| Quantification of Colibactin-associated Genotoxicity in HeLa Cells by In Cell Western (ICW) Using γ-H2AX as a Marker
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Author:
Date:
2018-03-20
[Abstract] The genotoxin colibactin is produced by several species of Enterobacteriaceae. This genotoxin induces DNA damage, cell cycle arrest, senescence and death in eukaryotic cells (Nougayrède et al., 2006; Taieb et al., 2016). Here we describe a method to quantify the genotoxicity of bacteria producing colibactin following a short infection of cultured mammalian cells with colibactin producing E. coli.
[摘要] 基因毒素colibactin由几种肠杆菌科产生。 该基因毒素在真核细胞中诱导DNA损伤，细胞周期停滞，衰老和死亡（Nougayrède等人，2006; Taieb等人，2016）。 在这里，我们描述了一种方法来量化生产colibactin的细菌的基因毒性，在短时间感染培养的哺乳动物细胞后，产生e colibactin。大肠杆菌。
【背景】基因毒素colibactin是由几种肠杆菌科产生的聚酮化合物非核糖体肽杂交化合物。由编码在54kb基因组基因座pks岛上的机器合成的这种毒素在真核细胞中诱导DNA损伤，细胞周期停滞，衰老和死亡（Nougayrède等人， 2006年; Taieb 等人，2016年）。大肠杆菌素的基因毒性活性取决于直接的宿主细胞 - 细菌相互作用，并且不能从培养物上清液，杀死的细菌或细菌裂解物而非生命细菌重演。可以通过量化巨细胞病表型（对于方案参见Bossuet-Greif等人，2017）或双链DNA断裂的定量来评估对真核细胞的大肠杆菌素基因毒性效应的可视化和定量在彗星试验（揭示DNA片段化）或H2AX组蛋白磷酸化作用宿主细胞核中，双链DNA标记断裂。组蛋白H2AX的磷酸化表征为对遗传毒性剂的早期和敏感反应（Audebert等人，2010）。证明H2AX磷酸化比彗星试验在体外以及体内灵敏度高10-100倍（Audebert等人， ...
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| Protocol for HeLa Cells Infection with Escherichia coli Strains Producing Colibactin and Quantification of the Induced DNA-damage
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Author:
Date:
2017-08-20
[Abstract] Strains of Escherichia coli bearing the pks genomic island synthesize the genotoxin colibactin. Exposure of eukaryotic cells to E. coli producing colibactin induces DNA damages, ultimately leading to cell cycle arrest, senescence and death. Here we describe a simple method to demonstrate the genotoxicity of bacteria producing colibactin following a short infection of cultured mammalian cells with pks+ E. coli.
[摘要] 具有pks基因组岛的大肠杆菌菌株合成基因毒素大肠杆菌素。 将真核细胞暴露于产生大肠杆菌的大肠杆菌诱导DNA损伤，最终导致细胞周期停滞，衰老和死亡。 在这里，我们描述了一种简单的方法来证明在用pks +大肠杆菌培养的哺乳动物细胞的短时间感染后，产生大肠杆菌素的细菌的遗传毒性。
【背景】大肠杆菌素是在大肠杆菌的肠外致病，共生和益生菌菌株中发现的基因毒素（Nougayrede等，2006）。大肠杆菌素也由其他肠杆菌科产生，包括肺炎克雷伯杆菌，产气肠杆菌和柠檬酸杆菌（Putze等人，2009）。大肠杆菌素是通过由多酮酶和非核糖体肽合酶（PKS和NRPS），定制和成熟酶以及外排泵组成的多酶机械合成的聚酮化合物/非核糖体肽杂化化合物（综述：Taieb等人。，2016）。该合成机制编码在52kb的基因组，即'pks'岛上。 Colibactin在感染pks +细菌的真核细胞中诱导DNA损伤。由大肠杆菌素诱导的遗传毒性作用需要活的pks +细菌与真核细胞的直接接触。事实上，杀死的细菌或细菌上清液或裂解物没有观察到遗传毒性作用。因此，为了证明产生大肠杆菌的大肠杆菌的基因毒性，培养的哺乳动物细胞（例如HeLa细胞）在4小时内用活的pks ...
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| Physical Removal of the Midbody Remnant from Polarised Epithelial Cells Using Take-Up by Suction Pressure (TUSP)
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Author:
Date:
2017-04-20
[Abstract] In polarised epithelial cells the midbody forms at the apical cell surface during cytokinesis. Once severed, the midbody is inherited by one of the daughter cells remaining tethered to the apical plasma membrane where it participates in non-cytokinetic processes, such as primary ciliogenesis. Here, we describe a novel method to physically remove the midbody remnant from cells and assess the possible effects caused by its loss (Bernabé-Rubio et al., 2016).
[摘要] 在极化上皮细胞中，胞质在细胞分裂过程中在顶端细胞表面形成。 一旦切断，中间体被遗留于其中参与非细胞运动过程（例如初级细胞发生）的顶端质膜的其中一个子细胞遗传。 在这里，我们描述了一种从细胞中物理去除中间体残留物并评估其损失所引起的可能影响的新方法（Bernabé-Rubio et al。，2016）。
【背景】中间体或Flemming体是在有丝分裂的最后阶段在子细胞之间形成的细胞间桥的中心部分。通过运输（ESCRT）机器所需的内体分选复合体，桥梁两侧的脱落导致两个子细胞的物理分离（Green等，2012）。除了其在有丝分裂调节中的已知功能外，最近的研究已经开始阐明中间体后有丝分裂后的作用。由于其在肾细胞中腔内形成的启动中的作用，中间体被假定为极性提示（Li等，2014）。最近，已经证明，中间体残留物通过极化的Madin-Darby犬肾（MDCK）细胞（Bernabé-Rubio等，2016）直接参与初级细胞发生。还发现在秀丽隐杆线虫（Singh and Pohl，2014）的发展过程中以及在确定细胞命运和分化过程中，形成背轴的作用（Kuo et al。，2011）。以前的研究使用激光消融来损害中间体残留的功能。然而，当在培养的细胞系中进行时，由于质膜和近端胞质元件的损伤，激光烧蚀可导致细胞死亡。因此，我们设计了一个温和的程序，我们称之为“抽吸压力”（TUSP）。 ...
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