| Fluorescein Transport Assay to Assess Bulk Flow of Molecules Through the Hypocotyl in Arabidopsis thaliana
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Author:
Date:
2018-04-05
[Abstract] The bulk transport of molecules through plant tissues underpins growth and development. The stem acts as a conduit between the upper and low domains of the plant, facilitating transport of solutes and water from the roots to the shoot system, and sugar plus other elaborated metabolites towards the non-photosynthetic organs. In order to perform this function efficiently, the stem needs to be optimized for transport. This is achieved through the formation of vasculature that connects the whole plant but also through connectivity signatures that reduce path length distributions outside the ...
[摘要] 分子通过植物组织的大量运输支撑了生长和发育。茎部充当植物上部和低部位之间的导管，促进溶质和水从根部向茎部系统的运输，糖和其他精细代谢物向非光合器官转运。为了有效地执行此功能，杆需要针对运输进行优化。这通过形成连接整个植物的脉管系统来实现，但也通过连接特征来减少血管系统外的路径长度分布。该协议被设计为描述细胞连接如何影响穿过茎的分子的大量流动。这是通过将幼苗暴露于荧光素而实现的，其中假定没有特定的转运蛋白存在于A中。在给定的暴露时间后，使用共焦显微镜和定量3D图像分析评估该荧光化合物在胚胎干（下胚轴）的单个细胞中的相对浓度。
【背景】结构和功能之间的联系一直着迷于生物学家，从器官的设计空间（Eldredge，1989）到进化路径的趋同或分歧（Morris，2003）。在较小规模的情况下，细胞也以稳健且严格控制的方式组织，与组织执行的功能密切相关（Jackson等人，2017a）。构成特定组织的细胞物理相互作用的集合也可被视为网络，即细胞连接体。这种连接体在植物中特别有趣，因为共享细胞壁阻碍细胞运动，因此网络动力学仅取决于细胞死亡和复制。
我们假设组织结构和细胞连接体与生理特征和器官功能有关。这样，网络指标和定量网络分析可用于预测并获得生物系统的理解（Duran-Nebreda和Bassel，2017; Jackson等人，2017b）。 ...
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| Peroxisome Motility Measurement and Quantification Assay
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Author:
Date:
2017-09-05
[Abstract] Organelle movement, distribution and interaction contribute to the organisation of the eukaryotic cell. Peroxisomes are multifunctional organelles which contribute to cellular lipid metabolism and ROS homeostasis. They distribute uniformly in mammalian cells and move along microtubules via kinesin and dynein motors. Their metabolic cooperation with mitochondria and the endoplasmic reticulum (ER) is essential for the β-oxidation of fatty acids and the synthesis of myelin lipids and polyunsaturated fatty acids. A key assay to assess peroxisome motility in mammalian cells is the expression of a ...
[摘要] 细胞器运动，分布和相互作用有助于真核细胞的组织。过氧化物酶体是有助于细胞脂质代谢和ROS稳态的多功能细胞器。它们在哺乳动物细胞中均匀分布，并通过驱动蛋白和动力蛋白电动机沿微管移动。他们与线粒体和内质网（ER）的代谢合作对脂肪酸的β-氧化和髓鞘脂质和多不饱和脂肪酸的合成至关重要。评估哺乳动物细胞中过氧化物酶体运动性的关键测定是具有过氧化物酶体靶向信号（例如GFP-PTS1）的荧光融合蛋白的表达，其靶向过氧化物酶体基质并允许过氧化物酶体的活细胞成像。在这里，我们首先提出了用过氧化物酶体标记物EGFP-SKL转染培养的哺乳动物细胞的方案，以观察活细胞中的过氧化物酶体。这种方法揭示了过氧化物酶体的不同运动行为和对过氧化物酶体膜动力学的新见解（Rapp等，1996; Wiemer等，1997; ...
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