| Plant Assays for Quantifying Ralstonia solanacearum Virulence
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Author:
Date:
2018-09-20
[Abstract] Virulence assays are powerful tools to study microbial pathogenesis in vivo. Good assays track disease development and, coupled with targeted mutagenesis, can identify pathogen virulence factors. Disease development in plants is extremely sensitive to environmental factors such as temperature, atmospheric humidity, and soil water level, so it can be challenging to standardize conditions to achieve consistent results. Here, we present optimized and validated experimental conditions and analysis methods for nine assays that measure specific aspects of virulence in the phytopathogenic ...
[摘要] 毒力测定是研究体内微生物发病机制的有力工具。 良好的分析跟踪疾病发展，并结合定向诱变，可以识别病原体毒力因子。 植物的疾病发展对环境因素如温度，大气湿度和土壤水位极其敏感，因此标准化条件以获得一致的结果可能具有挑战性。 在这里，我们提出优化和验证的实验条件和分析方法的九个测定，测量植物病原细菌 Ralstonia solanacearum 的毒力的特定方面，使用番茄作为模型宿主植物。
【背景】 Ralstonia solanacearum 是一种土壤传播的细菌，在广泛的植物中引起细菌枯萎，并继续感染全球的新宿主（Hayward，1991; Elphinstone，2005; Wicker et al。 ，2007; Genin，2010; Weibel et al。，2016）。结果， R. solanacearum 是研究最深入的植物致病菌之一（Mansfield et al。，2012）。
R上。 solanacearum 可以长期存在于土壤或水库中（Alvarez et ...
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| Quantification of Root Colonizing Bacteria
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Author:
Date:
2018-07-20
[Abstract] Here we describe a simple method to quantify the number of viable bacteria (e.g., Enterobacter sp. SA187) that colonize the root system of Arabidopsis thaliana.
[摘要] 在这里，我们描述了一种简单的方法来量化活菌的数量（例如， Enterobacter sp。SA187），它们定殖于拟南芥的根系。。
【背景】接种细菌对根的定殖是有益细菌与宿主植物之间相互作用的重要步骤。 肠杆菌 sp。 SA187是一种内生细菌，已从土着沙漠植物 Indigofera argentea 的根瘤中分离出来（Andrés-Barrao et al。，2017; Lafi et al。 ，2017）。 SA187在不同的非生物胁迫（如盐度，干旱或高温）下促进模式植物拟南芥的生长，证明了作为植物生长促进细菌（PGPR）用于提高非生物抗性和产量的重要潜力。干旱地区的农作物SA187可以定殖 A的根和芽。在½MS琼脂平板或土壤中的拟南芥（deZélicourt et al。，2018）。跟踪接种菌株SA187在非寄主植物 A上的命运。 thaliana ，我们应用了常规的培养依赖方法。该方案已成功用于抵抗 A的根和芽的细菌数量。拟南芥植物在不同的非生物胁迫下（deZélicourt et al。，2018）。
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| Quantification of Bacterial Twitching Motility in Dense Colonies Using Transmitted Light Microscopy and Computational Image Analysis
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Author:
Date:
2018-04-20
[Abstract] A method was developed to allow the quantification and mapping of relative bacterial twitching motility in dense samples, where tracking of individual bacteria was not feasible. In this approach, movies of bacterial films were acquired using differential interference contrast microscopy (DIC), and bacterial motility was then indirectly quantified by the degree to which the bacteria modulated the intensity of light in the field-of-view over time. This allowed the mapping of areas of relatively high and low motility within a single field-of-view, and comparison of the total distribution of ...
[摘要] 开发了一种方法，可以对密集样本中的相对细菌抽动动力进行定量和绘图，在这些样本中追踪单个细菌是不可行的。 在这种方法中，使用微分干涉对比显微镜（DIC）获得细菌膜的电影，然后通过细菌随时间调节视场中的光强度的程度间接量化细菌运动。 这允许在单个视场内绘制相对较高和较低运动性的区域，并比较样本之间运动的总分布。
【背景】Pilus介导的颤动运动表示与鞭毛无关的与表面相关的细菌运动形式。抽动动力被很多细菌病原体利用，包括淋病奈瑟氏球菌和铜绿假单胞菌与潮湿的表面相互作用并移位上皮屏障。在 P。颤动动力受大量基因调控，这些基因允许IV型菌毛的延伸和回缩，以有效地将细菌细胞拖过任何给定的表面以响应环境提示（Mattick，2002; Whitchurch et al。，2004; Burrows，2005）。在我们对 P的研究中。绿脓杆菌发病机制，抽动运动性有助于细菌在内化和多层角膜上皮细菌穿过后从上皮细胞排出（Alarcon等人，2009）。在角膜感染的小鼠模型中，抽动运动对于P是重要的。绿脓杆菌毒力（Zolfaghar et al。，2003）。最近，我们发现在粘膜液体如人眼泪和唾液中发现的糖蛋白DMBT1能够抑制P细胞。绿脓杆菌抽动动力（Li等人，2017）。在那项研究中，我们利用了一种新方法来快速和可靠地量化P.绿脓杆菌抽动动力。该协议在此处介绍。
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