| Investigating Localization of Chimeric Transporter Proteins within Chloroplasts of Arabidopsis thaliana
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Author:
Date:
2018-02-05
[Abstract] In this protocol, we describe a method to design chimeric proteins for specific targeting to the inner envelope membrane (IEM) of Arabidopsis chloroplasts and the confirmation of their localization by biochemical analysis. Specific targeting to the chloroplast IEM can be achieved by fusing the protein of interest with a transit peptide and an IEM targeting signal. This protocol makes it possible to investigate the localization of chimeric proteins in chloroplasts using a small number of transgenic plants by using a modified method of chloroplast isolation and fractionation. IEM ...
[摘要] 在这个协议中，我们描述了一种设计嵌合蛋白的方法，用于特异性靶向拟南芥叶绿体的内包膜（IEM）并通过生化分析确定它们的定位。 叶绿体IEM的特异性靶向可通过将感兴趣的蛋白质与转运肽和IEM靶向信号融合来实现。 这个协议使得有可能使用少量的转基因植物，通过使用修改的叶绿体分离和分离方法来研究嵌合蛋白在叶绿体中的定位。 嵌合蛋白的IEM定位可以通过胰蛋白酶消化和碱性提取进一步评估。 在此，称为SbtAII的嵌合碳酸氢根转运蛋白的定位通过使用针对葡萄球菌蛋白A的抗体进行蛋白质印迹来检测。该方案改编自上原等人，2016年
【背景】有人提出将蓝藻CO 2浓度机制整合到叶绿体中是改善C 3+植物光合作用的有希望的方法。 根据理论估计，将BicA和SbtA整合到叶绿体IEM中可以提高光合CO 2固定率。 我们研究了核编码的蓝细菌碳酸氢盐转运蛋白BicA和SbtA与拟南芥叶绿体的IEM的整合。 因此，我们制定了一个协议，设计嵌合构造为特定目标的IEM和调查嵌合蛋白在叶绿体中的定位。
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| Protease Activity Assay in Fly Intestines
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Author:
Date:
2017-09-20
[Abstract] The intestine is a central organ required for the digestion of food, the absorption of nutrients and for fighting against aggressors ingested along with the food. Impairment of gut physiology following mucosal damages impacts its digestive capacities that consequently will affect growth, wellbeing or even survival of the individual. Hence, the assessment of intestinal functions encompasses, among others, the monitoring of its integrity, its cellular renewing, its immune defenses, the production of enteroendocrine hormones and its digestive capacities. Here, we describe in detail how to assess ...
[摘要] 肠是消化食物所需的中枢器官，吸收营养物质，并与食物一起摄入的侵略者作斗争。 粘膜损伤后的肠道生理损伤影响其消化能力，从而影响个体的生长，健康甚至生存。 因此，肠功能的评估包括监测其完整性，细胞更新，免疫防御，肠内分泌激素的产生及其消化能力。 在这里，我们详细描述如何评估分泌在成年果蝇的肠腔中的蛋白酶的活性。 这种方法也可以用于幼虫肠。 本协议由“蛋白酶荧光检测试剂盒”（产品代码PF0100）中提出的Sigma-Aldrich公司的方案进行了改进和改进。
【背景】肠道受到诸如斋戒，禁食，化学物质，病原体，损伤等诸多压力的影响。肠道能够通过保持其体内平衡的生理平衡来克服这种压力。为了感知进入的压力并产生适应性的维持肠功能的答案，肠已经开发出强健和保守的机制，如局部先天免疫防御和组织再生（Royet和Charroux，2013; Bonfini等，2016）。然而，在某些情况下，肠道稳态的维持可能受到影响。例如，在老化期间，随着许多未成熟或分化不良的细胞的存在，组织稳态维持总体下降（Jasper，2015; ...
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| Heterochronic Pellet Assay to Test Cell-cell Communication in the Mouse Retina
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Author:
Date:
2017-02-05
[Abstract] All seven retinal cell types that make up the mature retina are generated from a common, multipotent pool of retinal progenitor cells (RPCs) (Wallace, 2011). One way that RPCs know when sufficient numbers of particular cell-types have been generated is through negative feedback signals, which are emitted by differentiated cells and must reach threshold levels to block additional differentiation of that cell type. A key assay to assess whether negative feedback signals are emitted by differentiated cells is a heterochronic pellet assay in which early stage RPCs are dissociated and labeled with ...
[摘要] 构成成熟视网膜的所有七种视网膜细胞类型都是由普通的多能视网膜祖细胞池（RPC）产生的（Wallace，2011）。已经产生足够数量的特定细胞类型的RPC知道的一种方式是通过负反馈信号，其由分化细胞发射并且必须达到阈值水平以阻止该细胞类型的额外分化。评估负反馈信号是否由分化细胞发出的关键测定是异源沉淀测定，其中早期RPC被解离并用BrdU标记，然后与20倍过量的解离的分化细胞混合。然后将组合的细胞再次聚集并在细胞膜上培养7-10天。在这段时间内，RPC将会分化，BrdU + RPC的命运可以使用细胞类型特异性标记进行评估。开发这种沉淀测定的研究人员最初表明，当两种细胞类型混合在一起时，新生儿RPC与胚胎RPC相比，在加速进度条件下产生杆（Watanabe和Raff，1990; Watanabe等，1997）。我们已经使用这种测定来证明我们发现作为视网膜神经节细胞（RGC）分化的负调节物的声刺猬（Shh）促进RPC增殖（Jensen和Wallace，1997; Ringuette等，2014）。最近我们修改了异质性沉淀测定法，以评估视网膜无长突细胞的反馈信号的作用，将转化生长因子β2（Tgfβ2）鉴定为负反馈信号，并将Pten作为Tgfβ2应答的调节剂（Ma et al。，2007 ; ...
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