| α-Synuclein Aggregation Monitored by Thioflavin T Fluorescence Assay
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Author:
Date:
2018-07-20
[Abstract] Studying the aggregation of amyloid proteins like α-synuclein in vitro is a convenient and popular tool to gain kinetic insights into aggregation as well as to study factors (e.g., aggregation inhibitors) that influence it. These aggregation assays typically make use of the fluorescence dye Thioflavin T as a sensitive fluorescence reporter of amyloid fibril formation and are conducted in a plate-reader-based format, permitting the simultaneous screening of multiple samples and conditions. However, aggregation assays are generally prone to poor reproducibility due to the ...
[摘要] 研究淀粉样蛋白如α-突触核蛋白体外聚集是一种方便和流行的工具，可以获得聚集的动力学见解以及研究因子（例如，聚集抑制剂） 影响它。 这些聚集测定通常利用荧光染料硫磺素T作为淀粉样蛋白原纤维形成的敏感荧光报告物，并且以基于读板器的形式进行，允许同时筛选多个样品和条件。 然而，由于原纤维成核的随机性质和调节因子的多样性，聚集测定通常倾向于较差的再现性。 在这里，我们提出了一个简单和可重复的协议，以研究基于读板器的测定中α-突触核蛋白的聚集。
【背景】内源性蛋白质与淀粉样原纤维的聚集是一种致病过程，与几种疾病相关，例如，神经退行性疾病如阿尔茨海默病（AD）或帕金森病（PD）以及全身性疾病如AL淀粉样变性（ Knowles et al。，2014）。通过基于硫磺素T荧光的聚集测定，可以在基于板读者的装置中在体外中概括该过程，从而允许根据各种影响因素研究淀粉样蛋白的聚集动力学。
硫磺素T（ThT）是一种荧光染料，最初用于组织学样本中的淀粉样蛋白原纤维染色，于1959年由Vassar和Culling（Vassar和Culling，1959），其在体外检测和定量淀粉样纤维的应用
目前，硫代黄素T的聚集测定主要在荧光板读数器中进行，其中例如，96条件可以同时测试。由于原纤维成核的随机性质和影响蛋白质聚集的多种因素，这些测定法具有较差的重现性。因此，已经采用了增加ThT测定的再现性的策略，例如在测量期间使用井板的轨道摇动以及向孔中添加玻璃珠以改善混合（Giehm和Otzen，2010）。 ...
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| Determination of Cellular Phosphatidylinositol-3-phosphate (PI3P) Levels Using a Fluorescently Labelled Selective PI3P Binding Domain (PX)
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Author:
Date:
2016-08-20
[Abstract] The lipid Phosphatidylinositol-3-phosphate [PtdIns3P or PI(3)P] plays many membrane trafficking roles and is primarily produced by the Class III PI3K, VPS34. Determining the level of cellular PI(3)P however can be complex. Extraction of cellular lipids by methanol/chloroform can struggle to separate and identify distinct phospholipid species. Alternately mass spectrometry may be utilised but this requires significant set up of specialised equipment and time to utilise.
Use of a PI(3)P-binding-specific recombinant protein domain is a quick method for ascertaining cellular PI(3)P ...
[摘要] 脂质磷脂酰肌醇-3-磷酸[PtdIns3P或PI（3）P]扮演许多膜贩运角色，主要由III类PI3K，VPS34产生。然而，确定细胞PI（3）P的水平可以是复杂的。通过甲醇/氯仿提取细胞脂质可能难以分离和鉴定不同的磷脂种类。或者可以使用质谱法，但这需要大量设置专门的设备和时间来利用。
使用PI（3）P结合特异性重组蛋白结构域是用于确定细胞PI（3）P水平的快速方法，并且还可以允许亚细胞定位的可视化。 p40phox的PX结构域（本文称为PX）对PI（3）P比其它磷脂种类非常特异（Kanai等人，2001）。然而，在细胞中直接表达PX可能是有问题的，因为它将以显性负性方式作用，以比内源蛋白更大的亲和力结合和螯合PI（3）P，从而干扰细胞途径和PI（3）P水平。因此，使用荧光标记的PX后细胞固定更合适，因为它能突出显示PI（3）富集结构，没有扰乱系统的风险。
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