| Long-term in vitro Culture of Cryptosporidium parvum
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Author:
Date:
2018-08-05
[Abstract] Continuous in vitro growth of Cryptosporidium parvum has proved difficult and conventional in vitro culture techniques result in short-term (2-5 days) growth of the parasite resulting in thin-walled oocysts that fail to propagate using in vitro cultures, and do not produce an active infection using immunosuppressed or immunodeficient mouse models (Arrowood, 2002). Here we describe the use of hollow fiber bioreactors (HFB) that simulate in vivo conditions by providing oxygen and nutrients to host intestinal cells from the basal surface and permit ...
[摘要] Cryptosporidium parvum 的连续体外生长已证明是困难的，并且常规体外培养技术导致短期（2-5天）生长寄生虫导致薄壁卵囊不能使用体外培养物繁殖，并且不使用免疫抑制或免疫缺陷小鼠模型产生活跃感染（Arrowood，2002）。在这里，我们描述了中空纤维生物反应器（HFB）的使用，通过提供氧气和营养物质从基础表面宿主肠细胞模拟体内条件，并允许建立低氧化还原，高营养环境顶面。当接种10 5 C时。 parvum （爱荷华州分离物）卵囊生物反应器在14天后每ml产生10个 8 卵囊（20ml额外毛细血管体积），并保持2年以上。使用TCR-α免疫缺陷小鼠模型的体内感染性研究显示，在6,12和18个月时从生物反应器产生的卵囊与用于启动培养的亲本Iowa分离物无法区分。 HFB产生的卵囊具有与亲本爱荷华分离物类似的百分比分析。
【背景】 Cryptosporidium parvum 是人和其他哺乳动物肠道的细胞内专性寄生虫，导致急性腹泻。该疾病在免疫功能正常的个体中是自限性的，然而，在免疫功能低下的成人和幼儿中，该疾病可能危及生命（Kotloff，2017）。它是经济资源低的国家中三种被诊断出的儿童肠道疾病之一（Kotloff et al。，2013; Sow et ...
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| Markerless Gene Editing in the Hyperthermophilic Archaeon Thermococcus kodakarensis
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Author:
Date:
2017-11-20
[Abstract] The advent of single cell genomics and the continued use of metagenomic profiling in diverse environments has exponentially increased the known diversity of life. The recovered and assembled genomes predict physiology, consortium interactions and gene function, but experimental validation of metabolisms and molecular pathways requires more directed approaches. Gene function–and the correlation between phenotype and genotype is most obviously studied with genetics, and it is therefore critical to develop techniques permitting rapid and facile strain construction. Many new and candidate ...
[摘要] 单细胞基因组学的出现以及在不同环境中宏基因组分析的持续使用已经成倍地增加了已知的生命多样性。恢复和组装的基因组预测生理，财团相互作用和基因功能，但代谢和分子途径的实验验证需要更直接的方法。基因功能 - 表型和基因型之间的相关性用遗传学得到最明显的研究，因此开发允许快速和容易地构建应变的技术是至关重要的。最近已经发现了许多新的和候选的古细菌谱系，但是对古细菌基因组的实验性，遗传途径目前仅限于一些模式生物。操纵这些基因可获得的生物的基因组所获得的结果已经对我们对古菌生理和信息处理系统的理解产生了深远的影响，这些持续的研究也有助于解决生命树的系统发育重建。超嗜热，浮游，海洋异养古细菌Thermococcus kodakarensis已经成为理想的遗传系统，其具有一系列可用于增加或减少编码活性的技术或修饰基因在体内的表达 。我们在这里概述一些技术，可以快速，无标记地删除单个，或者重复删除几个连续的从 T的序列。 kodakarensis 基因组。我们的程序包括构建转化所必需的质粒DNA的细节，所述质粒DNA通过同源重组指导整合到基因组中，鉴定已经整合了质粒序列的菌株（称为中间菌株）和确认质粒切除，导致最终菌株中的目标基因。可以使用几乎相同的程序来修饰而不是删除基因组基因座。
【背景】古细菌常常在看起来荒凉和迅速变化的环境中繁衍生息。古菌基因组的分析揭示了大量的代谢策略，预测了复杂和高度相互依赖的基因表达的调控网络，并揭示了许多基因，其蛋白质和日益稳定的RNA产物缺乏确定的功能。通过遗传操作挑战现有的和定义新的途径的能力已经辅助了古细菌生理学和信息处理系统的去卷积，并且最近开放了古细菌物种到合成和系统级的方法来定义细胞内和细胞间网络。 ...
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| Spectrophotometric Determination of Glutamine Synthetase Activity in Cultured Cells
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Date:
2016-10-05
[Abstract] Glutamine synthetase (GS), which catalyzes the conversion of glutamate and ammonia to glutamine, is widely distributed in animal tissues and cell culture lines. The importance of this enzyme is suggested by the fact that glutamine, the product of GS-catalyzed de novo synthesis reaction, is the most abundant free amino acid in blood (Smith and Wilmore, 1990). Glutamine is involved in many biological processes including serving as the nitrogen donor for biosynthesis, as an exchanger for the import of essential amino acids, as a means to detoxifying intracellular ammonia and glutamate, and as a ...
[摘要] 谷氨酰胺合成酶（GS），其催化谷氨酸和氨转化成谷氨酰胺，广泛分布在动物组织和细胞培养系中。该酶的重要性通过谷氨酰胺，GS-催化的从头合成反应的产物，是血液中最丰富的游离氨基酸的事实提示（Smith和Wilmore，1990）。谷氨酰胺参与许多生物过程，包括作为生物合成的氮供体，作为输入必需氨基酸的交换剂，作为解毒细胞内氨和谷氨酸的手段，以及作为生物能量营养物来给三羧酸（TCA）周期（Bott等人，2015）。用于测定GS酶活性的方法依赖于其γ-谷氨酰转移酶反应，通过测量由谷氨酰胺和羟胺合成的γ-谷氨酰羟肟酸酯，以及反应产物与反应物的色谱分离（Deuel等人 。，1978）。 GS谷氨酰转移酶反应的概述可以在图1中找到。通过分光光度测定法在560nm的特定波长下使用酶标仪测量GS活性。该方法简单，并且具有与应用放射性标记的底物的那些方法相当的灵敏度。该修改的方法已经应用于在包括人乳腺上皮MCF10A细胞和鼠前B FL5.12细胞的培养细胞系中测定/测定GS活性，并且可以用于测量其他细胞系中的GS活性。 >
图1 。GS glutamyl ...
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