| Analysis of the Effect of Sphingomyelinase on Rubella Virus Infectivity in Two Cell Lines
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Author:
Date:
2018-09-05
[Abstract] Rubella is a mildly contagious disease characterized by low-grade fever and a morbilliform rash caused by the rubella virus (RuV). Viruses often use cellular phospholipids for infection. We studied the roles of cellular sphingomyelin in RuV infection. Treatment of cells with sphingomyelinase (SMase) inhibited RuV infection in rabbit kidney-derived RK13 cells and African green monkey (Cercopithecus aethiops) kidney-derived Vero cells. Our data further demonstrated that RuV used cellular sphingomyelin and cholesterol for its binding to cells and membrane fusion at the step of virus ...
[摘要] 风疹是一种轻度传染性疾病，其特征是低风热和由风疹病毒（RuV）引起的麻疹样皮疹。 病毒通常使用细胞磷脂进行感染。 我们研究了细胞鞘磷脂在RuV感染中的作用。 用鞘磷脂酶（SMase）处理细胞抑制兔肾衍生的RK13细胞和非洲绿猴（ Cercopithecus aethiops ）肾源性Vero细胞中的RuV感染。 我们的数据进一步证明RuV在病毒进入的步骤中使用细胞鞘磷脂和胆固醇来结合细胞和膜融合。 描述了我们的测定的详细方案，其评估了SMase处理对RK13和Vero细胞中RuV感染性的影响。
【背景】风疹病毒（RuV）是一种正链RNA病毒，属于 Togaviridae 家族中的 Rubivirus 属。该家族有两个属， Rubivirus 和 Alphavirus 。风疹病毒是属的鞋底构件的风疹病毒，而许多病毒，例如塞姆利基森林病毒（SFV）和辛德毕斯病毒（SINV），是归类于甲病毒属。 RuV是风疹和先天性风疹综合征（CRS）的致病因子。风疹的特征是低烧，麻疹样皮疹和淋巴结肿大。它通常是一种轻微的疾病。然而，CRS是一种严重的疾病。 CRS导致在怀孕早期患有风疹的母亲所生的新生儿出现多器官缺陷。白内障，感音神经性听力损失和心血管缺陷在CRS中很常见。
以前的研究表明，细胞膜脂质作为RuV感染的结合或进入因子（Mastromarino ...
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| Extraction and 16S rRNA Sequence Analysis of Microbiomes Associated with Rice Roots
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Author:
Date:
2018-06-20
[Abstract] Plant roots associate with a wide diversity of bacteria and archaea across the root-soil spectrum. The rhizosphere microbiota, the communities of microbes in the soil adjacent to the root, can contain up to 10 billion bacterial cells per gram of soil (Raynaud and Nunan, 2014) and can play important roles for the fitness of the host plant. Subsets of the rhizospheric microbiota can colonize the root surface (rhizoplane) and the root interior (endosphere), forming an intimate relationship with the host plant. Compositional analysis of these communities is important to develop tools in order to ...
[摘要] 植物根系与根 - 土壤谱中的各种细菌和古细菌相关联。根际微生物群落，即与根系相邻的土壤中的微生物群落，每克土壤可含有高达100亿个细菌细胞（Raynaud和Nunan，2014），并且可以在宿主植物的适应性方面发挥重要作用。根际微生物群的亚群可以在根表面（根毛菌）和根内部（内生孢子）定居，与寄主植物形成密切关系。这些群落的成分分析对于开发工具以操纵根系相关微生物群以提高作物生产力非常重要。由于降低了成本并提高了下一代测序的通量，因此主要通过使用16S rRNA基因的扩增子测序来最终破解这些群落的主要进展。在这里，我们首先提出一个协议，用于解剖来自各种根室的微生物群，这些根室是以水稻为模型开发的。接下来我们介绍一种使用双指数方法扩增16S rRNA基因片段的方法。最后，我们提供了一个简单的工作流程来分析生成的测序数据以进行生态推理。
【背景】各种植物根生态位寄主于源自土壤的不同微生物群落（微生物群落）（Bulgarelli et al。，2012; Lundberg等人，2012; Edwards等人。2015年; Zarraonaindia等人，2015年; Wagner等人，2016年）。由每个根生态位获得的不同微生物群可能具有不同的代谢潜力，因此可能以不同方式影响宿主植物的健康（Finkel等人，2017）。可以通过使用16S ...
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