| Characterizing the Transcriptional Effects of Endolysin Treatment on Established Biofilms of Staphylococcus aureus
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Author:
Date:
2018-06-20
[Abstract] Biofilms are the most common lifestyle of bacteria in both natural and human environments. The organized structure of these multicellular communities generally protects bacterial cells from external challenges, thereby enhancing their ability to survive treatment with antibiotics or disinfectants. For this reason, the search for new antibiofilm strategies is an active field of study. In this context, bacteriophages (viruses that infect bacteria) and their derived proteins have been proposed as promising alternatives for eliminating biofilms. For instance, endolysins can degrade peptidoglycan ...
[摘要] 生物膜是自然和人类环境中最常见的细菌生活方式。这些多细胞社区的有组织结构通常保护细菌细胞免受外部挑战，从而增强其抗生素或消毒剂治疗的生存能力。为此，寻找新的抗菌膜策略是一个积极的研究领域。在这种情况下，已提出噬菌体（感染细菌的病毒）及其衍生蛋白作为消除生物膜的有希望的替代物。例如，内溶素可降解肽聚糖，并最终裂解靶细菌细胞。然而，表征暴露于这些化合物的细菌细胞的反应以改进基于噬菌体的抗微生物策略的设计是重要的。
如以前在Fernández等人（2017）中所描述的，开发该协议以检查暴露于内溶素处理的金黄色葡萄球菌生物膜细胞的转录反应。然而，它可能随后适用于分析其他微生物对不同抗菌剂的反应。
【背景】越来越清楚的是，亚抑制剂量的抗菌剂可能对目标微生物的不同表型具有调节作用，包括生物膜形成，代谢或毒力。因此，研究新化合物对低浓度靶细胞的潜在影响应该是发展过程的一部分。事实上，引发毒力因子或抗生素耐药决定簇产生的非常有效的抗菌剂可能不是治疗应用的良好候选者。另一方面，考虑到生物膜和浮游细胞之间的生理差异，应该对生物膜形成细胞分析新抗生物膜剂的作用似乎是合乎逻辑的。在这里，我们描述了一种协议，用于分析生物膜细胞在亚抑制浓度的内抑素浓度下的转录反应，噬菌体来源的蛋白质作为生物膜去除剂展现出巨大的前景。因此，通过RNA-seq将内溶素处理的细胞的转录组与对照细胞进行比较，并且后来通过RT-qPCR证实了所选基因的差异表达。 ...
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| Measuring Mitochondrial ROS in Mammalian Cells with a Genetically Encoded Protein Sensor
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Author:
Date:
2018-01-20
[Abstract] Reactive oxygen species (ROS) are not only known for their toxic effects on cells, but they also play an important role as second messengers. As such, they control a variety of cellular functions such as proliferation, metabolism, differentiation and apoptosis. Thus, ROS are involved in the regulation of multiple physiological and pathophysiological processes. It is now apparent that there are transient and local changes in ROS in the cell; in so-called ‘microdomains’ or in specific cellular compartments, which affect signaling events. These ROS hotspots need to be studied in more depth to ...
[摘要] 活性氧（ROS）不仅以其对细胞的毒性作用而闻名，而且作为第二信使也起着重要的作用。如此，它们控制多种细胞功能，例如增殖，代谢，分化和凋亡。因此，ROS参与多种生理和病理生理过程的调节。现在很明显，细胞内存在ROS的短暂和局部变化;在所谓的“微域”或特定的细胞区室中，其影响信号传导事件。这些ROS热点需要更深入的研究，以了解其功能和规定。因此，有必要以高空间和时间分辨率在单个细胞中识别和量化氧化还原信号。遗传编码的基于荧光的蛋白质传感器提供了检测氧化还原信号传导过程的必要工具。这些传感器的一个很大的优势是可以针对他们。线粒体是能量代谢所必需的，并且是哺乳动物细胞中ROS的主要来源之一。因此，对这些细胞器中氧化还原电位和ROS产生的评估是非常有意义的。在此，我们提供了一个使用H 2 O 2特异性比例传感器mitoHyPer在贴壁哺乳动物细胞中。【背景】ROS是通过线粒体呼吸的副产物，通过电子从电子传递链泄漏而产生的。这些ROS被认为是有毒的，并导致脂质，蛋白质的氧化，并导致线粒体DNA损伤（Ralph et al。，2010; Bogeski等人，2016; Bogeski ，2014; Monika et al。，2015）。虽然线粒体作为新陈代谢，生物能量学和细胞死亡的枢纽，线粒体ROS作为调节多种细胞功能的第二信使的新兴作用也日益被接受（Chandel，2015; ...
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