| Quantitative Nucleocytoplasmic Transport Assays in Cellular Models of Neurodegeneration
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Author:
Date:
2020-06-20
[Abstract] Nucleocytoplasmic transport deficits are suggested to play a role in neurodegenerative disorders, including amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Given the importance and complexity of this process, understanding when these aberrations occur and which pathways are involved is of great importance. Here, we make use of CRISPR-Cas9 technology to design cell lines stably expressing fluorophore proteins shuttling between the nucleus and cytoplasm by karyopherins of choice. To validate this protocol, we measured an ALS-associated nucleocytoplasmic transport pathway in the presence of the ...
[摘要] [摘要]核细胞质运输缺陷被认为在神经退行性疾病中发挥作用，包括肌萎缩性侧索硬化症（ALS）。鉴于这一过程的重要性和复杂性，了解这些畸变何时发生以及涉及哪些途径是非常重要的。在这里，我们利用CRISPR-Cas9技术来设计细胞系，稳定地表达荧光素蛋白在细胞核和细胞质之间穿梭的选择的卡里菲林。为了验证这个协议，我们测量了一个ALS相关的核细胞质运输途径，在疾病相关的多肽poly-PR的存在。这种技术允许测量在神经退行性疾病相关的背景下，在完整细胞中的一个特定的活性核细胞质运输途径。此外，这些实验可以在不需要昂贵的设备的情况下进行，并有可能升级为高通量筛选目的。
[背景]核细胞质运输对细胞稳态至关重要，并通过形成水通道的大型多蛋白复合物穿过核膜，称为核孔复合物（NPCs）（Stoffler et al., 1999; Ryan and Wente, 2000)。虽然这些通道允许小蛋白被动地平衡穿过核膜（被动运输），但大多数蛋白质似乎是由核素主动运输的，即进口蛋白或出口蛋白（主动运输）。含有核定位信号(NLS)的货物蛋白被导入素所定位。已经确定了各种受体介导的导入途径，但最有特色的途径涉及导入素-β1/导入素-α(KPNB1/KPNAx)，其中货蛋白含有经典的NLS(cNLS)，以SV40大T抗原NLS为例(Lange et al., ...
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| Artificial Inoculation of Epichloë festucae into Lolium perenne, and Visualisation of Endophytic and Epiphyllous Fungal Growth
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Author:
Date:
2018-09-05
[Abstract] Natural hosts for the fungal endophyte Epichloë festucae include Festuca rubra (fine fescue) and Festuca trachyphylla (hard fescue). Some strains also form stable associations with Lolium perenne (perennial ryegrass). L. perenne is a suitable host to study fungal endophyte–grass interactions, such as endophytic fungal growth within the plant and epiphyllous growth on the plant surface. Here we provide a detailed protocol based on work by, for artificial inoculation of E. festucae into L. perenne, and newly developed staining and ...
[摘要] 真菌内生菌Epichloëfestucae的天然宿主包括 Festuca rubra （细羊茅）和 Festuca trachyphylla （硬羊茅）。一些菌株也与黑麦草（多年生黑麦草）形成稳定的关联。 升。 perenne 是研究真菌内生菌 - 草相互作用的合适宿主，例如植物内生真菌生长和植物表面的叶生生长。在这里，我们提供了一个基于工作的详细协议，用于 E的人工接种。 festucae 进入 L. perenne ，以及新开发的染色和可视化技术，用于观察内生和附生的菌丝和表达菌，这是一种类似真菌的结构，用于离开植物。染色方法使用葡聚糖结合苯胺蓝二铵盐（AB）和几丁质结合小麦胚凝集素缀合的Alexa Fluor ® 488-（WGA-AF488）的组合。该协议将是研究Epichloë -grass相互作用的有用工具，特别是不同Epichloë - 草关联，各种内生菌 - 宿主发育阶段的比较，以及分析突变Epichloë菌株。
【背景】Latch和Christensen（1985）开发了一种用Epichloë内生菌人工感染草的方案。这项工作一直是广泛的 E的基础。 festucae Fl1- L. perenne 共生研究（Scott et al。，2012年综述）。在我们最近的工作中，我们描述了一种新发现的真菌结构，即能够实现 E的表达式。 ...
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| High-throughput YO-PRO-1 Uptake Assay for P2X7 Receptors Expressed in HEK Cells
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Author:
Date:
2018-07-20
[Abstract] P2X7 receptors are extracellular ATP-gated ion channels that play broad physiological and pathological roles in animals (Sluyter, 2017). Activation of P2X7 receptors lead to the opening of membrane channels permeable for small cations like Na+ and Ca2+ as well as fluorescent dyes such as YO-PRO-1 (Alves et al., 2014). Taking advantage of this dye-permeability, YO-PRO-1 uptake assays have been widely used to probe P2X7 receptor activity (Surprenant et al., 1996; Rassendren et al., 1997; Karasawa et al., 2017). Here we describe a step by ...
[摘要] P2X7受体是细胞外ATP门控离子通道，在动物中发挥广泛的生理和病理作用（Sluyter，2017）。 P2X7受体的激活导致膜通道的开放可渗透小阳离子如Na + 和Ca 2 + 以及荧光染料如YO-PRO-1（Alves） et al。，2014）。 利用这种染料渗透性，YO-PRO-1摄取试验已被广泛用于探测P2X7受体活性（Surprenant et al。，1996; Rassendren et al。 ，1997; Karasawa et al。，2017）。 在这里，我们描述了使用表达P2X7受体的HEK293细胞进行高通量YO-PRO-1摄取测定的逐步方案。 这个为期3天的方案特别适用于检查小分子和突变对P2X7受体功能的影响。 该协议改编自我们之前发表的论文（Karasawa和Kawate，2016）。
【背景】P2X7受体打开可渗透阳离子的膜通道（Surprenant et al。，1996; Sluyter，2017）。虽然电生理学仍然是量化P2X7受体活性的金标准，但这种专门技术可能并不容易获得。此外，电生理学不适合高通量筛选，因为每次记录需要大量的时间和操作。因此，荧光分子的摄取是一种广泛使用的替代方法，特别是用于筛选多种条件/突变体（Cankurtaran-Sayar et al。，2009; Qu et al。 ...
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