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Gum arabic from acacia tree

公司名称: Sigma-Aldrich
产品编号: 51198
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Analysis of 3D Cellular Organization of Fixed Plant Tissues Using a User-guided Platform for Image Segmentation
Author:
Date:
2017-06-20
[Abstract]  The advent of non-invasive, high-resolution microscopy imaging techniques and computational pipelines for high-throughput image processing has contributed to gain insights in plant organ morphogenesis at the cellular level. Confocal scanning laser microscopy (CSLM) allows the generation of three dimensional images constituted of serial optical sections reporting on stained subcellular structures. Fluorescent labels of cell walls or cell membranes, either chemically or through reporter proteins, are particularly useful for the analyses of tissue organization and cellular shapes in 3D. Image ... [摘要]  非侵入性,高分辨率显微镜成像技术和高通量图像处理计算管道的出现有助于在细胞水平上获得植物器官形态发生的见解。共焦扫描激光显微镜(CSLM)允许产生由串联光学部件组成的三维图像,其报告染色的亚细胞结构。细胞壁或细胞膜的化学或通过报告蛋白的荧光标记对于3D中组织组织和细胞形状的分析特别有用。基于单元边界信号的图像分割被用作生成表示单元的3D段的输入。如果使用其他记录器,这些数字化3D对象提供有关细胞形状,大小,几何形状,位置或(细胞间)强度信号的定量数据。在这里,我们报告使用微观数据的图像分割的详细的注释工作流程。我们在拟南芥胚珠原基发育过程中对组织图案进行了研究。使用修改的假希夫碘化丙啶(mPS-PI)协议将整个心皮染色为细胞​​边界,通过CSLM以高分辨率获得3D图像,使用ImarisCell对单个细胞类型进行分段和注释。这允许与组织动力学研究相关的细胞形状和细胞数量的定量分析。
【背景】植物器官和组织动力学研究依赖于沿着发育进程的三维生长过程的分析。细胞数量,细胞大小和细胞形态的演变允许分别解释增殖,细胞扩增和各向异性的事件(Roeder等,2011; Barbier de Reuille等,2015; Bassel和Smith,2016; Coen和Rebocho, ...

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