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24x 1.5 ml microtubes

公司名称: Grant Instruments
产品编号: PHMT-PSC24N
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Extraction of DNA from Murine Fecal Pellets for Downstream Phylogenetic Microbiota Analysis by Next-generation Sequencing
Author:
Date:
2018-02-05
[Abstract]  Mouse models are widely used to evaluate the potential impact of the gut microbial composition on health and disease. Standardized protocols for sampling and storing murine feces, as well as for extracting DNA from these fecal pellets are needed to limit experimental variation between different studies. Both efficient lysis of the microbiota and the quality of the obtained fecal DNA are important for allowing the downstream next-generation sequencing to cover the phylogenetic diversity of both Gram-negative and Gram-positive bacteria living in the mouse gut. Here we present a detailed ... [摘要]  小鼠模型被广泛用于评估良好的微生物组成对健康和疾病的潜在影响。 为了限制不同研究之间的实验差异,需要用于取样和储存鼠粪的标准化方案,以及从这些粪便颗粒中提取DNA。 微生物群的有效裂解和产生的粪便DNA对于允许下游的下一代测序覆盖革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌的系统发育多样性是重要的。 在这里,我们提出了一个详细的粪便样本采集和DNA提取方案,我们在炎症小鼠对小鼠肠道微生物群的影响的研究中进行了验证。 这种从鼠粪球中提取DNA的方案利用了机械和化学溶解的组合,这与最近推荐的用于从人类粪便中提取DNA的基准方案一致。

【背景】限制实验室内部和实验室之间的技术变化对于再现性是必要的,因此也是实验研究的科学进步所必需的。在扩大的肠道微生物群研究群体中,使用了大量的方法来描述肠道生态系统的系统发育成分。微生物学分析过程中的每个步骤都受到技术变化的影响。例如,来自鼠粪便的DNA据报道在同一实验室中获得的结果有多重差异(Ferrand等,2014)。因此,有必要对多个不同研究进行荟萃分析。

为了分析人类粪便微生物研究人员组成的大型国际财团日前相比,在几个独立的实验室以及微生物分析流水线的每一个步骤的许多技术方法的效果(科斯泰亚的等的,2017年) ...

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