| A Method for Extracting the Nuclear Scaffold from the Chromatin Network
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Author:
Date:
2018-04-20
[Abstract] Each cell contains many large DNA polymers packed in a nucleus of approx. 10 μm in diameter. With histones, these DNA polymers are known to form chromatins. How chromatins further compact in the nucleus is unclear but it inevitably depends on an extensive non-chromatin nuclear scaffold. Imaging of endogenous chromatin network and the complementary scaffold that support this network has not been achieved but biochemical and proteomic investigations of the scaffold can still provide important insights into this chromatin-organizing network. However, this demands highly inclusive and ...
[摘要] 每个细胞都含有许多大型DNA聚合物，其中包含大约一个核。直径10微米。用组蛋白，已知这些DNA聚合物形成染色质。染色质在核中如何进一步致密还不清楚，但它不可避免地依赖于广泛的非染色质核支架。内源性染色质网络的成像和支持该网络的互补支架尚未实现，但支架的生化和蛋白质组学研究仍然可以提供关于该染色质组织网络的重要见解。但是，这需要高度包容和可重复的提取核支架。我们最近开发了一个简单的协议，用于从染色质中释放脚手架组件。提取物的包容性由以下观察结果证实：当从核中提取时，剩余的核染色质被释放为延伸且通常平行的染色质纤维。基本上，该方案包括纯核的产生，用Triton X-100处理细胞核以产生包膜消耗的细胞核（TxN），并在含蔗糖的缓冲液中在500mM NaCl中提取细胞核。 TxN的这个组合提取被称为TxNE。
【背景】通过蛋白质和核糖核蛋白的复杂支架，染色质在细胞核中密集并动态地压缩。与细胞骨架网络不同（Fischer和Fowler，2015），对这种核支架的显微观察在技术上是具有挑战性的。这可能反映了每个细胞核内染色质的主导地位，支架与细胞核交织在一起。核的球形排列也对成像这种支架结构造成挑战。核支架的主要元素是核层（NL）（Gruenbaum和Foisner，2015）。 ...
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| Fluorometric Estimation of Glutathione in Cultured Microglial Cell Lysate
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Author:
Date:
2017-06-05
[Abstract] Glutathione is one of the major antioxidant defense components present in cells. It is predominantly present as reduced glutathione (GSH) and converted into oxidized glutathione (GSSG) while reducing the free radicals like hydroxyl ions (OH-). For the measurement of GSH and GSSG, o-phthalaldehyde (OPT) has been used as a fluorescent reagent. O-phthalaldehyde has an ability to react specifically with GSH at pH 8 and GSSG at pH 12 respectively. N-ethylmaleimide (NEM) has been used to prevent auto-oxidation of GSH during measurement of GSSG in the present protocol. The ...
[摘要] 谷胱甘肽是细胞中存在的主要抗氧化防御成分之一。它主要作为还原型谷胱甘肽（GSH）存在并转化为氧化型谷胱甘肽（GSSG），同时还可以减少自由基，如羟基离子（OH）。对于GSH和GSSG的测定，邻苯二甲醛（OPT）已被用作荧光试剂。邻苯二甲醛具有与pH8的GSH和pH12的GSSG特异性反应的能力。已经使用N-甲基马来酰亚胺（NEM）来在本方案中测量GSSG期间防止GSH的自动氧化。 Hissin和Hilf的原始方案被开发用于大鼠肝组织中的谷胱甘肽估计。目前的方案已经在Hissin和Hilf（1976）之后被标准化，用于估计培养的小胶质细胞裂解物中的谷胱甘肽，但它也可以用于其它哺乳动物细胞裂解物。在我们的实验中，相同的方案已被用于估计小鼠神经母细胞瘤细胞N2a的全细胞裂解物中的谷胱甘肽。
背景 该方法于1976年由Hissin和Hilf在分析生物化学方面出版（Hissin和Hilf，1976）。然而，有可用于准确检测GSH的方法;由于GSH容易氧化转化为GSSG，所以大多数方法给出过高的GSSG。 ...
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| Mouse CD8+ T Cell Migration in vitro and CXCR3 Internalization Assays
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Author:
Date:
2017-03-20
[Abstract] Chemokines are molecules that regulate the positioning of cells during homeostasis and inflammation. CXCL10 is an interferon-induced chemokine that attracts cells that express the chemokine receptor CXCR3 on their surface. CXCL10 expression is often induced upon inflammation and guides lymphocytes, such as T and NK cells, into the injured tissues. Notably, CXCL10 binding to CXCR3 induces receptor internalization and, therefore, low CXCR3 levels in cells positive for CXCR3 expression can be indicative of chemokine signaling.
Here, we describe an in vitro method to evaluate ...
[摘要] 趋化因子是调节体内平衡和炎症期间细胞定位的分子。 CXCL10是干扰素诱导的趋化因子，其吸引在其表面上表达趋化因子受体CXCR3的细胞。 CXCL10表达通常在炎症诱导并引导淋巴细胞如T和NK细胞进入受损组织。值得注意的是，CXCL10与CXCR3结合诱导受体内化，因此CXCR3表达阳性细胞中的CXCR3水平降低可能是趋化因子信号传导的指示。
＆nbsp;这里，我们描述体外方法来评估鼠CD8 + T细胞向重组鼠CXCL10迁移的能力;以及暴露于不同剂量的趋化因子后在T细胞表面测量CXCR3表达水平的流式细胞术测定。
背景 趋化因子介导的T细胞运输是稳态和炎症期间的重要过程。活化的CD8 + T细胞表达趋化因子受体，例如CXCR3，允许它们向趋化因子CXCL9,10和11迁移，通常在损伤组织上上调。调节T细胞迁移的分子线索的评估对于了解其功能背后的生物学非常重要，但是在体内运行的复杂机制有时难以去卷积。在这里，我们提供有关体外方法的详细信息，以评估CD8 + T细胞上的趋化因子功能，重点是CXCL10介导的化学吸引和CXCR3内化。我们使用可以容易地在体外扩增和活化的抗原特异性转基因CD8 +细胞，因此提供足够数量的表型相同的淋巴细胞（例如， ...
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