定组织和逃避Nabs的能力的AAV突变体的有前途的策略。然而，大多数这些选择方法只是在体外测试;一些研究甚至使用了兔抗AAV2血清或人静脉注射免疫球蛋白。体内选择衣壳突变体的方法可以提供产生更有效的AAV突变体的平台，所述AAV突变体不仅从患者血清中逃脱Nab，而且增强特定组织中的转导。 ...
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| Transfer of Large Contiguous DNA Fragments onto a Low Copy Plasmid or into the Bacterial Chromosome
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Author:
Date:
2016-11-20
[Abstract] Bacterial pathogenicity islands and other contiguous operons can be difficult to clone using conventional methods due to their large size. Here we describe a robust 3-step method to transfer large defined fragments of DNA from virulence plasmids or cosmids onto smaller autonomously replicating plasmids or directly into defined sites in the bacterial chromosome that incorporates endogenous yeast and λ Red homologous recombination systems. This methodology has been successfully used to isolate and integrate at least 31 kb of contiguous DNA and can be readily adapted for the recombineering of E. ...
[摘要] 由于其大尺寸，细菌致病性岛和其它连续操纵子可能难以使用常规方法克隆。在这里我们描述了一个强大的3步法从毒力质粒或粘粒转移大型定义的片段到更小的自主复制质粒或直接到细胞染色体，并入内源性酵母和λ红色同源重组系统的定义网站。该方法已经成功地用于分离和整合至少31kb的连续DNA，并且可以容易地适应于E的重组。大肠杆菌及其近亲。
[背景] 分离和繁殖大片DNA的能力大大扩展了基因网络和操纵子的研究。然而，用于该目的的传统使用的工程质粒，例如细菌人工染色体（BAC），虽然极其有用，但是受到DNA稳定性，拷贝数和复杂装配要求的问题的限制。或者，将构建体直接并入细菌染色体中通过减少由于存在多个基因拷贝引起的基因表达的变化以及确保基因的稳定维持而提供了优点，同时还避免了对抗生素选择的需要。这里描述的方法最初被设计为捕获和转移编码Shigella flexneri 3型分泌系统的31kb DNA操纵子到大肠杆菌染色体上（Reeves ...
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