| Structural Analysis of Target Protein by Substituted Cysteine Accessibility Method
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Author:
Date:
2018-09-05
[Abstract] Substituted Cysteine Accessibility Method (SCAM) is a biochemical approach to investigate the water accessibility or the spatial distance of particular cysteine residues substituted in the target protein. Protein topology and structure can be annotated by labeling with methanethiosulfonate reagents that specifically react with the cysteine residues facing the hydrophilic environment, even within the transmembrane domain. Cysteine crosslinking experiments provide us with information about the distance between two cysteine residues. The combination of these methods enables us to obtain ...
[摘要] 取代半胱氨酸可及性方法（SCAM）是一种生物化学方法，用于研究目标蛋白中取代的特定半胱氨酸残基的水可及性或空间距离。蛋白质拓扑和结构可以通过用甲硫代磺酸盐试剂标记来注释，所述甲硫基磺酸盐试剂特异性地与面向亲水环境的半胱氨酸残基反应，甚至在跨膜结构域内。半胱氨酸交联实验为我们提供了关于两个半胱氨酸残基之间距离的信息。这些方法的组合使我们能够获得有关靶蛋白结构变化的信息。在这里，我们描述了使用SCAM进行结构分析的详细协议。
【背景】结构分析提供了关于靶蛋白功能的关键信息。 X射线晶体学和核磁共振已被用作生物学领域中的高分辨率蛋白质结构分析方法。然而，这些方法需要以非常高的浓度从膜中提取的纯化蛋白质用于膜蛋白的结构分析。取代半胱氨酸可及性方法（SCAM）是一种生化方法，用于分析目标蛋白中取代的特定半胱氨酸残基的水可及性和空间距离。使用特异性地与面向亲水环境的半胱氨酸残基反应的甲硫代磺酸盐（MTS）试剂，我们可以注释目标蛋白的拓扑结构和结构。由于标记试剂 N - 生物素氨基乙基甲硫基磺酸盐（MTSEA-生物素）对质膜是不可渗透的（Seal et ...
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| Quantification of Trypanosoma cruzi in Tissue and Trypanosoma cruzi Killing Assay
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Author:
Date:
2017-11-20
[Abstract] Infection with Trypanosoma cruzi causes Chagas disease. The methods provided here allow for the quantification of T. cruzi in the liver, heart, and blood of intraperitoneally-infected mice and analysis of the killing activity of the cells infected with T. cruzi in vitro.
[摘要] 感染克氏锥虫（Trypanosoma cruzi）引起恰加斯病（Chagas disease）。 这里提供的方法允许量化T。 克氏锥虫在感染腹腔的小鼠的肝脏，心脏和血液中分析，并分析克氏锥虫在体外感染的细胞的杀伤活性。
【背景】以慢性心肌病为特征的恰加斯病是由细胞内原生动物寄生虫克氏锥虫感染引起的（Bonney等人，2015年）。拉丁美洲大约有2000万人患有南美锥虫病（里贝罗等人，2012; Flavia Nardy等人，2015），已成为全球性的健康问题由于感染者的迁移（Andrade等人，2014; Garcia等人，2015; Requena-Mendez等人）， 2015年）。已经开发了几种药物，如nifurtimox和benznidazole，用于治疗恰加斯病。然而，这些药物需要服用数月，并有严重的副作用（Viotti et al。，2009）。治疗的主要目的是抑制T。克鲁兹通过血液传播以及防止心力衰竭的发展。因此，定量T的协议。 cruzi 和 T。这里介绍的克鲁兹杀螨试验可能有助于发展南美锥虫病的新型诊断方法和治疗策略。
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| Measurement of Glucose-6-phosphate Dehydrogenase Activity in Bacterial Cell-free Extracts
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Author:
Date:
2016-10-05
[Abstract] Glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PDH) (EC 1.1.1.49) is the first enzyme of the oxidative pentose phosphate cycle and catalyses the conversion of glucose-6-phosphate (G6P) to 6-phosphoglucono-δ-lactone and transfers one electron to NADP+ producing one NADPH. Conversion of G6P to 6-phosphoglucono-δ-lactone is proportional to the production of NADPH. The increase in NADPH concentration results in an increase in absorbance at 340 nm. To assay G6PDH activity, therefore, production of NADPH is determined by measuring increase in absorbance at 340 nm spectrophotometrically. This ...
[摘要] 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G6PDH）（EC 1.1.1.49）是氧化戊糖磷酸循环的第一个酶，并催化葡萄糖-6-磷酸（G6P）转化为6-磷酸葡萄糖酸-δ-内酯并将一个电子 到NADP +产生一种NADPH。 G6P向6-磷酸葡萄糖酸-δ-内酯的转化与NADPH的产生成比例。 NADPH浓度的增加导致340nm处吸光度的增加。 因此，为了测定G6PDH活性，通过分光光度法测量340nm处吸光度的增加来确定NADPH的产生。 然后将该增加速率转化为G6PDH的活性和比活性的单位。 在该程序中，给出了强调蓝细菌集胞藻的细菌G6PDH测定的一般方法。 PCC6803（Schaeffer和Stanier，1978; Karakaya等人，2008，2012）和异养细菌大肠杆菌（Hylemon和Phibbs，1972; Barnel等人 ，1990）。
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