| Laminarin Quantification in Microalgae with Enzymes from Marine Microbes
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Author:
Date:
2018-04-20
[Abstract] The marine beta-glucan laminarin is an abundant storage polysaccharide in microalgae. High production rates and rapid digestion by heterotrophic bacteria turn laminarin into an ideal carbon and energy source, and it is therefore a key player in the marine carbon cycle. As a main storage glucan laminarin also plays a central role in the energy metabolism of the microalgae (Percival and Ross, 1951; Myklestad, 1974; Painter, 1983). We take advantage of enzymes that digest laminarin selectively and can thereby quantify only this polysaccharide in environmental samples. These enzymes hydrolyze ...
[摘要] 海洋β-葡聚糖昆布多糖是微藻中丰富的储存多糖。高生产率和异养细菌的快速消化将昆布多糖转化为理想的碳源和能源，因此它是海洋碳循环的关键参与者。作为主要的储存葡聚糖昆布多糖也在微藻的能量代谢中发挥核心作用（Percival and Ross，1951; Myklestad，1974; Painter，1983）。我们利用可以选择性消化昆布多糖的酶，从而可以对环境样品中的这种多糖进行定量。这些酶将昆布多糖水解成葡萄糖和寡糖，用标准的还原糖测定法测定得到昆布多糖浓度。在此测定之前，需要通过异源表达和纯化产生三种酶。该测定可用于监测环境微藻中的昆布多糖浓度，其通过过滤从海水中浓缩，或用来自藻类实验室培养物的样品中浓缩。
【背景】海洋多糖在海洋碳循环中起着重要作用，是浮游植物生理学的重要组成部分，但受到严重影响。几十年来，农业食品工业一直使用基于酶分析的即用试剂盒来分析各种不同的多糖（Whitaker，1974）。这些快速，稳健和特异性的基于酶的方法评估源自陆地植物即淀粉的多糖，因为它们广泛用于食品，饲料和其他工业应用中（Brunt等人， ，1998）。然而，海洋多糖的类似测定仍然缺乏。受到使用酶在藻类中进行多糖定量的想法的启发，我们开发了一种基于酶的方法来量化在硅藻和其他微藻中生态相关的β-葡聚糖昆布氨酸，也称为菊科金刚烷。
这种应用的三种糖苷水解酶（GH）来自福尔摩沙（Formosa）。并且它们的特征如下：FbGH30是GH30家族的外切型β-1,6-葡聚糖酶，特别是水解与昆布多糖骨架连接的β-1,6-连接的葡萄糖单体分支;并且FaGH17A和FbGH17A是GH家族17的两种内作用β-1,3-葡聚糖酶，其特异性地作用于β-1,3-连接的昆布多糖主链上（Becker等人，2017年， ...
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| Separation and Detection of Phosphorylated and Nonphosphorylated BvgA, a Bordetella pertussis Response Regulator, in vivo and in vitro
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Date:
2013-11-20
[Abstract] Protein phosphorylation plays a central role in signal transduction in bacteria. However, separation and detection of the phosphorylated protein from its nonphosphorylated form remain challenging. Here we describe a method to detect phosphorylation of the Bordetella pertussis response regulator BvgA, which is phosphorylated at an aspartate residue (Boulanger et al., 2013). This method is based on the proprietary adduct, Phos-tagTM, a dinuclear metal complex, which together with Zn2+ or Mn2+, forms a complex with a phosphomonoesterdianion, ...
[摘要] 蛋白质磷酸化在细菌的信号转导中起着中心作用。然而，从其非磷酸化形式分离和检测磷酸化蛋白仍然是挑战性的。在这里我们描述了检测百日咳博德特氏菌响应调节剂BvgA的磷酸化的方法，其在天冬氨酸残基被磷酸化（Boulanger等人，2013）。该方法基于专有的加合物Phos-tag TM sup/TM，其是双核金属络合物，其与Zn 2+或Mn 2+反应， ，与磷酸二酯酶形成复合物，例如应答调节剂的磷酸化天冬氨酸（Barbieri和Stock，2008; Kinoshita和Kinoshita-Kikuta，2011）。对于体内检测，在4℃下在轻度甲酸中裂解百日咳细胞以使磷酸 - 天冬氨酸键的破坏最小化，并且通过包含Phos标签的电泳（SDS-PAGE）将磷酸化的BvgA从其非磷酸化形式分离> TM 。随后通过蛋白质印迹分析检测两种形式的BvgA。还容易实现在体外用乙酰磷酸盐处理后形成的磷酸化BvgA的水平的量化。因此，该技术允许容易地评估B中BvgA磷酸化的水平。百日咳和 。大肠杆菌在不同实验室条件下在体内或在不同反应条件下在体外磷酸化后（本研究部分由NIH的Intramural Research Programme支持， NIDDK）。
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