| Automatic Leaf Epidermis Assessment Using Fourier Descriptors in Texture Images
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Author:
Date:
2017-12-05
[Abstract] The identification of plant species is not a trivial task, since it is carried out by experts and depends on the presence of fruits, flowers and leaves. However, fruits and flowers are not available throughout the year, while leaves are accessible most of the year. In order to assist the specialized work of species identification, methods of texture image analysis are used to extract characteristics from samples of imaged leaves and thus predict the species. Texture image analysis is a versatile and powerful technique able to extract measurements from patterns in the images. Using this ...
[摘要] 植物种类的鉴定不是一项微不足道的任务，因为它是由专家进行的，取决于水果，花和叶子的存在。然而，水果和鲜花全年都不可用，而叶子一年中大部分时间都可以使用。为了辅助物种鉴定的专业工作，纹理图像分析的方法被用来从成像叶片的样本中提取特征，从而预测物种。纹理图像分析是一种多功能且功能强大的技术，能够从图像中的图案中提取测量结果。使用这种技术，最近的研究发现了纹理和植物物种之间的密切关系（da Silva et al。，2015和2016）。在这里，我们描述了使用傅里叶（Cosgriff，1960; Azencott，1997;冈萨雷斯和伍兹，2006）从叶片的显微图像中提取纹理特征的程序。强调其他纹理提取方法也是很重要的。
该协议分为两部分：（A）叶表皮解离和（B）叶表皮图像分析的自动方法。
【背景】Franklin（1945）描述了植物材料解离的方案，植物解剖学家已经适应了叶表皮解离的方法。解离方法使得表皮细胞的可视化以及其附着物比透明化和表皮印迹方法更清晰。除了本文所述的解离方法之外，还有其他方法使用Jeffrey's溶液（铬酸和硝酸的1：1溶液，各为10％）或者仅使用硝酸（Johansen，1940），但是这些方法使用强酸等危害人体健康和环境。此外，根据我们的经验，与富兰克林溶液的表皮分离对更多数量的物种更有效。
由于叶表皮性状具有很高的分类学价值，因此纹理分析是一种功能强大的技术，可以从图像的图案中提取测量结果，因此表皮图像的纹理分析可以成为植物鉴定的合适方法。在（da ...
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| Resin-embedded Thin-section Immunohistochemistry Coupled with Triple Cellular Counterstaining
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Author:
Date:
2017-04-05
[Abstract] This protocol was developed to study protein localisation within the vascular bundles of developing tomato fruit however, it can be applied to any resin embedded plant tissue. The vascular bundle is comprised of many different cells that all have unique properties. The mature sieve elements are enucleated and contain sieve plates that comprise of callose. This method has utilised these properties of the sieve element by combining immunohistochemistry for cell wall invertase with counterstaining of aniline blue for callose, DAPI for nucleus and cell structure is shown with the final staining ...
[摘要] 该方案被开发用于研究番茄果实的维管束内的蛋白质定位，但可应用于任何树脂嵌入植物组织。 血管束由许多不同的细胞组成，它们都具有独特的特性。 成熟的筛分元素被去核并含有包含胼lose质的筛板。 该方法通过将细胞壁转化酶的免疫组织化学与苯胺蓝复染以胼cal质结合使用筛选元件的这些性质，细胞核的DAPI和细胞结构用细胞壁的最终染色显示为calcofluor白色。 必须注意的是，按照本协议，这些部分至关重要的是使用明胶平坦固定在滑块上，因此盖板滑移不会移动样品部分。 该方案将适用于所有植物组织，并通过进行复染试验，提供细胞内蛋白质定位的其他证据。
免疫定位一直是用于研究蛋白质在组织内的定位的方法。 该方案不仅局限于感兴趣的蛋白质，还涉及周围组织中的分子结构。 据信成熟的筛子元素被去核并且在筛板内具有丰富的胼cal质沉积。 因此，为了代表这些生物学现象，应用了复染程序。 由于本研究中感兴趣的蛋白质也被认为是定位在质外体中，进一步的复染显示蛋白质和细胞壁的共标记。
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| Transverse Sectioning of Arabidopsis thaliana Leaves Using Resin Embedding
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Author:
Date:
2015-09-20
[Abstract] The leaf is the major functional part of the shoot performing the bulk of photosynthetic activity. Its development is relatively plastic allowing the plant to adapt to environmental changes by modifying leaf size and anatomy. Moreover, a leaf is made up of various distinct cell layers, each having specialized functions. To understand functional adaptation and the development of the leaf it is essential to obtain cross sections throughout leaf development and at maturity (Kalve et al., 2014). Here, we describe a protocol for transverse sectioning of Arabidopsis thaliana ...
[摘要] 叶是进行大量光合活性的枝条的主要功能部分。其发育是相对塑性的，允许植物通过改变叶的大小和解剖学适应环境变化。此外，叶片由各自不同的细胞层组成，每个细胞层具有专门的功能。为了理解功能适应和叶的发育，必须在叶发育和成熟期间获得横截面（Kalve等人，2014）。在这里，我们描述了使用树脂嵌入的拟南芥叶片的横切片的方案。这个协议提供了一个可靠的平台，产生高质量的横截面图像，允许研究横跨叶片横向轴线的各种组织层的发展。因为该方法是Beeckman和Viane（1999）和De Smet等人（2004）为拟南芥根尖所开发的方案的改编，所以它可以容易地修改以适应其他器官和物种。
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