| Analysis of Xyloglucan Composition in Arabidopsis Leaves
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Author:
Date:
2017-10-05
[Abstract] Xyloglucan is one of the main components of the primary cell wall in most species of plants. This protocol describes a method to analyze the composition of the enzyme-accessible and enzyme-inaccessible fractions of xyloglucan in the model species Arabidopsis thaliana. It is based on digestion with an endoglucanase that attacks unsubstituted glucose residues in the backbone. The identities and relative amounts of released xyloglucan fragments are then determined using MALDI-TOF mass spectrometry.
[摘要] 木葡聚糖是大多数植物种类中主要细胞壁的主要成分之一。 该方案描述了一种分析拟南芥拟南芥中木葡聚糖的可酶酶和不可酶酶级分的组成的方法。 它是基于内切葡聚糖酶的消化，其攻击骨架中的未取代的葡萄糖残基。 然后使用MALDI-TOF质谱法测定释放的木葡聚糖片段的身份和相对量。
【背景】在许多开花植物中，木葡聚糖是主要细胞壁的主要成分，其在生长调节中起重要作用。顺序提取方案提供了分离不同木葡聚糖结构域的方法（Pauly et al。，1999）。一些木葡聚糖似乎被捕获在纤维素微原纤维内，而另一部分通过氢键结合到它们的表面。木葡聚糖的其余部分（可能大多数）占据了微原纤维之间的距离（Park和Cosgrove，2015）。可以通过细胞壁材料的直接内切葡聚糖酶消化来提取部分后来的木葡聚糖。然后可以通过碱处理释放大部分剩余的木葡聚糖。缺乏木葡聚糖外切糖苷酶的突变体的研究表明，这些酶与葡聚糖内切葡糖基酶/水解酶一起主要作用于酶易接近部分（Sampedro等人，2010;Günl和Pauly，2011;Günl ，2011; Sampedro等人，2012; Sampedro等人，2017）。消化拟南芥木葡聚糖与内切葡聚糖酶攻击未经取代的葡萄糖残基导致三个和四个葡萄糖亚基的混合物，可以通过MALDI-TOF质谱快速和容易地分析（Lerouxel等人， ...
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| Isolation and Analysis of Proteoglycans and Glycosaminoglycans from Archaeological Bones and Teeth
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Author:
Date:
2017-04-05
[Abstract] We have developed methods for isolating proteoglycans and glycosaminoglycans from archaeological bones and teeth. These methods have been previously published (Coulson-Thomas et al., 2015) and are described here in more detail. In the case of glycosaminoglycans, the method was a previously described method (Nader et al., 1999) which we optimized for archeological samples.
[摘要] 我们开发了从考古学骨骼和牙齿中分离蛋白聚糖和糖胺聚糖的方法。 以前已经公开了这些方法（Coulson-Thomas等人，2015），并且在这里更详细地描述。 在糖胺聚糖的情况下，该方法是先前描述的方法（Nader等人，1999），其针对考古样品进行了优化。
【背景】骨组织主要由矿物成分（羟基磷灰石）和由胶原，非胶原蛋白和蛋白聚糖（PG）组成的有机基质组成。 由于与羟基磷灰石紧密结合，细胞外基质蛋白和PG被保护免受死亡后温度和化学药剂的破坏作用。 然而，到目前为止，只有DNA和蛋白质已经从考古学骨骼中成功提取，因此我们开发了从考古学骨骼和牙齿中分离PG和糖胺聚糖（GAG）链的方法。 PGs和GAG在骨形态发生，体内平衡和退行性骨病中起主要作用，从考古骨骼分析这些分子将揭示有价值的古生物学信息。
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