| Microtitre Plate Based Cell-SELEX Method
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Author:
Date:
2018-10-20
[Abstract] Aptamers have emerged as a novel category in the field of bioreceptors due to their wide applications ranging from biosensing to therapeutics. Several variations of their screening process, called SELEX have been reported which can yield sequences with desired properties needed for their final use. We report a facile microtiter plate-based Cell-SELEX method for a gram-negative bacteria E. coli. The optimized protocol allows the reduction of number of rounds for SELEX by offering higher surface area and longer retention times. In addition, this protocol can be modified for other ...
[摘要] 由于适体的广泛应用，从生物传感到治疗，适体已经成为生物受体领域的一个新类别。 已经报道了它们的筛选过程的几种变体，称为SELEX，其可以产生具有最终使用所需的所需性质的序列。 我们报告了一种基于微量滴定板的Cell-SELEX方法，用于革兰氏阴性菌 E.大肠杆菌>。 优化的协议允许通过提供更高的表面积和更长的保留时间来减少SELEX的轮数。 此外，该方案可以针对其他原核和真核细胞进行修饰，并且聚糖部分可以作为在短时间内体外产生高亲和力生物受体的靶标>。
【背景】适体是1990年描述的单链合成DNA或RNA（Ellington和Szostak，1990; Tuerk和Gold，1990），具有独特的3D几何结构，这是其序列的表现。不同的序列允许合成适体，其可以结合从小分子到大蛋白质的分子阵列。这使得适配体成为常规抗体的竞争对手，常规抗体由于结构限制而限于蛋白质作为其靶标，并且不能针对高风险病原体产生，因为这些通常比产生高亲和力所需的时间更早地杀死宿主。抗体。适体在体外>设置中产生，因此可以有效地用于高风险病原体。 SELEX（ S L > > > > > > > > >分离导致在低nM范围内具有解离常数的池的筛选。已经提出了SELEX的几种变体，其使用各种固定基质，包括毛细管电泳SELEX，基于亲和层析的SELEX，磁珠SELEX，体内> ...
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| A Method for SUMO Modification of Proteins in vitro
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Author:
Date:
2018-10-05
[Abstract] The Small Ubiquitin-related Modifier (SUMO) is a protein that is post-translationally added to and reversibly removed from other proteins in eukaryotic cells. SUMO and enzymes of the SUMO pathway are well conserved from yeast to humans and SUMO modification regulates a variety of essential cellular processes including transcription, chromatin remodeling, DNA damage repair, and cell cycle progression. One of the challenges in studying SUMO modification in vivo is the relatively low steady-state level of a SUMO-modified protein due in part to the activity of SUMO deconjugating enzymes ...
[摘要] 小泛素相关修饰物（SUMO）是一种蛋白质，其翻译后添加到真核细胞中并可逆地从其他蛋白质中去除。 SUMO和SUMO途径的酶从酵母到人类都很保守，SUMO修饰调节了多种基本细胞过程，包括转录，染色质重塑，DNA损伤修复和细胞周期进程。 研究SUMO修饰体内的挑战之一是SUMO修饰蛋白的相对低的稳态水平，部分原因是SUMO去缀合酶（SUMO Isopeptidases或SENPs）的活性。 幸运的是，使用重组SUMO酶可以在体外研究SUMO修饰。 在这里，我们描述了一种灵敏的方法，用于检测目标人类蛋白质的SUMO修饰，使用来自兔网织红细胞和放射性标记的氨基酸的体外转录和翻译系统。
【背景】与其他泛素蛋白家族修饰一样，SUMO修饰通过ATP依赖性酶促级联发生，涉及E1激活酶（人类中的Aos1 / Uba2异二聚体），E2结合酶（Ubc9）和许多E3连接之一的连续活性。酶（Gareau和Lima，2010）。具有SUMO缀合共有位点的蛋白质ΨKxE（Ψ是疏水残基，其后是赖氨酸，任何氨基酸和谷氨酸），可以通过哺乳动物中表达的一种或几种SUMO旁系同源物（包括SUMO1，SUMO2）进行有效修饰。或SUMO3（统称为SUMO2 / 3，因为它们的序列同源性为97％）（Gareau和Lima，2010; Flotho和Melchior，2013）。 ...
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| Phagocytosis Assay for α-Synuclein Fibril Uptake by Mouse Primary Microglia
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Author:
Date:
2018-09-05
[Abstract] Microglia are professional phagocytes in the brain and deficiency in their phagocytic activity plays an important role in Parkinson’s disease. This protocol mainly describes the phagocytosis assay for uptake of α-synuclein preformed fibrils, a pathologic form of α-synuclein, by primary microglia.
[摘要] 小胶质细胞是大脑中的专业吞噬细胞，其吞噬活性的缺乏在帕金森病中起重要作用。 该方案主要描述了通过原代小胶质细胞摄取α-突触核蛋白预先形成的原纤维（α-突触核蛋白的病理形式）的吞噬作用测定。
【背景】作为大脑的免疫细胞，小胶质细胞在中枢神经系统中起着关键作用。在生理状态下，小胶质细胞不断探索周围环境并参与突触修剪。小胶质细胞可被任何类型的病理事件或脑内稳态的变化激活（Wolf et al。，2017）。激活后，小胶质细胞经历形态学变化，增殖，分泌炎性细胞因子，迁移至病变部位，吞噬病原体，病细胞，碎片，甚至细胞外蛋白质聚集体（Kettenmann et al。，2011; Fu et al。，2014）。 α-突触核蛋白是神经元中的丰富蛋白质，并且是帕金森病中称为路易体和路易神经突的神经元内包涵体的主要成分（Luk 等人，，2012）。最近的研究表明α-突触核蛋白经历细胞间扩散，小胶质细胞是α-突触核蛋白的主要清除剂，它可能承担来自神经元的α-突触核蛋白的负担（Wolf et al。，2017 ）。在这里，我们描述了使用人α-突触核蛋白单体产生预先形成的原纤维并通过小胶质细胞吞噬作用测量α-突触核蛋白预先形成的原纤维的摄取的方案（Du et al。，2017）。
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