| Ex vivo Whole-cell Recordings in Adult Drosophila Brain
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Author:
Date:
2018-07-20
[Abstract] Cost-effective and efficient, the fruit fly (Drosophila melanogaster) has been used to make many key discoveries in the field of neuroscience and to model a number of neurological disorders. Great strides in understanding have been made using sophisticated molecular genetic tools and behavioral assays. Functional analysis of neural activity was initially limited to the neuromuscular junction (NMJ) and in the central nervous system (CNS) of embryos and larvae. Elucidating the cellular mechanisms underlying neurological processes and disorders in the mature nervous system have been ...
[摘要] 果蝇（ Drosophila melanogaster ）具有成本效益和效率，已被用于在神经科学领域进行许多重要发现并模拟许多神经疾病。使用复杂的分子遗传工具和行为测定已经在理解方面取得了很大进展。神经活动的功能分析最初仅限于神经肌肉接头（NMJ）和胚胎和幼虫的中枢神经系统（CNS）。阐明成熟神经系统中神经过程和病症潜在的细胞机制由于难以从成人大脑中的神经元记录而更具挑战性。为此目的，我们开发了一种离体制剂，其中从成年蝇的头部胶囊中分离出全脑并将其置于记录室中。通过这种制备，可以将成年大脑中鉴定的神经元的全细胞记录与遗传，药理学和环境操作相结合，以探索神经元功能和功能障碍的细胞机制。它还作为评估通过用于治疗神经疾病的行为测定法鉴定的新疗法的作用机制的重要平台。在这里，我们提出了成人 Drosophila 脑中离体制剂和全细胞记录的方案。
【背景】果蝇（ Drosophila melanogaster ）已被用于在神经科学的各个基本领域（包括学习和记忆）中取得重要发现（Bolduc et al。，2008; Cervantes- Sandoval et al。，2016），突触形成和调节（Genç et al。，2017）和昼夜节律（Allada et al。 ，1998; Guo et ...
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| Biochemical Analysis of Dimethyl Suberimidate-crosslinked Yeast Nucleosomes
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Author:
Date:
2018-03-20
[Abstract] Nucleosomes are the fundamental unit of eukaryotic chromosome packaging, comprised of 147 bp of DNA wrapped around two molecules of each of the core histone proteins H2A, H2B, H3, and H4. Nucleosomes are symmetrical, with one axis of symmetry centered on the homodimeric interaction between the C-termini of the H3 molecules. To explore the functional consequences of nucleosome symmetry, we designed an obligate pair of H3 heterodimers, termed H3X and H3Y, allowing us to compare cells with single or double H3 alterations. Our biochemical validation of the heterodimeric X-Y interaction included ...
[摘要] 核小体是真核染色体包装的基本单元，由围绕核心组蛋白H2A，H2B，H3和H4中的每一个的两个分子包裹的147bp DNA组成。 核小体是对称的，一个对称轴以H3分子的C-末端之间的同源二聚体相互作用为中心。 为了探索核小体对称性的功能性后果，我们设计了一对特异性H3异二聚体，称为H3X和H3Y，使我们能够比较具有单一或双重H3改变的细胞。 我们对异二聚体X-Y相互作用的生物化学验证包括使用二甲基琥珀三酸酯（DMS）进行的核内H3交联。 在这里，我们提供了使用DMS来分析酵母核小体的详细方案。
【背景】组蛋白的翻译后修饰影响染色体生物学的各个方面，包括转录，复制，修复和重组。因为核小体包含每个核心组蛋白的两个拷贝，所以修饰可以是对称的（在两个H3尾部上的相同修饰，例如，在核小体内的两个H3尾部上的K27me（Voigt等人
对于单个核小体内H3X-H3Y相互作用的生化验证，我们生成了表达细菌生物素连接酶BirA，N-末端V5-标记的H3X和N-末端生物素接受表位标记的H3Y的酵母菌株（Beckett等人， 1999）。 ...
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| Measuring Mitochondrial ROS in Mammalian Cells with a Genetically Encoded Protein Sensor
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Author:
Date:
2018-01-20
[Abstract] Reactive oxygen species (ROS) are not only known for their toxic effects on cells, but they also play an important role as second messengers. As such, they control a variety of cellular functions such as proliferation, metabolism, differentiation and apoptosis. Thus, ROS are involved in the regulation of multiple physiological and pathophysiological processes. It is now apparent that there are transient and local changes in ROS in the cell; in so-called ‘microdomains’ or in specific cellular compartments, which affect signaling events. These ROS hotspots need to be studied in more depth to ...
[摘要] 活性氧（ROS）不仅以其对细胞的毒性作用而闻名，而且作为第二信使也起着重要的作用。如此，它们控制多种细胞功能，例如增殖，代谢，分化和凋亡。因此，ROS参与多种生理和病理生理过程的调节。现在很明显，细胞内存在ROS的短暂和局部变化;在所谓的“微域”或特定的细胞区室中，其影响信号传导事件。这些ROS热点需要更深入的研究，以了解其功能和规定。因此，有必要以高空间和时间分辨率在单个细胞中识别和量化氧化还原信号。遗传编码的基于荧光的蛋白质传感器提供了检测氧化还原信号传导过程的必要工具。这些传感器的一个很大的优势是可以针对他们。线粒体是能量代谢所必需的，并且是哺乳动物细胞中ROS的主要来源之一。因此，对这些细胞器中氧化还原电位和ROS产生的评估是非常有意义的。在此，我们提供了一个使用H 2 O 2特异性比例传感器mitoHyPer在贴壁哺乳动物细胞中。【背景】ROS是通过线粒体呼吸的副产物，通过电子从电子传递链泄漏而产生的。这些ROS被认为是有毒的，并导致脂质，蛋白质的氧化，并导致线粒体DNA损伤（Ralph et al。，2010; Bogeski等人，2016; Bogeski ，2014; Monika et al。，2015）。虽然线粒体作为新陈代谢，生物能量学和细胞死亡的枢纽，线粒体ROS作为调节多种细胞功能的第二信使的新兴作用也日益被接受（Chandel，2015; ...
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