| Estimation of the Minimum Number of Replication Origins Per Chromosome in any Organism
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Author:
Date:
2020-10-20
[Abstract] Eukaryote nuclear genomes predominantly replicate through multiple replication origins. The number of replication origins activated per chromosome during the S-phase duration may vary according to many factors, but the predominant one is replication stress. Several studies have applied different approaches to estimate the number and map the positions of the replication origins in various organisms. However, without a parameter to restrict the minimum of necessary origins, less sensitive techniques may suggest conflicting results. The estimation of the minimum number of replication o ...
[摘要] [摘要] 比率可能因多种因素而变化，但最主要的因素是复制应力。一些研究应用了不同的方法来估计复制源在不同生物体中的数量和位置。然而，如果没有一个参数来限制必要起源的最小值，那么不太敏感的技术可能会产生相互矛盾的结果。估计每个染色体的最小复制源数量（MO）是一种创新的方法，它允许建立一个阈值，作为绘制起源的基因组方法的参数。为此，MO可以很容易地通过一个公式得到，这个公式需要作为参数：染色体大小、S期持续时间和复制率。在基因组数据库（如NCBI）中可以获得任何生物体的染色体大小，通过监测DNA复制来估计S期的持续时间，并通过DNA组合方法获得复制率。 提供了一种简单、快速的估算MO的方法一个新的方法学框架来协助研究任何有机体。
关键词： DNA复制，复制来源，复制率，S期持续时间，染色体大小
[背景] ...
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| Nuclear/Cytoplasmic Fractionation of Proteins from Caenorhabditis elegans
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Author:
Date:
2018-10-20
[Abstract] C. elegans is widely used to investigate biological processes related to health and disease. To study protein localization, fluorescently-tagged proteins can be used in vivo or immunohistochemistry can be performed in whole worms. Here, we describe a technique to localize a protein of interest at a subcellular level in C. elegans lysates, which can give insight into the location, function and/or toxicity of proteins.
[摘要] ℃。 线虫>广泛用于研究与健康和疾病相关的生物过程。 为了研究蛋白质定位，荧光标记的蛋白质可用于体内>或免疫组织化学可在整个蠕虫中进行。 在这里，我们描述了一种在 C中亚细胞水平定位感兴趣的蛋白质的技术。 线虫>裂解物，可以洞察蛋白质的位置，功能和/或毒性。
【背景】亚细胞分级已用于不同的模式生物中以鉴定和研究细胞核，细胞膜和细胞质中的蛋白质功能。 例如，当聚集倾向蛋白定位于细胞核或细胞质中时，它们的毒性可能更大（Kontopoulos et al。>，2006; Barmada et al。>，2010）。 在这里，我们提供了一个协议（改编自Chen et al。>，2000和La Rocca et al。>，2007）来定位的细胞核和细胞质组分中的特定蛋白质。>℃。线虫>。
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| Pentylenetetrazole (PTZ)-induced Convulsion Assay to Determine GABAergic Defects in Caenorhabditis elegans
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Author:
Date:
2018-09-05
[Abstract] Pentylenetetrazole (PTZ) is a GABAA receptor antagonist and is used to monitor presynaptic defects in the release of the inhibitory neurotransmitter GABA. PTZ is a competitive inhibitor of GABA, and prevents binding of GABA on the GABAA receptors present on the surface of muscle. In the absence of GABA binding, the excitatory to inhibitory signal ratio increases resulting in a convulsive phenotype. This assay provides a fast and reliable method to detect presynaptic defects in GABAergic synaptic transmission. The assay is based on correlating the extent of convulsions ...
[摘要] 戊四唑（PTZ）是GABA A 受体拮抗剂，用于监测抑制性神经递质GABA释放中的突触前缺陷。 PTZ是GABA的竞争性抑制剂，并且阻止GABA与肌肉表面上存在的GABA A 受体结合。 在没有GABA结合的情况下，抑制信号比的兴奋性增加导致惊厥表型。 该试验提供了一种快速可靠的方法来检测GABA能突触传递中的突触前缺陷。 该测定基于将惊厥的程度与突触前GABA释放缺陷的程度相关联。
【背景】突触是介导突触传递的不对称细胞间连接。它们构成了能够执行复杂行为的大脑电路的基本单元。动作电位的到达通过电压门控钙通道引起钙流入，导致质膜的去极化。在这种突触前去极化后，突触囊泡与质膜融合，通过高度控制的过程将其内容物释放到突触间隙中（Sudhof，1995; Sudhof，2004）。
运动是 Caenorhabditis elegans 中突出的行为输出。产生协调的背腹窦弯曲的神经回路允许 C中的正常运动。线虫。运动行为在多个层面上进行协调，并且涉及由中间神经元处理的多个感觉神经元整合多种感觉线索，并最终在神经肌肉接头（NMJ）处直接变化（de Bono和Maricq，2005; Bargmann，2012）。 C.线虫 NMJ有三个主要组成部分;兴奋性胆碱能运动神经元，抑制性GABA能神经运动神经元和突触后肌细胞（White et ...
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