| Selective Isolation of Retroviruses from Extracellular Vesicles by Intact Virion Immunoprecipitation
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Author:
Date:
2018-09-05
[Abstract] There exists a wide variety of techniques to isolate and purify viral particles from cell culture supernatants. However, these techniques vary greatly in ease of use, purity, yield and impact on viral structural integrity. Most importantly, it is becoming evident that secreted extracellular vesicles (EVs) co-purify with retroviruses using nearly all purification methods due to nearly indistinguishable biophysical characteristics such as size, buoyant density and nucleic acid content. Recently, our group has illustrated a means of isolating intact and highly enriched retroviral virions from ...
[摘要] 存在多种从细胞培养上清液中分离和纯化病毒颗粒的技术。然而，这些技术在易用性，纯度，产量和对病毒结构完整性的影响方面差异很大。最重要的是，由于几乎无法区分的生物物理特征，例如大小，浮力密度和核酸含量，使用几乎所有纯化方法分泌的细胞外囊泡（EV）与逆转录病毒共同纯化变得明显。最近，我们小组已经阐明了一种利用针对Moloney鼠白血病病毒的病毒包膜糖蛋白的免疫沉淀方法从含有EV的细胞上清液中分离完整和高度富集的逆转录病毒病毒颗粒的方法（Renner et al。， 2018）。这种技术，我们称之为完整的病毒粒子免疫沉淀（IVIP），使我们能够表征这些逆转录病毒表面上表位的可及性，并评估病毒包膜中病毒编码的整合膜蛋白Glycogag（gPr80）的方向。该方案的正确实施使得能够快速，简单且可重复地制备完整且高度纯化的逆转录病毒颗粒，其没有可检测的EV污染物。
【背景】广泛使用的分离逆转录病毒的方法，如人类免疫缺陷病毒（HIV）和小鼠白血病病毒（MLV），包括沉淀，色谱，超滤，超速离心，以及各种其他粒子分离方法（评论在Nestola et al。，2015）。虽然每种技术都有其特定的优点，缺点和局限性，但所有方法的共同关注点是细胞分泌的细胞外囊泡（EV）的共同纯化。
EV构成由所有细胞类型分泌的膜衍生囊泡的异质群体（Yanez-Mo ...
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| Mammalian Cell-derived Vesicles for the Isolation of Organelle Specific Transmembrane Proteins to Conduct Single Molecule Studies
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Author:
Date:
2018-05-05
[Abstract] Cell-derived vesicles facilitate the isolation of transmembrane proteins in their physiological membrane maintaining their structural and functional integrity. These vesicles can be generated from different cellular organelles producing, housing, or transporting the proteins. Combined with single-molecule imaging, isolated organelle specific vesicles can be employed to study the trafficking and assembly of the embedded proteins. Here we present a method for organelle specific single molecule imaging via isolation of ER and plasma membrane vesicles from HEK293T cells by employing OptiPrep ...
[摘要] 细胞衍生的囊泡促进跨膜蛋白在其生理膜中的分离，从而维持其结构和功能完整性。 这些囊泡可以由产生，容纳或运输蛋白质的不同细胞器产生。 结合单分子成像，可以使用分离的细胞器特异性囊泡来研究嵌入蛋白质的运输和组装。 在这里，我们提出了一种通过使用OptiPrep梯度和氮气穴通过从HEK293T细胞中分离ER和质膜囊泡来进行细胞器特异性单分子成像的方法。 通过Western印迹验证分离，并使用分离的囊泡进行寡聚受体组装的单分子研究。
【背景】大量的跨膜蛋白通过多个亚基的组装形成，导致复杂的寡聚结构，其可以通常以多种化学计量存在。了解组装中的变化如何改变在不同细胞器中的贩运和本地化对于确定蛋白质的生理作用以及与成熟和运输相关的疾病的连接至关重要。单分子方法可以通过直接测量其化学计量比来更好地理解寡聚蛋白的组装（Ulbrich和Isacoff，2007; Richards等人，2012）。这种方法避免了整体平均，从而提供了所有化学计量的平均状态（Walter and Bustamante，2014）。单分子研究近来已被用于理解大分子的结构和功能特性，包括构象动力学（Tan等人，2014），离子通道门控（Wang等人 ，2016），配体 - 受体相互作用（Moonschi等人，2015）和化学计量组装（Ulbrich和Isacoff，2007; ...
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| High Throughput NPY-Venus and Serotonin Secretion Assays for Regulated Exocytosis in Neuroendocrine Cells
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Author:
Date:
2018-01-05
[Abstract] Here we describe two assays to measure dense core vesicle (DCV) exocytosis-mediated cargo secretion in neuroendocrine cells. To conduct siRNA screens for novel genes in regulated DCV exocytosis, we developed a plate reader-based secretion assay using DCV cargo, NPY-Venus, and an orthogonal 3H-serotonin secretion assay. The NPY-Venus secretion assay was successfully used for a high throughput siRNA screen, and the serotonin secretion assay was used to validate hits identified from the screen (Sorensen, 2017; Zhang et al., 2017).
[摘要] 在这里我们描述了两种测定方法来测量神经内分泌细胞中的致密核心囊泡（DCV）胞吐作用介导的货物分泌。 为了在受调控的DCV胞吐作用中对新基因进行siRNA筛选，我们开发了使用DCV货物，NPY-金星以及正交3H-血清素分泌测定的基于读板器的分泌测定法。 NPY-金星分泌测定成功地用于高通量siRNA筛选，并且使用血清素分泌测定来验证从筛选中鉴定的命中（Sorensen，2017; Zhang等人，2017）。
【背景】致密核心囊泡（DCV）胞吐作用介导内分泌和神经内分泌细胞分泌蛋白质，肽和小分子。当蛋白质和肽激素被内质网上的核糖体合成时，蛋白质和肽激素进入分泌途径，并在跨高尔基网络（TGN）（Borgonovo等人，2006; Bowman等， >等人，2009）。小分子物质，如5-羟色胺，直接被胞质单胺转运蛋白（VMATs）从细胞质直接吸收到DCV的内腔（Sudhof，2004）。在非刺激条件下，货物分子被储存在靠近质膜的DCV内。当细胞接受增加细胞质Ca ...
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