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ÄKTA start Protein Purification System

公司名称: Cytiva
产品编号: ÄKTA start
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Laminarin Quantification in Microalgae with Enzymes from Marine Microbes
Author:
Date:
2018-04-20
[Abstract]  The marine beta-glucan laminarin is an abundant storage polysaccharide in microalgae. High production rates and rapid digestion by heterotrophic bacteria turn laminarin into an ideal carbon and energy source, and it is therefore a key player in the marine carbon cycle. As a main storage glucan laminarin also plays a central role in the energy metabolism of the microalgae (Percival and Ross, 1951; Myklestad, 1974; Painter, 1983). We take advantage of enzymes that digest laminarin selectively and can thereby quantify only this polysaccharide in environmental samples. These enzymes hydrolyze ... [摘要]  海洋β-葡聚糖昆布多糖是微藻中丰富的储存多糖。高生产率和异养细菌的快速消化将昆布多糖转化为理想的碳源和能源,因此它是海洋碳循环的关键参与者。作为主要的储存葡聚糖昆布多糖也在微藻的能量代谢中发挥核心作用(Percival and Ross,1951; Myklestad,1974; Painter,1983)。我们利用可以选择性消化昆布多糖的酶,从而可以对环境样品中的这种多糖进行定量。这些酶将昆布多糖水解成葡萄糖和寡糖,用标准的还原糖测定法测定得到昆布多糖浓度。在此测定之前,需要通过异源表达和纯化产生三种酶。该测定可用于监测环境微藻中的昆布多糖浓度,其通过过滤从海水中浓缩,或用来自藻类实验室培养物的样品中浓缩。

【背景】海洋多糖在海洋碳循环中起着重要作用,是浮游植物生理学的重要组成部分,但受到严重影响。几十年来,农业食品工业一直使用基于酶分析的即用试剂盒来分析各种不同的多糖(Whitaker,1974)。这些快速,稳健和特异性的基于酶的方法评估源自陆地植物即淀粉的多糖,因为它们广泛用于食品,饲料和其他工业应用中(Brunt等人, ,1998)。然而,海洋多糖的类似测定仍然缺乏。受到使用酶在藻类中进行多糖定量的想法的启发,我们开发了一种基于酶的方法来量化在硅藻和其他微藻中生态相关的β-葡聚糖昆布氨酸,也称为菊科金刚烷。

这种应用的三种糖苷水解酶(GH)来自福尔摩沙(Formosa)。并且它们的特征如下:FbGH30是GH30家族的外切型β-1,6-葡聚糖酶,特别是水解与昆布多糖骨架连接的β-1,6-连接的葡萄糖单体分支;并且FaGH17A和FbGH17A是GH家族17的两种内作用β-1,3-葡聚糖酶,其特异性地作用于β-1,3-连接的昆布多糖主链上(Becker等人,2017年, ...

Determination of Hydrodynamic Radius of Proteins by Size Exclusion Chromatography
Author:
Date:
2017-04-20
[Abstract]  Size exclusion chromatography (SEC) or gel filtration is a hydrodynamic technique that separates molecules in solution as a function of their size and shape. In the case of proteins, the hydrodynamic value that can be experimentally derived is the Stokes radius (Rs), which is the radius of a sphere with the same hydrodynamic properties (i.e., frictional coefficient) as the biomolecule. Determination of Rs by SEC has been widely used to monitor conformational changes induced by the binding of calcium (Ca2+) to many Ca2+-sensor proteins. For ... [摘要]  尺寸排阻色谱法(SEC)或凝胶过滤是一种流体动力学技术,它将溶液中的分子作为其尺寸和形状的函数。在蛋白质的情况下,可以通过实验得出的流体动力学值是斯托克斯半径(R s),它是具有相同流体力学性质的球体的半径(即, >摩擦系数)作为生物分子。通过SEC测定R s已经被广泛用于监测由钙(Ca 2+)与许多Ca 2+连接引起的构象变化传感器蛋白。对于这类蛋白质,SEC分离不仅基于Ca 2 + 结合后的蛋白质尺寸变化,而且可能来自水合壳结构的变化。
该方案旨在使用快速蛋白质液相色谱(FPLC)系统对预填充柱进行凝胶过滤实验,以确定蛋白质的R 1,其中一些适用于Ca 2 + 传感器蛋白。

凝胶过滤基于其相对的能力分离不同大小和形状的分子,以穿透具有明确孔径的多孔珠床,其识别分馏范围。大于完全排除进入孔隙的分馏范围的分子快速流过色谱柱,首先以空间体积(V 0 O)(其为支持颗粒外的间隙体积)洗脱。能够扩散到珠的孔中的小于分级范围的分子具有可用于流动相的总体积,因此它们更缓慢地移动通过床并最后洗脱。具有中等维度的分子将以包含在流动相可利用的空隙体积和总体积之间的洗脱体积(V e e e e)被洗脱(分子越小,其进入孔隙越大矩阵,因此其V e e越大)。
蛋白质的分子量可以通过比较其洗脱体积参数K ...

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