| Investigating Localization of Chimeric Transporter Proteins within Chloroplasts of Arabidopsis thaliana
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Author:
Date:
2018-02-05
[Abstract] In this protocol, we describe a method to design chimeric proteins for specific targeting to the inner envelope membrane (IEM) of Arabidopsis chloroplasts and the confirmation of their localization by biochemical analysis. Specific targeting to the chloroplast IEM can be achieved by fusing the protein of interest with a transit peptide and an IEM targeting signal. This protocol makes it possible to investigate the localization of chimeric proteins in chloroplasts using a small number of transgenic plants by using a modified method of chloroplast isolation and fractionation. IEM ...
[摘要] 在这个协议中，我们描述了一种设计嵌合蛋白的方法，用于特异性靶向拟南芥叶绿体的内包膜（IEM）并通过生化分析确定它们的定位。 叶绿体IEM的特异性靶向可通过将感兴趣的蛋白质与转运肽和IEM靶向信号融合来实现。 这个协议使得有可能使用少量的转基因植物，通过使用修改的叶绿体分离和分离方法来研究嵌合蛋白在叶绿体中的定位。 嵌合蛋白的IEM定位可以通过胰蛋白酶消化和碱性提取进一步评估。 在此，称为SbtAII的嵌合碳酸氢根转运蛋白的定位通过使用针对葡萄球菌蛋白A的抗体进行蛋白质印迹来检测。该方案改编自上原等人，2016年
【背景】有人提出将蓝藻CO 2浓度机制整合到叶绿体中是改善C 3+植物光合作用的有希望的方法。 根据理论估计，将BicA和SbtA整合到叶绿体IEM中可以提高光合CO 2固定率。 我们研究了核编码的蓝细菌碳酸氢盐转运蛋白BicA和SbtA与拟南芥叶绿体的IEM的整合。 因此，我们制定了一个协议，设计嵌合构造为特定目标的IEM和调查嵌合蛋白在叶绿体中的定位。
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| Cell-free Fluorescent Intra-Golgi Retrograde Vesicle Trafficking Assay
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Author:
Date:
2017-11-20
[Abstract] Intra-Golgi retrograde vesicle transport is used to traffic and sort resident Golgi enzymes to their appropriate cisternal locations. An assay was established to investigate the molecular details of vesicle targeting in a cell-free system. Stable cell lines were generated in which the trans-Golgi enzyme galactosyltransferase (GalT) was tagged with either CFP or YFP. Given that GalT is recycled to the cisterna where it is located at steady state, GalT-containing vesicles target GalT-containing cisternal membranes. Golgi membranes were therefore isolated from GalT-CFP expressing cells, ...
[摘要] 高尔基体内的逆行囊泡运输被用来运送和分类高尔基酶到适当的池内位置。建立了一个检测方法来研究无细胞系统中囊泡靶向的分子细节。生成了稳定的细胞系，其中反式 - 高尔基酶半乳糖基转移酶（GalT）用CFP或YFP标记。考虑到GalT被循环到稳定状态的小池中，含有GalT的囊泡将靶向含有GalT的池内膜。因此从表达GalT-CFP的细胞分离高尔基体膜，而从GalT-YFP表达细胞制备囊泡。在胞质溶胶和能量再生混合物的存在下，在37℃孵育CFP标记的高尔基体和YFP标记的囊泡，与在冰上孵育相比，在混合物的荧光成像后CFP-YFP共定位显着增加。该测定被验证需要能量，蛋白质和生理学重要的运输组分，如Rab GTP酶和保守寡聚体高尔基体系复合物。该测定法可用于调查影响高尔基体运输机器的生理和病理变化，特别是囊泡束缚。
【背景】细胞内囊泡靶向的分子机制对于解释糖基化稳态，神经递质释放，信号受体的调节和营养摄取等方面的解释是重要的（Ungar和Hughson，2003; ...
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| Isolation and Quantification of Plant Extracellular Vesicles
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Author:
Date:
2017-09-05
[Abstract] Extracellular vesicles (EVs) play an important role in intercellular communication by transporting proteins and RNA. While plant cells secrete EVs, they have only recently been isolated and questions regarding their biogenesis, release, uptake and function remain unanswered. Here, we present a detailed protocol for isolating EVs from the apoplastic wash of Arabidopsis thaliana leaves. The isolated EVs can be quantified using a fluorometric dye to assess total membrane content.
[摘要] 细胞外囊泡（EVs）通过传递蛋白质和RNA在细胞间通讯中发挥重要作用。 虽然植物细胞分泌电动汽车，但是它们最近才被孤立，并且关于它们的生物发生，释放，摄取和功能的问题仍然没有得到回答。 在这里，我们提出了一个详细的方案，用于从拟南芥叶片的脱水洗涤中分离EV。 可以使用荧光染料定量分离的EV，以评估总膜含量。
【背景】细胞外囊泡（EVs）是介导蛋白质，脂质和遗传物质的细胞与细胞转移的膜结合结构。由于哺乳动物EVs转运RNA和调节免疫反应的能力，对哺乳动物EV的兴趣已经增长。哺乳动物EV通常被分离用于从培养细胞的培养基中研究，以及生物流体的增长列表（Colombo等，2014）。植物电动车也被认为在免疫反应中起作用，但比较缺乏（An et al。，2007; Davis et al。，2016）。这在很大程度上归因于没有孤立的方法。
虽然植物EVs自1967年以来一直被观察到，使用透射电子显微镜，但直到2009年才开发出分离方法（Halperin和Jensen，1967）。 ...
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