How to Catch a Smurf? – Ageing and Beyond…
In vivo Assessment of Intestinal Permeability in Multiple Model Organisms
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Author:
Date:
2018-02-05
[Abstract] The Smurf Assay (SA) was initially developed in the model organism Drosophila melanogaster where a dramatic increase of intestinal permeability has been shown to occur during aging (Rera et al., 2011). We have since validated the protocol in multiple other model organisms (Dambroise et al., 2016) and have utilized the assay to further our understanding of aging (Tricoire and Rera, 2015; Rera et al., 2018). The SA has now also been used by other labs to assess intestinal barrier permeability (Clark et al., 2015; Katzenberger et al., 2015; ...
[摘要] Smurf分析（SA）最初是在模型生物黑腹果蝇中发现的，其中在老化过程中肠道通透性显着增加（Rera等人，2011年）。 我们已经验证了多种其他模式生物体的协议（Dambroise等人，2016），并利用该分析来进一步了解老化（Tricoire和Rera，2015; Rera等人 。，2018年）。 SA现在也被其他实验室用于评估肠道屏障通透性（Clark等人，2015; Katzenberger等人，2015; Barekat等人 。2016; Chakrabarti等人，2016; Gelino等人，2016）。 SA本身很简单， 然而，许多小细节可能会对其实验的有效性和随后的解释产生相当大的影响。 在这里，我们提供SA技术的详细更新，并解释如何捕捉Smurf，同时避免最常见的实验谬误。
【背景】Smurf分析（SA）基于（Wong等人，2009）中描述的果蝇饲养分析。该测定法通过摄入未被消化道吸收的蓝色染料来评估食物摄入量，从而允许直接定量。对于SA来说，这个特定的蓝色染料不能通过一个完整的肠屏障，因为它的读数是全身着色（这里是蓝色）。这种性质允许直接评估肠道通透性，已经显示其随着年龄的增长而增加（Rera等人，2011和2012）。
正如最近在Rera等人（2018）中所讨论的那样，Smurf分析不仅是评估体内肠渗透性的简单方法，而且也是评估广泛生物体中个体的生理年龄。因此，它允许以新颖的方法来研究在老化个体中发生的各种事件（Tricoire和Rera，2015; ...
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| Using Light and Electron Microscopy to Estimate Structural Variation in Thylakoid Membranes
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Author:
Date:
2017-12-05
[Abstract] The shapes of chloroplasts and the architectures of internal thylakoid membranes are altered by growth and environmental changes (Lichtenthaler et al., 1981; Kutik, 1985; Terashima and Hikosaka, 1995). These morphological alterations proceed via transitional intermediates, during which dynamic and heterogeneous thylakoid membranes are observed in cells (Nozue et al., 2017). Light microscopy is useful for the detection of morphological differences in chloroplasts. The thylakoid architecture of such morphologically variable chloroplasts is confirmed by transmission electron ...
[摘要] 叶绿体的形状和内部类囊体膜的结构被生长和环境变化所改变（Lichtenthaler等，1981; Kutik，1985; Terashima和Hikosaka，1995）。 这些形态改变经由过渡中间体进行，在此期间在细胞中观察到动态和非均匀的类囊体膜（Nozue等人，2017）。 光学显微镜可用于检测叶绿体中的形态差异。 透射电子显微镜（TEM）证实了这种形态变化的叶绿体的类囊体结构。 描述了用光学显微镜结合电子显微镜监测结构变化的方法。
【背景】已经提出了超结构形态学与类囊体膜中的光合作用和代谢途径的功能性偶联（Oswald等人，2001）。 这是由类囊体膜在叶成熟期间和从营养期向开花生长期转变期间的异质性支持的。 形态改变有一定的时间滞后（Nozue等人，2017）。 类囊体膜的重排与叶绿体形状的变化同时发生，叶绿体的形状从具有典型的细长透镜状外观变为通过光学显微镜可识别的肿胀外观。
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| Estimation of Silica Cell Silicification Level in Grass Leaves Using in situ Charring Method
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Author:
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2017-11-20
[Abstract] Silica cells are specialized leaf epidermal cells in grasses with almost the whole cell volume filled with solid silica. In sorghum, silica deposition in silica cells takes place in young, elongating leaves around the mid-length of the leaf. We developed a protocol for estimating the level of silica cell silicification in Sorghum bicolor leaves using in situ charring method (Kumar et al., 2017a). Here, we provide greater details on our protocol and method of image analysis. Although we based our protocol on sorghum, this protocol can be extended for estimating ...
[摘要] 二氧化硅细胞是草中特化的叶表皮细胞，几乎全部细胞体积充满固体二氧化硅。 在高粱中，二氧化硅细胞中的二氧化硅沉积发生在叶子中部周围的年轻的伸长叶片中。 我们开发了使用原位炭化法（Kumar等人，2017a）在高粱叶中估计二氧化硅细胞硅化水平的方案，。 在这里，我们提供了更多关于我们的协议和图像分析方法的细节。 虽然我们根据我们的高粱协议，这个协议可以扩展到估计任何草种的硅藻细胞硅化水平。
【背景】二氧化硅沉积是草的中心。禾草以二氧化硅的形式沉积至其干重的10％。植物中二氧化硅沉积的主要部位是根内胚层细胞，花序苞片的背面表皮细胞和叶中的二氧化硅细胞（Kumar等人，2017b）。几乎整个二氧化硅电池体积都填充有固体无定形二氧化硅。二氧化硅细胞中的二氧化硅沉积是生理控制的，发生在幼叶的中间长度周围（Kumar等人，2017a），我们将其命名为leaf-2（图1）。二氧化硅细胞硅化也是几个小时内完成的一个快速过程（Kumar and ...
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