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Gibson Assembly® Cloning Kit

公司名称: New England Biolabs
产品编号: E5510
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Production of Guide RNAs in vitro and in vivo for CRISPR Using Ribozymes and RNA Polymerase II Promoters
Author:
Date:
2017-02-20
[Abstract]  CRISPR/Cas9-mediated genome editing relies on a guide RNA (gRNA) molecule to generate sequence-specific DNA cleavage, which is a prerequisite for gene editing. Here we establish a method that enables production of gRNAs from any promoters, in any organisms, and in vitro (Gao and Zhao, 2014). This method also makes it feasible to conduct tissue/cell specific gene editing. [摘要]  CRISPR / Cas9介导的基因组编辑依赖于指导性RNA(gRNA)分子来产生序列特异性DNA切割,这是基因编辑的前提条件。在这里,我们建立了一种能够从任何启动子,任何生物体内和体外生产gRNA的方法(Gao和Zhao,2014)。该方法也可以进行组织/细胞特异性基因编辑。

背景 几乎所有报道的CRISPR介导的基因编辑病例都使用小核RNA如U6和U3 snRNA启动子的启动子来驱动体内生产gRNAs(Cong等人,2013; Mali等人,2013)。然而,U6和U3启动子有几个主要的局限性:1)它们是组成型活性的,不可调谐的; 2)它们缺乏细胞/组织特异性; 3)它们在许多生物体中没有明确定义; 4)U6需要G和U3需要A用于转录起始,从而限制目标选择; 5)由于缺乏商业RNA聚合酶III,它们不适合体外转录。不幸的是,构成大部分特征启动子的RNA聚合酶II启动子不能直接用于体内的gRNA生产,原因如下:1)RNA聚合酶II启动子的主要转录物经历广泛的加工如5'-端封端,3'末端聚腺苷酸化和拼接出内含子。一些修饰可能使设计的gRNA无功能。 2)将成熟的RNA分子转运到细胞质中;因此它们与位于细胞核中的预期目标物理分离。这就是为什么使用U6和U3 ...

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