| Automated Analysis of Cerebrospinal Fluid Flow and Motile Cilia Properties in The Central Canal of Zebrafish Embryos
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Author:
Date:
2021-03-05
[Abstract] Circulation of cerebrospinal fluid (CSF) plays an important role during development. In zebrafish embryo, the flow of CSF has been found to be bidirectional in the central canal of the spinal cord. In order to compare conditions and genetic mutants across each other, we recently automated the quantification of the velocity profile of exogenous fluorescent particles in the CSF. We demonstrated that the beating of motile and tilted cilia localized on the ventral side of the central canal was sufficient to generate locally such bidirectionality. Our approach can easily be extended to ...
[摘要] [摘要]脑脊液（CSF）的循环在发育过程中起着重要的作用。在斑马鱼胚胎中，已发现脑脊液在脊髓中央管中是双向流动的。为了相互比较条件和遗传突变体，我们最近自动化了CSF中外源性荧光颗粒速度分布的定量。我们证明了位于中央管腹侧的运动性和倾斜纤毛的跳动足以产生局部这种双向性。我们的方法可以很容易地扩展以表征各种遗传突变体中的脑脊液流动。我们在此提供详细的协议和用户界面程序，以量化CSF动态。为了解释CSF流量曲线中的潜在变化，我们提供了其他工具来测量中央管直径，表征纤毛动力学并将实验数据与我们的理论模型进行比较，以评估纤毛对在中央管中产生体积力的影响。我们的方法也可用于测量体内的粒子速度并在各种生物溶液中模拟流量。
[背景]在斑马鱼胚胎中，从受精后24小时（hpf）开始在脊髓中央管中观察到脑脊液（CSF）的流动（Sternberg等，2018 ； Cantaut-Belarif等，2018 ）和更高版本。延伸到脑室（Olstad等人，2019）。在胚胎中央管中，CSF双向流动：朝向腹侧的尾巴和朝向背侧的头（Sternberg等人，2018; Cantaut-Belarif等人，2018; Thouvenin等人，2020）。这种双向性是由极化活动性纤毛的跳动引起的，该纤毛主要在中央管的腹侧区域中活动，从而驱动腹侧区域中的流体向尾端定向运动，并在背侧区域产生逆流。 ...
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| Use of Optogenetic Amyloid-β to Monitor Protein Aggregation in Drosophila melanogaster, Danio rerio and Caenorhabditis elegans
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Author:
Date:
2020-12-05
[Abstract] Alzheimer’s Disease (AD) has long been associated with accumulation of extracellular amyloid plaques (Aβ) originating from the Amyloid Precursor Protein. Plaques have, however, been discovered in healthy individuals and not all AD brains show plaques, suggesting that extracellular Aβ aggregates may play a smaller role than anticipated. One limitation to studying Aβ peptide in vivo during disease progression is the inability to induce aggregation in a controlled manner. We developed an optogenetic method to induce Aβ aggregation and tested its biological influence in ...
[摘要] [摘要]Alzheimer'sdisease（AD）长期以来与淀粉样前体蛋白产生的细胞外淀粉样斑块（Aβ）的积聚有关。然而，在健康人身上发现了斑块，并不是所有的AD大脑都有斑块，这表明细胞外Aβ聚集体的作用可能比预期的要小。在疾病进展过程中研究Aβ肽的一个局限性是无法以可控的方式诱导聚集。我们开发了一种诱导Aβ聚集的光遗传学方法，并在三种模式生物中测试了其生物学效应：D.melanogaster、C.elegans和D.rerio。我们产生了一个荧光标记的，光生的
一种β肽，在所有生物体内，在蓝光存在下迅速寡聚。在这里，我们详细介绍了在动物模型中表达该融合蛋白的程序，使用延时光片显微镜研究对神经系统的影响，并进行代谢分析来测量由于细胞内Aβ聚集而引起的变化。这种方法利用光遗传学来研究AD的病理学，实现了目前任何其他方法都无法实现的体内时空控制。
[背景]阿尔茨海默病（AD）是一种衰弱的、与年龄相关的神经退行性疾病（Zhang等人，2011年；De ...
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| Zebrafish Embryo Xenograft and Metastasis Assay
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Author:
Date:
2018-09-20
[Abstract] Xenograft models, and in particular the mouse xenograft model, where human cancer cells are transplanted into immunocompromised mice, have been used extensively in cancer studies. Although these models have contributed enormously to our understanding of cancer biology, the zebrafish xenograft model offers several advantages over the mouse model. Zebrafish embryos can be easily cultured in large quantities, are small and easy to handle, making it possible to use a high number of embryos for each experimental condition. Young embryos lack an efficient immune system. Therefore the injected ...
[摘要] 异种移植模型，特别是小鼠异种移植模型，其中人癌细胞被移植到免疫受损小鼠中，已广泛用于癌症研究。尽管这些模型对我们对癌症生物学的理解做出了巨大贡献，但斑马鱼异种移植模型与鼠标模型相比具有多种优势。斑马鱼胚胎可以很容易地大量培养，体积小且易于处理，因此可以在每种实验条件下使用大量胚胎。年轻的胚胎缺乏有效的免疫系统。因此，注射的癌细胞不被排斥，并且原发性肿瘤和微转移的形成是快速的。胚胎的透明度使得能够在完整和活的胚胎中对原发性肿瘤和转移瘤进行成像。在这里，我们描述了一种方法，其中表达GFP的肿瘤细胞被注射到斑马鱼胚胎的心包空间。在注射后4天，对胚胎成像并分析原发性肿瘤和远端微转移的形成。
【背景】 斑马鱼（ Danio rerio ）是一种小型淡水鱼，不仅在发育生物学中，而且在生物医学中越来越受欢迎。快速发展的领域之一是使用斑马鱼作为癌症生物学研究的模型。斑马鱼高效可靠地交配，可以产生大量小，透明，外部发育的后代，可以在例如，多孔板中轻松培养（White et al。 >，2013）。有趣的是，人类肿瘤细胞可以植入斑马鱼胚胎中，许多异种移植物能够通过在胚胎中生长，侵入和转移来忠实地重演它们的恶性行为（Lee et al。，2005; Nicoli et al。，2007; Chapman et ...
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