| Bacterial Lawn Avoidance and Bacterial Two Choice Preference Assays in Caenorhabditis elegans
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Author:
Date:
2020-05-20
[Abstract] Physical avoidance of pathogens is a crucial defense strategy used by the host to reduce pathogen infection. Hosts display the use of multiple strategies to sense and avoid pathogens, ranging from olfaction to sensing of damage caused by pathogen infection. Understanding various mechanisms of pathogen avoidance has the potential to uncover conserved host defense responses that are important against pathogen infections. Here, we describe protocols for studying pathogen lawn avoidance behavior as well as a change of bacterial preferences in the model nematode Caenorhabditis elegans. ...
[摘要] [摘要 ] 物理避免病原体是宿主减少病原体感染的关键防御策略。主持人展示了使用多种策略来感知和避免病原体，从嗅觉到感知由病原体感染引起的损害。了解避免病原体的各种机制有可能揭示保守的宿主防御反应，这些反应对病原体感染很重要。在这里，我们描述协议研究线虫秀丽隐杆线虫模型中的病原体避免草坪行为以及细菌偏好的变化的协议 。此外，我们描述了在病原菌上对动物进行训练后测量病原性和非病原性细菌偏好的协议。这些测定法可用于发现宿主学习的各种机制，从而避免病原体。
[背景 ] 一种宿主使用多个策略来抵御病原体感染（Medzhitov 等人，2012）。物理规避病原体是宿主使用的各种防御策略之一（Medzhitov 等，2012；Kavaliers 等，2019； Singh和Aballay ，2020）。在检测到细菌毒素后，不同的感觉机制（包括化学感受和伤害感受神经元引起的疼痛诱发）会导致回避行为。对导致病原体回避的机制的更深入了解，有可能揭示保守的宿主防御反应，这些反应对病原体感染很重要。
线虫秀丽隐杆线虫已被广泛用于理解病原体回避行为和相关学习。秀丽隐杆线虫似乎使用多种机制来了解导致逃避行为的诱因的病原体（Singh和Aballay ，2020年）。秀丽隐杆线虫可以感知细菌代谢产物（Tran 等，2017）以及核心细胞活动的扰动（Melo ...
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| Immunofluorescence Analysis of Human Endocervical Tissue Explants Infected with Neisseria gonorrhoeae
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Author:
Date:
2018-02-05
[Abstract] Colonization and penetration of the epithelium is the infection-initiating route of mucosal pathogens. The epithelium counteracts infection by eliciting host cell responses while maintaining the mucosal barrier function. The obligate human sexually transmitted bacterium Neisseria gonorrhoeae, or gonococcus (GC) infects the female reproductive tract primarily from the endocervical epithelium. Due to lack of an infection model that mimics all aspects of human infections in the female reproductive tract, GC pathogenesis is poorly understood. This protocol takes advantage of the ...
[摘要] 上皮的定植和穿透是粘膜病原体的感染启动途径。 上皮细胞通过引发宿主细胞应答来抵抗感染，同时维持粘膜屏障功能。 专性人类性传播细菌淋病奈瑟氏球菌或淋球菌属（GC）主要从宫颈内膜上皮感染女性生殖道。 由于缺乏模仿女性生殖道人类感染的各个方面的感染模型，GC发病机制知之甚少。 该方案利用培养物中繁殖的人宫颈组织的生存力和功能完整性来产生体外感染模型。 这种组织模型保持了感染目标和环境的性质，而没有任何操作，如病毒永生化上皮细胞。 使用免疫荧光显微镜，分析GC与子宫颈上皮细胞的相互作用。
【背景】淋病奈瑟菌（GC）感染人类生殖器上皮，引起淋病，一种常见的性传播感染。女性感染可导致严重的并发症，如盆腔炎，引起输卵管瘢痕和堵塞，易发生异位妊娠或不孕。由于抗生素耐药菌株的流行率增加，淋病又成为重要的公共卫生问题。由于人类是GC的唯一宿主，因此缺乏模仿人类感染各个方面的感染模型是推进我们对GC发病机理的理解的主要障碍。我们建立了人宫颈组织外植体模型和免疫荧光显微镜分析来检测GC感染妇女GC感染的主要部位人间宫颈细胞的机制。这种体外模型保持了宫颈上皮细胞的正常细胞构筑和组织完整性。使用这种模型和免疫荧光分析，我们表明，气相色氨酸定居和渗透到子宫颈组织，在那里他们可能导致症状和播散性淋球菌感染。 ...
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| Expression and Purification of the Cas10-Csm Complex from Staphylococci
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Author:
Date:
2017-06-05
[Abstract] CRISPR-Cas (Clustered regularly interspaced short palindromic repeats-CRISPR-associated proteins) is a class of prokaryotic immune systems that degrade foreign nucleic acids in a sequence-specific manner. These systems rely upon ribonucleoprotein complexes composed of Cas nucleases and small CRISPR RNAs (crRNAs). Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus aureus are bacterial residents on human skin that are also leading causes of antibiotic resistant infections (Lowy, 1998; National Nosocomial Infections Surveillance, 2004; Otto, 2009). Many staphylococci possess Type ...
[摘要] CRISPR-Cas（聚集的定期间隔的短回文重复-CRISPR相关蛋白）是一类以序列特异性方式降解外来核酸的原核免疫系统。这些系统依赖于由Cas核酸酶和小型CRISPR RNA（crRNA）组成的核糖核蛋白复合物。表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌是人皮肤上的细菌居民，也是抗生素抗性感染的主要原因（Lowy，1998; National Nosocomial Infection Surveillance，2004; Otto，2009） 。许多葡萄球菌具有III型A CRISPR-Cas系统（Marraffini和Sontheimer，2008; Cao等人，2016），已被证明可预防质粒转移并防止病毒性捕食者（Goldberg这些生物体中，等等，2014; Hatoum-Aslan等人，2014; Samai等人，2015）。因此，在天然葡萄球菌背景中获得对这些系统的机械理解可以导致对影响这些病原体的进化和存活的因素的重要见解。 III-A型CRISPR-Cas系统编码称为Cas10-Csm的五亚单位效应复合物（Hatoum-Aslan等人，2013）。在这里，我们描述了一种用于表达和纯化Cas10-Csm的方法。表皮样背景或异源性S。金黄色葡萄球菌背景。该方法由两步纯化方案组成，包括Ni 2 + - ...
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