| Validating Candidate Congenital Heart Disease Genes in Drosophila
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Author:
Date:
2017-06-20
[Abstract] Genomic sequencing efforts can implicate large numbers of genes and de novo mutations as potential disease risk factors. A high throughput in vivo model system to validate candidate gene association with pathology is therefore useful. We present such a system employing Drosophila to validate candidate congenital heart disease (CHD) genes. The protocols exploit comprehensive libraries of UAS-GeneX-RNAi fly strains that when crossed into a 4XHand-Gal4 genetic background afford highly efficient cardiac-specific knockdown of endogenous fly orthologs of human genes. A ...
[摘要] 基因组测序工作可能涉及大量基因和从头突变作为潜在的疾病风险因素。 因此，用于验证候选基因与病理学关联的高通量体内模型系统是有用的。 我们提出了使用果蝇来验证候选先天性心脏病（CHD）基因的这种系统。 这些方案利用了UAS-GeneX-RNAi飞行菌株的综合文库，当跨越4XHand-Gal4遗传背景时，提供了人类基因内源性直向同源物的高效心脏特异性敲低。 一组定量测定评估多种心脏参数的表型严重程度。 这些包括发育致死率，幼虫和成人心脏形态以及成年人的长寿。 这些方案最近被用于评估患者全外显子测序所涉及的100多个候选CHD基因（Zhu等，2017）。
【背景】（Bier和Bodmer，2004; Cagan，2011; Zhang et al。，2013; Owusu-Ansah和Perrimon，2014; Diop和Bodmer，2015; Na et al。等等，2015），75％的人类疾病相关基因由飞行基因组中的功能同系物表示（Reiter et al。，2001）。尽管将果蝇发育表型直接与患者症状联系起来是一个挑战，果蝇可以作为一个非常复杂和有效的平台来测试和验证候选疾病基因功能在开发中，这可以很容易地扩大到评估大量的候选基因从患者基因组测序工作中确定。基于进化保守的心脏发育遗传机制，果蝇已被用于研究与冠心病相关20多年的基因（Bier和Bodmer，2004; ...
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| An Acute Mouse Spinal Cord Slice Preparation for Studying Glial Activation ex vivo
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Author:
Date:
2017-01-20
[Abstract] Pathological conditions such as amyotrophic lateral sclerosis, spinal cord injury and chronic pain are characterized by activation of astrocytes and microglia in spinal cord and have been modeled in rodents. In vivo imaging at cellular level in these animal models is limited due to the spinal cord’s highly myelinated funiculi. The preparation of acute slices may offer an alternative and valuable strategy to collect structural and functional information in vitro from dorsal, lateral and ventral regions of spinal cord. Here, we describe a procedure for preparing acute slices ...
[摘要] 病理状况如肌萎缩性侧索硬化，脊髓损伤和慢性疼痛的特征在于脊髓中星形胶质细胞和小胶质细胞的活化，并已在啮齿动物中建模。 在这些动物模型中的细胞水平的体内成像由于脊髓的高度髓鞘化的功能而受到限制。 急性切片的制备可能提供一种替代和有价值的策略，从脊髓的背侧，外侧和腹侧区域体外收集结构和功能信息。 在这里，我们描述了一种从小鼠脊髓制备急性切片的过程（Garréet al。，2016）。 这个准备应该进一步了解脊髓中的神经胶质细胞是如何急剧地反应各种炎症的挑战。
【背景】已经使用小鼠转基因技术来模拟影响脊髓的不同人类病态，其中许多特征为局部胶质激活，神经炎症的一个标志。利用基于激光扫描显微技术的共焦显微镜（White et al。，1987）和双光子显微镜（Denk等，1990），大大提高了对健康和疾病中胶质生物学的认识。 ）以无创的方式可视化活体动物中的细胞结构和亚细胞结构域;例如，表达遗传编码的记者或钙传感器的小鼠已被用于分别形成胶质结构（体细胞和过程）并研究钙动力学和信号传导（Davalos等人，2005; ...
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