| Hyaluronan Isolation from Mouse Mammary Gland
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Author:
Date:
2018-06-05
[Abstract] The glycosaminoglycan hyaluronan (HA) is a key component of the extracellular matrix. The molecular weight of HA is heterogeneous and can reach from several million to several hundred daltons. The effect of HA on cell behavior is size dependent; fragmented HA acts as a danger signal, stimulates cell migration and proliferation and is proinflammatory, native high molecular weight HA suppresses inflammation. Therefore, it is important to analyze HA size distribution when studying the role of HA in tissue homeostasis and pathology. This protocol describes isolation of HA from mouse mammary ...
[摘要] 糖胺聚糖透明质酸（HA）是细胞外基质的关键组分。 HA的分子量是不均匀的，可以达到几百万至几百道尔顿。 HA对细胞行为的影响与尺寸有关; 片段化的HA作为危险信号起作用，刺激细胞迁移和增殖并且是促炎性的，原生高分子量HA抑制炎症。 因此，在研究HA在组织稳态和病理学中的作用时，分析HA的大小分布非常重要。 该协议描述从小鼠乳腺分离HA，但也可以应用于其他组织。 分离的HA的质量足以通过凝胶电泳分析大小分布（Calabro等人，2000）。
【背景】糖胺聚糖HA由N-乙酰葡糖胺和β葡萄糖醛酸二糖组成，并且是细胞外基质的普遍存在的组分。 高分子量HA通过酶促降解和被活性氧和氮物质氧化而碎裂。 在健康组织中，大部分HA具有高分子量。 片段化HA的积累在病理过程中起着危险信号的作用（Tolg等人，2012和2017; Yuan等人，2015）。 例如，HA片段刺激炎症，而高分子量HA抑制炎症。 HA通过与细胞膜受体相互作用影响细胞行为，如细胞迁移和增殖，导致信号通路的激活。 由于受体-HA相互作用受HA大小的影响，HA对组织生物学的影响不仅取决于HA量，而且取决于各个细胞的HA大小分布和HA受体表达。
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| Design of Hybrid RNA Polymerase III Promoters for Efficient CRISPR-Cas9 Function
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Author:
Date:
2018-03-20
[Abstract] The discovery of the CRISPR-Cas9 system from Streptococcus pyogenes has allowed the development of genome engineering tools in a variety of organisms. A frequent limitation in CRISPR-Cas9 function is adequate expression levels of sgRNA. This protocol provides a strategy to construct hybrid RNA polymerase III (Pol III) promoters that facilitate high expression of sgRNA and improved CRISPR-Cas9 function. We provide selection criteria of Pol III promoters, efficient promoter construction methods, and a sample screening technique to test the efficiency of the hybrid promoters. A hybrid ...
[摘要] 来自化脓性链球菌的CRISPR-Cas9系统的发现使得在各种生物体中开发基因组工程工具成为可能。 CRISPR-Cas9功能的频繁限制是足够的sgRNA表达水平。 该协议提供了构建杂合RNA聚合酶III（Pol III）启动子的策略，其促进sgRNA的高表达和改善的CRISPR-Cas9功能。 我们提供Pol III启动子的选择标准，有效的启动子构建方法以及样品筛选技术来检测杂合启动子的效率。 为解脂耶氏酵母开发的杂交启动子系统将用作模型。
【背景】CRISPR（成簇定期间隔短回文重复序列）是细菌中发现的DNA序列的集合，其中含有先前曝光的病毒DNA片段（Marraffini和Sontheimer，2010）。片段被称为间隔区DNA，并且它们侧面是短的，重复的回文序列。细菌使用这些存储的间隔序列作为模板来表达RNA，以识别和攻击再次暴露的特定病毒。当与CRISPR相关（Cas）蛋白结合时，CRISPR-Cas系统可以识别和切割外源DNA或RNA，破坏病毒并保护宿主免受重复感染（Barrangou，2013）。
一种特定的CRISPR系统，来自化脓链球菌的II型CRISPR-Cas9已经被修改成用于基因组编辑的更简单的系统。利用这个系统，研究人员能够设计特定的单引导RNA（sgRNA）序列，它与具有上游原型间隔区相邻基序（PAM;'NGG'）的目的基因的20bp序列互补（Jinek ...
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