| Measurements of Root Colonized Bacteria Species
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Author:
Date:
2021-04-05
[Abstract] Root-associated bacteria are able to influence plant fitness and vigor. A key step in understanding the belowground plant-bacteria interactions is to quantify root colonization by the bacteria of interest. Probably, genetic engineering with fluorescence markers is the most powerful way to monitor bacterial strains in plant. However, this could have some collateral problems and some strains can be challenging to label. In this sense, bacterial inoculation under properly controlled conditions can enable reliable and reproducible quantification of natural bacterial strains. In this protocol, we ...
[摘要] [摘要]根系相关细菌能够影响植物的健康和活力。理解地下植物与细菌相互作用的关键步骤是量化目标细菌的根定植。也许，用荧光标记基因工程是监测植物细菌菌株的最有力的方式，但是这可能有一些担保的问题，有些菌株可被有挑战性的标签。从这个意义上说，在适当控制的条件下接种细菌可以对天然细菌菌株进行可靠且可重复的定量。在此协议中，我们描述了用于定量根相关细菌的详细程序。此方法适用于非侵略性样本处理编 形态鉴定和基于PCR的遗传指纹图谱。这种易于遵循的方案适用于研究在人工培养基或土壤中生长的植物的细菌定植。
[背景] ：植物中天然活与在根际，这是指土壤附着在根的薄层各种土壤细菌。虽然有些根瘤菌对植物没有可观察到的作用，但其他根瘤菌是引起有害作用的病原体或促进植物活力的生长性根瘤菌（PGPR）（Mendes等人，2013; Olanrewaju等人，2019）。细菌病原体或PGPR影响植物生长的能力与其细菌根定殖水平紧密相关。因此，细菌根定殖的研究是了解地下植物与细菌相互作用的重要踏脚石。
可以通过可视化荧光信号来评估细菌菌株的丰度，方法是对其进行修饰以表达编码诸如GFP的荧光蛋白的转基因标记基因（Rochat等，2010; Krzyzanowska等，2012; Saad等，2018）。 ...
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| Quantification of Root Colonizing Bacteria
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Author:
Date:
2018-07-20
[Abstract] Here we describe a simple method to quantify the number of viable bacteria (e.g., Enterobacter sp. SA187) that colonize the root system of Arabidopsis thaliana.
[摘要] 在这里，我们描述了一种简单的方法来量化活菌的数量（例如， Enterobacter sp。SA187），它们定殖于拟南芥的根系。。
【背景】接种细菌对根的定殖是有益细菌与宿主植物之间相互作用的重要步骤。 肠杆菌 sp。 SA187是一种内生细菌，已从土着沙漠植物 Indigofera argentea 的根瘤中分离出来（Andrés-Barrao et al。，2017; Lafi et al。 ，2017）。 SA187在不同的非生物胁迫（如盐度，干旱或高温）下促进模式植物拟南芥的生长，证明了作为植物生长促进细菌（PGPR）用于提高非生物抗性和产量的重要潜力。干旱地区的农作物SA187可以定殖 A的根和芽。在½MS琼脂平板或土壤中的拟南芥（deZélicourt et al。，2018）。跟踪接种菌株SA187在非寄主植物 A上的命运。 thaliana ，我们应用了常规的培养依赖方法。该方案已成功用于抵抗 A的根和芽的细菌数量。拟南芥植物在不同的非生物胁迫下（deZélicourt et al。，2018）。
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| Rapid Isolation of Total Protein from Arabidopsis Pollen
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Date:
2017-04-20
[Abstract] Arabidopsis pollen is an excellent system for answering important biological questions about the establishment and maintenance of cellular polarity and polar cell growth, because these processes are amenable to the genetic and genomic approaches that are readily available in Arabidopsis. Given that proteins are the direct executors of a wide variety of cellular processes, it is important to rapidly and efficiently isolate total protein for various protein-based analyses, such as Western blotting, co-immunoprecipitation and mass spectrometry, among others. Here we present a ...
[摘要] 拟南芥花粉是用于回答关于细胞极性和极性细胞生长的建立和维持的重要生物学问题的优秀系统，因为这些方法适用于在中容易获得的遗传和基因组方法， 拟南芥。 鉴于蛋白质是各种细胞过程的直接执行者，重要的是快速有效地分离各种基于蛋白质的分析的总蛋白质，例如Western印迹，共免疫沉淀和质谱等。 在这里，我们提出了一种从拟南芥花粉中快速分离总蛋白的方案，该方法是从我们最近发表的论文（Chang and Huang，2015）中得到改编的。
花粉是性繁殖植物生命周期的关键阶段。花粉萌发和随后的管生长提供了两个非活动精子细胞在开花植物中进行双重受精的通道。花粉通常被用作解决基本细胞生物学问题的示范系统，例如细胞极性和极细胞生长的建立和维持，以及肌动蛋白细胞骨架的结构和功能（Chen等人， ，2009; Qu等人，2015）。通常来自百合和烟草的花粉由于粒度大而被广泛使用，这使得它们在显微镜下容易收集和观察。相比之下，拟南芥花粉小，收集大量花粉以分离足够量的蛋白质以进行下游分析（如Western印迹和质谱法）相对困难。因此，开发快速分离总拟蛋白质拟南芥花粉的方案将有助于相关分析。
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