| Preparation of HeLa Total Membranes and Assay of Lipid-inhibition of Serine Palmitoyltransferase Activity
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Author:
Date:
2020-06-20
[Abstract] Serine palmitoyltranferase (SPT) is a pyridoxal 5′ phosphate (PLP)-dependent enzyme that catalyzes the first and rate-limiting step of de novo synthesis of sphingolipids. SPT activity is homeostatically regulated in response to increased levels of sphingolipids. This homeostatic regulation of SPT is mediated through small ER membrane proteins termed the ORMDLs. Here we describe a procedure to assay ORMDL dependent lipid inhibition of SPT activity. The assay of SPT activity using radiolabeled L-serine was developed from the procedure established by the Hornemann laboratory. The ...
[摘要] [摘要] 丝氨酸Palmitoyltranferase （SPT）是吡哆醛5 ' 磷酸（PLP）依赖酶催化第一和限速步骤中从头合成鞘脂。SPT活动是Homeostatically调控响应水平的提高鞘脂。这SPT的稳态调节是通过小ER膜蛋白介导称为ORMDLs。在这里，我们描述了一种方法用放射性标记的L-丝氨酸以测定SPT活性的SPT活性。测定的ORMDL依赖性抑制脂质从由规定的程序被开发Hornemann 实验室。 SPT的活性也可以使用氘化的L-丝氨酸进行测定，但需要进行质谱分析，这会耗费金钱，时间和仪器。可以在细胞和无细胞系统中研究ORMDL依赖性脂质对SPT活性的抑制作用。在这里，我们提供了详细的协议来测量存在短链（C8-神经酰胺）或长链神经酰胺（C24-神经酰胺）时SPT活性。该协议的最大优势之一我们通过在HeLa细胞膜中提供外源鞘氨醇和24：1酰基辅酶A通过内源性神经酰胺合酶生成长链神经酰胺来实现这一目标。需要精密的仪器。
[背景 ] 丝氨酸palmit oyltranferase （SPT）是一种多亚基酶是在真核生物和原核生物一些广泛表达（花田等人，1997; Ikushiro 。等人，2001; Hornemann 等人，2007）.The ...
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| Staining of Membrane Receptors with Fluorescently-labeled DNA Aptamers for Super-resolution Imaging
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Author:
Date:
2017-09-05
[Abstract] One of the most prominent applications of fluorescent super-resolution microscopy is the study of nanodomain arrangements of receptors and the endocytic pathway. Staining methods are becoming crucial for answering questions on the nanoscale, therefore, the use of small and monovalent affinity probes is of great interest in super-resolution microscopy with biological samples. One kind of affinity probe is the aptamer. Aptamers are single DNA or RNA sequences that bind with high affinity to their targets and due to their small size they are able to (i) place the fluorophore in close proximity ...
[摘要] 荧光超分辨率显微镜的最突出的应用之一是研究纳米结构的受体和内吞途径。染色方法对于回答纳米尺度的问题变得至关重要，因此，使用小型和单价亲和探针在具有生物样品的超分辨显微镜中是非常有意义的。一种亲和力探针是适体。适配体是以高亲和力结合其靶标的单个DNA或RNA序列，并且由于它们的小尺寸，它们能够（i）将荧光团置于感兴趣的蛋白质附近，并且（ii）与大部分蛋白质结合有利于克服空间位阻效应，导致更好的染色密度。在这里，我们描述一个详细的协议，使用适配体染色活细胞，并用刺激的排放消耗（STED）显微镜对其进行成像。在该方案中，染色用市售适用于靶向表皮生长因子受体（EGFR），人表皮生长因子受体2（HER2或ErbB2）和ephrin-A受体2（Epha2）的适体进行。由于适配体可与大部分受欢迎的荧光团偶联，因此我们认为本文介绍的方法可扩展到目前超分辨率显微镜技术的绝大多数。
【背景】超分辨率成像技术的最新进展已经导致搜索更精确的方法来标记细胞元件。衍射无限成像仪器提供优异的分辨率，然而标准样品染色方法，如免疫染色，缺乏检测细胞元素所必需的精度。由于它们的大尺寸（长度约15nm）和高分子量（〜150kDa），抗体可以很差地渗透到生物样品中。另外，一次/二次抗体复合物将荧光团放置在远离靶的大约25nm处，从而损害检测精度。此外，由于初级/二级抗体复合物的大尺寸，由于空间位阻（Fornasiero和Opazo，2015），较小部分的靶标可以被标记。这导致较低的标记密度，这是超分辨率显微镜的关键参数，特别是在识别和描述纳米结构时。为了克服这些问题，近年来已经测试了与单个靶（单价）结合的小的亲和力探针，如适体，亲和体或纳米体系（Rothbauer ...
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