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Date:
2017-12-05
[Abstract] Protein-peptide interactions are part of many physiological processes, for example, epigenetics where peptide regions of histone complexes are crucial for regulation of chromatin structure. Short peptides are often also used as alternatives to small molecule drugs to target protein complexes. Studying the interactions between proteins and peptides is thus an important task in systems biology, cell biology, biochemistry, and drug design. However, this task is often hampered by the drawbacks of classical biophysical methods for analysis of molecular interactions like surface plasmon resonance ...
[摘要] 蛋白质 - 肽相互作用是许多生理过程的一部分，例如表观遗传学，其中组蛋白复合物的肽区域对于染色质结构的调节是至关重要的。短肽通常也被用作小分子药物靶向蛋白质复合物的替代物。研究蛋白质和肽之间的相互作用是系统生物学，细胞生物学，生物化学和药物设计中的重要任务。然而，这一任务往往受到经典生物物理学方法分析分子间相互作用的缺陷的困扰，例如表面等离子体共振（SPR）或等温滴定量热法（ITC），其需要固定相互作用配偶体或非常高的样品浓度。 MicroScale热泳（MST）是一种创新的方法，可以确定分子间相互作用的重要参数，如解离常数，化学计量和热力学。而且，它可以快速准确地进行，可以自由选择缓冲液或生物液体，不需要固定样品，样品消耗也非常少。这里我们详细描述了两个MST测定法，其分析（i）真核RNA聚合酶II的某些肽段与真核转录延伸复合物的蛋白质亚基之间的相互作用和（ii）N-末端组蛋白尾肽与表观遗传学之间的相互作用读者蛋白质。这些实验表明，MST能够表征蛋白质 - 肽相互作用，这些相互作用仅由肽的微小变化触发，例如，在特定的丝氨酸残基处仅有一个磷酸化。
【背景】生物学背景：蛋白质 - ...
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