| Optical Clearing and Index Matching of Tissue Samples for High-resolution Fluorescence Imaging Using SeeDB2
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Author:
Date:
2018-10-20
[Abstract] Tissue clearing techniques are useful for large-scale three-dimensional fluorescence imaging of thick tissues. However, high-resolution imaging deep inside tissues has been challenging, as it is extremely sensitive to light scattering and spherical aberrations. Here, we present a water-based optical clearing and mounting media, SeeDB2, which is designed for high numerical aperture (NA) objective lenses with oil or glycerol immersion. Using quick and simple soaking procedures, the refractive indices of samples can be matched either to that of immersion oil (1.52) or glycerol (1.46), thus ...
[摘要] 组织清除技术可用于厚组织的大规模三维荧光成像。然而，高分辨率成像深层组织一直是一个挑战，因为它对光散射和球面像差极为敏感。在这里，我们提出了一种水基光学清除和安装介质SeeDB2，它是专为高数值孔径（NA）物镜和油或甘油浸泡而设计的。使用快速简单的浸泡程序，样品的折射率可以与浸油（1.52）或甘油（1.46）相匹配，从而最大限度地减少光散射和球面像差。在清理和成像过程中，高度保留了良好的形态和各种荧光蛋白。我们的方法可用于使用共聚焦和超分辨率显微镜在突触分辨率下的神经元电路的三维荧光成像。 SeeDB2也可用作荧光蛋白超分辨率成像的封固介质。
【背景】生物组织以3D组织。此外，许多重要的细胞机器，例如，例如，神经元中的突触，是亚微米级的。因此，对用于亚微米级3D成像的方法的需求不断增加。串联电子显微镜技术（例如>，FIB-SEM或SBF-SEM）很有前景，但它们无法充分利用现代生命科学中可用的基因荧光标记工具。为了利用荧光显微镜促进3D成像，近年来已经开发了许多组织清除技术（Richardson和Lichtman，2015和2017）。它们专为大规模3D成像而设计，其中一些可用于全脑，甚至是固定样品的全身尺度荧光成像，结合共焦，双光子或光片显微镜。然而，其中许多尚未针对高分辨率成像进行全面优化。
在荧光显微镜中，横向分辨率（ d >）给出如下：
d ...
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| Live Confocal Imaging of Brachypodium Spikelet Meristems
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Author:
Date:
2018-09-20
[Abstract] Live confocal imaging of fluorescent reporters and stains in plant meristems provides valuable measurements of gene expression, protein dynamics, cell polarity, cell division, and growth. The spikelet meristem in the grass Brachypodium distachyon (Brachypodium) is well suited to live imaging because of the ease of dissection, small meristem size, simple arrangement of organs, and because each plant provides abundant spikelet meristems. Brachypodium is also far easier to genetically transform than other grass species. Presented here is a protocol for the growth, staging, dissection, ...
[摘要] 荧光报告子和植物分生组织中的染色的活共聚焦成像提供了基因表达，蛋白质动力学，细胞极性，细胞分裂和生长的有价值的测量。 由于易于解剖，小分生组织大小，器官的简单排列，并且因为每种植物提供了丰富的小穗分生组织，因此草 Brachypodium distachyon （Brachypodium）中的小穗分生组织非常适合于活体成像。 短柄草比其他草种更容易进行遗传转化。 这里介绍的是用于活体共聚焦成像的短柄草小穗分生组织的生长，分期，解剖，安装和成像的方案。
植物器官（叶子，树枝，花）起源于分生组织，分生组织是含有干细胞群的植物的生长尖端。转录报告子，荧光融合蛋白和荧光染料的活共聚焦成像提供了关于涉及分生组织维持和器官起始的无数基因产物的重要空间和时间信息。 拟南芥花序分生组织的实时成像是一个持续的探索线（Reddy et al。，2004; Bhatia et al。，2016; Prunet et al。，2016; Willis et al。，2016; Landrein et al。，2018; Shi et al。，2018），而拟南芥之外的植物中分生组织的实时成像受到限制（Deb et al。，2015）。
这里展示的是一种共聚物实时成像方案，用于草 Brachypodium distachyon ...
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| Phagocytosis Assay for α-Synuclein Fibril Uptake by Mouse Primary Microglia
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Author:
Date:
2018-09-05
[Abstract] Microglia are professional phagocytes in the brain and deficiency in their phagocytic activity plays an important role in Parkinson’s disease. This protocol mainly describes the phagocytosis assay for uptake of α-synuclein preformed fibrils, a pathologic form of α-synuclein, by primary microglia.
[摘要] 小胶质细胞是大脑中的专业吞噬细胞，其吞噬活性的缺乏在帕金森病中起重要作用。 该方案主要描述了通过原代小胶质细胞摄取α-突触核蛋白预先形成的原纤维（α-突触核蛋白的病理形式）的吞噬作用测定。
【背景】作为大脑的免疫细胞，小胶质细胞在中枢神经系统中起着关键作用。在生理状态下，小胶质细胞不断探索周围环境并参与突触修剪。小胶质细胞可被任何类型的病理事件或脑内稳态的变化激活（Wolf et al。，2017）。激活后，小胶质细胞经历形态学变化，增殖，分泌炎性细胞因子，迁移至病变部位，吞噬病原体，病细胞，碎片，甚至细胞外蛋白质聚集体（Kettenmann et al。，2011; Fu et al。，2014）。 α-突触核蛋白是神经元中的丰富蛋白质，并且是帕金森病中称为路易体和路易神经突的神经元内包涵体的主要成分（Luk 等人，，2012）。最近的研究表明α-突触核蛋白经历细胞间扩散，小胶质细胞是α-突触核蛋白的主要清除剂，它可能承担来自神经元的α-突触核蛋白的负担（Wolf et al。，2017 ）。在这里，我们描述了使用人α-突触核蛋白单体产生预先形成的原纤维并通过小胶质细胞吞噬作用测量α-突触核蛋白预先形成的原纤维的摄取的方案（Du et al。，2017）。
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