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Eppendorf Research® plus

200-µl pipet

公司名称: Eppendorf
产品编号: 3123000055
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Preserve Cultured Cell Cytonemes through a Modified Electron Microscopy Fixation
Author:
Date:
2018-07-05
[Abstract]  Immunocytochemistry of cultured cells is a common and effective technique for determining compositions and localizations of proteins within cellular structures. However, traditional cultured cell fixation and staining protocols are not effective in preserving cultured cell cytonemes, long specialized filopodia that are dedicated to morphogen transport. As a result, limited mechanistic interrogation has been performed to assess their regulation. We developed a fixation protocol for cultured cells that preserves cytonemes, which allows for immunofluorescent analysis of endogenous and ... [摘要]  培养细胞的免疫细胞化学是用于确定细胞结构内蛋白质的组成和定位的常用且有效的技术。 然而,传统的培养细胞固定和染色方案不能有效地保存培养的细胞色素,长期专门用于形态发生转运的丝状伪足。 结果,进行了有限的机械审讯以评估其监管。 我们开发了一种用于培养细胞的固定方案,该方案保留了细胞质,允许对内源性和过表达的蛋白质进行免疫荧光分析,这些蛋白质定位于脆弱的细胞结构。

【背景】Cytonemes被分类为薄的(~200nm直径)基于肌动蛋白的丝状伪足,长度超过2μm,可以转运形态发生素(Ramírez-Weber和Kornberg,1999)。这些信号结构首先在发育中的 Drosophila 翼成像盘中进行了详细分类和描述,随后在小鼠,小鸡和斑马鱼模型生物中进行了观察(Ramírez-Weber和Kornberg,1999; Sanders et al。,2013; Stanganello et al。,2015)。在大多数情况下,只有对过表达的荧光标记蛋白进行实时成像才能进行细胞色素检测。由于传统的固定方案未能保存这些脆弱的细丝,因此对培养细胞的细胞色素的检查受到限制。这些并发症一直是决定在发育和组织稳态期间驱动细胞色素形成和功能的细胞机制以及确定这些过程是否在疾病中被破坏的限制因素。

为了克服这些限制,我们开发了一种基于修饰电子显微镜固定剂(MEM-fix)的方案,该方案可以保留培养细胞的细胞质。 ...

Primary Cultures from Human GH-secreting or Clinically Non-functioning Pituitary Adenomas
Author:
Date:
2018-04-05
[Abstract]  Pituitary adenomas are among the more frequent intracranial tumors usually treated with both surgical and pharmacological–based on somatostatin and dopamine agonists–approaches. Although mostly benign tumors, the occurrence of invasive behaviors is often detected resulting in poorer prognosis. The use of primary cultures from human pituitary adenomas represented a significant advancement in the knowledge of the mechanisms of their development and in the definition of the determinants of their pharmacological sensitivity. Moreover, recent studies identified also in pituitary adenomas putative ... [摘要]  垂体腺瘤是更常见的颅内肿瘤之一,通常用基于生长抑素和多巴胺激动剂手术的手术和药物治疗。 虽然多为良性肿瘤,但侵入性行为的发生常常被检测到,导致预后较差。 来自人类垂体腺瘤的原代培养物的使用代表了对其发育机制的知识以及其药理敏感性决定因素的定义方面的显着进步。 此外,最近的研究也在垂体腺瘤中发现了假定的肿瘤干细胞,根据目前的假设,它代表了根除大多数恶性肿瘤的真实细胞靶标。 在这个协议中,我们描述了从人垂体腺瘤建立原代培养的程序,以及如何选择,体外扩增和表型鉴定推定的垂体腺瘤干细胞。

【背景】垂体腺瘤是最常见的颅内肿瘤之一(高达15%),横断面研究发现每100,000名居民中约有90例发病,其中绝大多数为30岁以上的成年人。大约10%的未经选择的垂体在尸检时进行了检查(即考虑到之前未诊断为垂体疾病的受试者的垂体)( ,Molitch,2017)。尽管通常为良性肿瘤,但垂体腺瘤的处理可因与激素分泌过多相关的临床综合征或发展以治疗抗性,高增殖率,快速复发和绒毛外侵袭为特征的侵袭行为而复杂化(Carreno等人,2017)。成年垂体干细胞的持续存在(Florio,2011)导致垂体腺瘤(以及可能的其他良性瘤形成)的发展可以源自具有干细胞特性(主要是自我更新和分化)的肿瘤细胞的亚群能力),正如已经建立的恶性固体和血液肿瘤一样。

最近的实验证据表明,癌症干细胞(CSC)范例也适用于人和小鼠垂体腺瘤(Donangelo等人,2014; ...

Isolation of Nuclei in Tagged Cell Types (INTACT), RNA Extraction and Ribosomal RNA Degradation to Prepare Material for RNA-Seq
Author:
Date:
2018-04-05
[Abstract]  Gene expression is dynamically regulated on many levels, including chromatin accessibility and transcription. In order to study these nuclear regulatory events, we describe our method to purify nuclei with Isolation of Nuclei in TAgged Cell Types (INTACT). As nuclear RNA is low in polyadenylated transcripts and conventional pulldown methods would not capture non-polyadenylated pre-mRNA, we also present our method to remove ribosomal RNA from the total nuclear RNA in preparation for nuclear RNA-Seq. [摘要]  基因表达在多个水平上动态调节,包括染色质可及性和转录。 为了研究这些核调节事件,我们描述了我们用净化细胞核(INTACT)纯化细胞核的方法。 由于核RNA在聚腺苷酸化转录物中低并且常规下拉方法不会捕获非聚腺苷酸化前mRNA,所以我们还提出了我们的方法以从核RNA总RNA中去除核糖体RNA以准备核RNA-Seq。

【背景】分离用于基因表达实验的特定细胞类型降低了噪音并提高了实验的精确度和发现的不同表达基因的数量。用于细胞类型特异性研究的各种方法被广泛使用,每种方法都有其优点和缺点(Bailey-Serres,2013年综述)。分离特定的调控区室,如细胞核(来自细胞器,核糖体,细胞质,等等)可以进一步精确解析调控基因表达的分子事件。在这里,我们描述了一种方法,可以从冷冻组织中分离特定细胞类型的细胞核,适用于研究核基因表达的实验(例如,核RNA的RNA-Seq,ATAC-Seq,ChIP -Seq,等。)。此外,我们描述了RNA的处理,导致材料适合作为RNA-Seq实验的输入。这里描述的方案与水稻根组织(日本野生稻栽培品种日本晴)(Reynoso等人,2018年)一起使用,但是它们基于以前开发的方案, (拟订和Henikoff,2010年和2011年)和番茄(罗恩等人,2014年)。

该协议的第一部分,INTACT方法(用于标记特定细胞类型的核的分离)允许体内亲和标记和随后从感兴趣的细胞类型中纯化细胞核。这是通过由包膜靶向结构域,GFP和生物素连接酶识别肽(BLRP)组成的三联核标签融合蛋白(NTF)的细胞类型特异性表达实现的。 ...

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