| Quantitative Determination of Ca2+-binding to Ca2+-sensor Proteins by Isothermal Titration Calorimetry
|
|
Author:
Date:
2020-04-05
[Abstract] Diverse and complex molecular recognitions are central elements of signal transduction cascades. The strength and nature of these interaction modes can be determined by different experimental approaches. Among those, Isothermal titration calorimetry (ITC) offers certain advantages by providing binding constants and thermodynamic parameters from titration series without a need to label or immobilize one or more interaction partners. Furthermore, second messenger homeostasis involving Ca2+-ions requires in particular knowledge about stoichiometries and affinities of Ca2+-binding ...
[摘要] [摘要] 多样而复杂的分子识别是信号转导级联的核心要素。这些相互作用模式的强度和性质可以通过不同的实验方法来确定。其中，等温滴定热量法（ITC）通过提供来自滴定系列的结合常数和热力学参数，而无需标记或固定一个或多个相互作用伙伴，从而提供了某些优势。此外，涉及钙第二信使动态平衡2+ -离子需要小号特别知识大约化学计量和Ca的亲和力2+ -结合对于Ca 2+ 多个传感器蛋白或钙2+ 依赖的调节器，可以通过使用ITC获得。我们使用ITC来测量在感光细胞中运行的一组神经元Ca 2+ 传感器蛋白的这些参数。在这里，我们提出了一个分步协议，以（a）测量与Ca 2+ 传感器鸟苷酸环化酶e激活蛋白1的Ca 2+ 相互作用，（b）设计ITC实验并准备样品，（c）去除Ca 2+ 几乎完全来自Ca 2+ 结合蛋白，而无需使用螯合剂（如EGTA）。
[背景 ] ...
|
|
|
| In vitro Nitrate Reductase Activity Assay from Arabidopsis Crude Extracts
|
|
Author:
Date:
2018-04-05
[Abstract] Nitrate reductase (NR) reduces the major plant nitrogen source, NO3-, into NO2-. NR activity can be measured by its final product, nitrite through its absorbance under optimized condition. Here, we present a detailed protocol for measuring relative enzyme activity of NR from Arabidopsis crude extracts. This protocol offers simple procedure and data analysis to compare NR activity of multiple samples.
[摘要] 硝酸还原酶（NR）将主要的植物氮源NO 3 N-2还原为NO 2 - 2。 NR活性可以通过其最终产物，亚硝酸盐在最佳条件下通过其吸光度来测量。 在这里，我们提供了一个详细的协议，用于测量来自拟南芥粗提物的NR的相对酶活性。 该协议提供简单的程序和数据分析来比较多个样品的NR活性。
【背景】氮是植物所需的主要营养素，主要以硝酸盐的形式吸收。硝酸还原酶是高等植物中首次同化氮的酶。植物硝酸还原酶的同型二聚体如下催化硝酸根的NAD（P）H依赖性还原为亚硝酸根：
NO <3> + NADH + H +→NO - + NAD + H 测量NR活性的方法可能是研究影响NR活性的生物因素的有力工具（Park等人，2011）。氮同化影响植物中氨基酸的含量，因此调节NR活性可用于提高某些作物的质量（Croy和Hageman，1970; Dalling和Loyn，1977; Ruan等人，1998） ）。在该协议中，在优化的缓冲液条件下限制时间内亚硝酸盐浓度增加作为可比值获得。亚硫酸盐浓度通过Griess测定法通过其在540nm处的吸光度来测量。简言之，亚硝酸盐与磺胺酸形成重氮盐，然后N-（1-萘基）乙二胺二盐酸盐形成有色偶氮化合物。可以比较这些值以确定样品如何具有不同的NR活性。此外，通过简单的过程可以将这些数值转换为精确增加的亚硝酸盐浓度。 ...
|
|
|
| Protease Activity Assay in Fly Intestines
|
|
Author:
Date:
2017-09-20
[Abstract] The intestine is a central organ required for the digestion of food, the absorption of nutrients and for fighting against aggressors ingested along with the food. Impairment of gut physiology following mucosal damages impacts its digestive capacities that consequently will affect growth, wellbeing or even survival of the individual. Hence, the assessment of intestinal functions encompasses, among others, the monitoring of its integrity, its cellular renewing, its immune defenses, the production of enteroendocrine hormones and its digestive capacities. Here, we describe in detail how to assess ...
[摘要] 肠是消化食物所需的中枢器官，吸收营养物质，并与食物一起摄入的侵略者作斗争。 粘膜损伤后的肠道生理损伤影响其消化能力，从而影响个体的生长，健康甚至生存。 因此，肠功能的评估包括监测其完整性，细胞更新，免疫防御，肠内分泌激素的产生及其消化能力。 在这里，我们详细描述如何评估分泌在成年果蝇的肠腔中的蛋白酶的活性。 这种方法也可以用于幼虫肠。 本协议由“蛋白酶荧光检测试剂盒”（产品代码PF0100）中提出的Sigma-Aldrich公司的方案进行了改进和改进。
【背景】肠道受到诸如斋戒，禁食，化学物质，病原体，损伤等诸多压力的影响。肠道能够通过保持其体内平衡的生理平衡来克服这种压力。为了感知进入的压力并产生适应性的维持肠功能的答案，肠已经开发出强健和保守的机制，如局部先天免疫防御和组织再生（Royet和Charroux，2013; Bonfini等，2016）。然而，在某些情况下，肠道稳态的维持可能受到影响。例如，在老化期间，随着许多未成熟或分化不良的细胞的存在，组织稳态维持总体下降（Jasper，2015; ...
|
|
|