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EconoSpin(TM) All-in-1 Mini Spin Columns for DNA/RNA extraction

公司名称: Epoch Life Science
产品编号: 1920-250
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Extraction and Quantification of Polyphosphate (polyP) from Gram-negative Bacteria
Author:
Date:
2018-09-20
[Abstract]  Polyphosphate (polyP), a universally conserved biomolecule, is composed of up to 1,000 phosphate monomers linked via phosphoanhydride bonds. Reaching levels in bacteria that are in the high nmoles per mg protein range, polyP plays important roles in biofilm formation and colonization, general stress protection and virulence. Various protocols for the detection of polyP in bacteria have been reported. These methods primarily differ in the ways that polyP is extracted and/or detected. Here, we report an improved method, in which we combine polyP extraction via binding to glassmilk with a very ... [摘要]  多磷酸盐(polyP)是一种普遍保守的生物分子,由多达1,000个通过磷酸酐键连接的磷酸盐单体组成。 达到每毫克蛋白质高纳摩尔细菌的水平,polyP在生物膜形成和定植,一般应力保护和毒力中起重要作用。 已经报道了用于检测细菌中polyP的各种方案。 这些方法主要在于提取和/或检测polyP的方式不同。 在这里,我们报告了一种改进的方法,其中我们结合polyP提取通过结合到玻璃奶与非常敏感的PolyP激酶/荧光素酶检测系统。 通过使用该程序,我们显着增强了polyP检测的灵敏度,使其可能适用于哺乳动物组织。

【背景】聚磷酸盐(polyP)是一种由多达1,000种无机磷酸盐单体的直链组成的生物聚合物,存在于生命的所有三个领域的细胞中。然而,细菌是唯一已经充分研究了polyP代谢酶的生物。将ATP转化为polyP的细菌polyP激酶(PPK)催化正向和反向反应。虽然polyP的合成显然是细胞中有利的反应,但通过在体外提供足够量的ADP ,该酶可用于从polyP产生ATP,使得基于荧光素酶的ATP检测成为可能(Ault -Riché et al。,1998)。缺乏PPK的细菌在生物膜形成,运动性,持久性和各种应激反应方面存在缺陷,并显示出对次卤酸(即,漂白)应激或磷酸盐饥饿的显着增加的敏感性(图1)(Rao et al。,2009; Gray et ...

CRISPR/Cas9 Editing of the Bacillus subtilis Genome
Author:
Date:
2017-04-20
[Abstract]  A fundamental procedure for most modern biologists is the genetic manipulation of the organism under study. Although many different methods for editing bacterial genomes have been used in laboratories for decades, the adaptation of CRISPR/Cas9 technology to bacterial genetics has allowed researchers to manipulate bacterial genomes with unparalleled facility. CRISPR/Cas9 has allowed for genome edits to be more precise, while also increasing the efficiency of transferring mutations into a variety of genetic backgrounds. As a result, the advantages are realized in tractable organisms and ... [摘要]  大多数现代生物学家的基本过程是研究生物体的遗传操作。尽管许多不同的方法用于编辑细菌基因组已经在实验室中使用了数十年,但CRISPR / Cas9技术对细菌遗传学的适应使得研究人员能够以无与伦比的设施来操纵细菌基因组。 CRISPR / Cas9允许基因组编辑更精确,同时也提高将突变转移到各种遗传背景的效率。因此,在遗传操作难以处理的易处理生物和生物体中实现了这些优点。在这里,我们描述了我们编辑枯草芽孢杆菌细菌基因组的方法。我们的方法是高效的,导致精确,无标记的突变。此外,在产生编辑质粒之后,可以将突变快速导入几个遗传背景,大大增加可进行遗传分析的速度。

枯草芽孢杆菌是高度易处理的革兰氏阳性菌。遗传研究适用于使用多种载体通过同源重组快速有效地引入突变。尽管有许多不同的方法来引入B突变。 subtilis,每种方法都有其局限性。一种简单而简单的方法,用于在B中进行突变。枯草芽孢杆菌是基因破坏,其中将质粒整合到感兴趣的基因内(Vagner等人,1998)。主要的局限性包括:1)扰乱操纵子的极地作用的潜力; 2)引进和保留外来DNA; 3)一旦使用抗生素耐药性盒,如果在其他突变的背景下研究给定的突变,则研究者必须使用不同的盒;和4)该方法限于靶向整个基因,并且不能产生更精确的点突变。 ...

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