| Analyzing the Properties of Murine Intestinal Mucins by Electrophoresis and Histology
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Author:
Date:
2017-07-20
[Abstract] Specialized secretory cells known as goblet cells in the intestine and respiratory epithelium are responsible for the secretion of mucins. Mucins are large heavily glycosylated proteins and typically have a molecular mass higher than 106 Da. These large proteins are densely substituted with short glycan chains, which have many important functional roles including determining the hydration and viscoelastic properties of the mucus gel that lines and protects the intestinal epithelium. In this protocol, we comprehensively describe the method for extraction of murine mucus and its ...
[摘要] 在肠和呼吸上皮中称为杯状细胞的专门分泌细胞负责粘蛋白的分泌。 粘蛋白是大的重糖基化蛋白质，通常具有高于10μM的分子量。 这些大蛋白质被短聚糖链密集取代，其具有许多重要的功能作用，包括测定粘液凝胶的水合和粘弹性质，其保护肠上皮。 在该方案中，我们全面地描述了通过琼脂糖凝胶电泳提取小鼠粘液的方法及其分析。 此外，我们描述了使用高铁二胺 - 阿尔星蓝，周期酸席夫氏 - 阿尔辛蓝和免疫染色方法来鉴别和区分这些粘蛋白糖蛋白上糖基化的不同状态，特别是侧重于硫酸化和唾液酸化。
【背景】一层粘液保护肠上皮，主要由粘蛋白，水，蛋白质和无机盐组成。粘液屏障的粘性和凝胶状特性使其能够物理保护和润滑粘膜，主要由粘蛋白赋予。粘蛋白是大的重糖基化蛋白质，通常具有高于10μM的分子量。然而，粘蛋白主要用O-聚糖糖装饰，其占分子量的80％。不同的位点特异性和粘蛋白特异性糖基化模式影响粘蛋白和粘液凝胶的性质。众所周知，粘蛋白糖基化在感染和疾病中发生改变（Arike等人，2017; ...
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| Analysis of 3D Cellular Organization of Fixed Plant Tissues Using a User-guided Platform for Image Segmentation
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Author:
Date:
2017-06-20
[Abstract] The advent of non-invasive, high-resolution microscopy imaging techniques and computational pipelines for high-throughput image processing has contributed to gain insights in plant organ morphogenesis at the cellular level. Confocal scanning laser microscopy (CSLM) allows the generation of three dimensional images constituted of serial optical sections reporting on stained subcellular structures. Fluorescent labels of cell walls or cell membranes, either chemically or through reporter proteins, are particularly useful for the analyses of tissue organization and cellular shapes in 3D. Image ...
[摘要] 非侵入性，高分辨率显微镜成像技术和高通量图像处理计算管道的出现有助于在细胞水平上获得植物器官形态发生的见解。共焦扫描激光显微镜（CSLM）允许产生由串联光学部件组成的三维图像，其报告染色的亚细胞结构。细胞壁或细胞膜的化学或通过报告蛋白的荧光标记对于3D中组织组织和细胞形状的分析特别有用。基于单元边界信号的图像分割被用作生成表示单元的3D段的输入。如果使用其他记录器，这些数字化3D对象提供有关细胞形状，大小，几何形状，位置或（细胞间）强度信号的定量数据。在这里，我们报告使用微观数据的图像分割的详细的注释工作流程。我们在拟南芥胚珠原基发育过程中对组织图案进行了研究。使用修改的假希夫碘化丙啶（mPS-PI）协议将整个心皮染色为细胞边界，通过CSLM以高分辨率获得3D图像，使用ImarisCell对单个细胞类型进行分段和注释。这允许与组织动力学研究相关的细胞形状和细胞数量的定量分析。
【背景】植物器官和组织动力学研究依赖于沿着发育进程的三维生长过程的分析。细胞数量，细胞大小和细胞形态的演变允许分别解释增殖，细胞扩增和各向异性的事件（Roeder等，2011; Barbier de Reuille等，2015; Bassel和Smith，2016; Coen和Rebocho， ...
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