| Live Cell FRET Analysis of the Conformational Changes of Human P-glycoprotein
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Author:
Date:
2021-02-20
[Abstract] The molecular mechanisms of P-glycoprotein (P-gp; also known as MDR1 or ABCB1) have been mainly investigated using artificial membranes such as lipid-detergent mixed micelles, artificial lipid bilayers, and membrane vesicles derived from cultured cells. Although these in vitro experiments help illustrate details about the molecular mechanisms of P-gp, they do not reflect physiological membrane environments in terms of lateral pressure, curvature, constituent lipid species, etc. The protocol presented here includes a detailed guide for analyzing the conformational change of human P-gp in ...
[摘要] [摘要] P-糖蛋白（P-gp；也称为MDR1或ABCB1）的分子机制已主要使用人造膜进行研究，例如脂质去污剂混合胶束，人造脂质双层和源自培养细胞的膜囊泡。尽管这些体外实验有助于阐明有关P-gp分子机制的细节，但它们在侧向压力，曲率，脂质成分等方面并未反映出生理膜环境。 此处提供的协议包括一个详细的指南，该指南用于通过使用分子内荧光共振能量转移（FRET）分析活HEK293细胞中人P-gp的构象变化，其中供体荧光团的激发被转移到受体上而不发射光子当两个荧光蛋白非常接近时。将FRET分析与膜通透性相结合，可以在活细胞中评估小分子（如核苷酸）对构象变化的贡献。
[背景] P-糖蛋白（P-gp）的是ATP驱动药转运该压出各种疏水有毒化合物到细胞外空间。P-gp由形成底物转运途径的两个跨膜结构域（TMD）和结合并水解ATP的两个核苷酸结合结构域（NBD）组成。传输至少需要两个P-gp状态。在向内（药物转运前）构型中，两个NBD分开，两个TMD向细胞内侧开放；在向外（药物转运）构象中，NBD是二聚体的，而TMD在细胞外侧略微开放（Kodan et al。，2020 ）。自从发现P-gp （Juliano和Ling，1976； Chen等，1986； Ueda等，1986 ...
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| Plate Assay to Determine Caenorhabditis elegans Response to Water Soluble and Volatile Chemicals
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Author:
Date:
2018-02-20
[Abstract] The nematode Caenorhabditis elegans is widely used for behavioral studies ranging from simple chemosensation to associative learning and memory. It is vital for such studies to determine optimal concentrations of attractive and aversive chemicals that C. elegans can sense. Here we describe a resource localization assay in which a chemical compound of interest is placed in two compartments of a quadrant plate in order to determine optimal concentrations of the chemical in behavioral studies. Using the assay, we determined the optimal concentration of a water-soluble ...
[摘要] 线虫<秀秀隐杆线虫广泛用于从简单的化学感应到联想学习和记忆的行为研究。 这些研究对于确定吸引和厌恶化学物质的最佳浓度至关重要。="" 线虫可以感觉到。="" 在这里我们描述了一种资源定位测定法，其中将感兴趣的化学化合物置于象限板的两个隔室中以确定化学品在行为研究中的最佳浓度。="" 使用该测定，我们确定了水溶性引诱剂kcl的最佳浓度，作为研究关联学习和记忆的无条件刺激。="">
【背景】线虫线虫广泛用作动物行为研究的模式生物。 ℃。秀丽隐杆线虫感知主要由最大的化学感受器官（Ward，1973; Dusenbery，1974; Bargmann和Horvitz，1991; Bargmann等人）等介导的各种水溶性和挥发性化学物质。 1993）。行为研究必须确定可以被感知的化学物质的精确浓度。线虫。为了确定用于C的水溶性引诱剂的最佳浓度。线虫，Wicks等人（2000）使用象限琼脂平板进行行为测定，其中感兴趣的化学物质与琼脂在两个隔室中混合，并且该测定已广泛用于许多化学品（例如Jansen等人，2002; Ortiz等人，2009; Murayama和Maruyama，2013; Sassa＆lt; em＆gt; et al。，2013）。趋化性分析也被用于测量C的敏感性。 ...
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| Phototaxis Assay for Chlamydomonas reinhardtii
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Author:
Date:
2017-06-20
[Abstract] Phototaxis is a behavior in which organisms move toward or away from the light source (positive or negative phototaxis, respectively). It is crucial for phototrophic microorganisms to inhabit under proper light conditions for phototaxis. The unicellular green alga Chlamydomonas reinhardtii rapidly changes its swimming direction upon light illumination, and thus is a nice model organism for phototaxis research. Here we show two methods to assay Chlamydomonas phototaxis; one is a quick, easy and qualitative analysis, so-called the dish assay; and the other is a quantitative ...
[摘要] 光趋向性是一种生物朝向或远离光源（分别为正或负光趋势）移动的行为。 光合微生物在光照条件适宜的条件下居住是至关重要的。 单细胞藻类莱茵衣藻在光照下迅速改变其游泳方向，因此是光线研究的一个很好的模型生物。 我们在这里展示了两种测定衣藻感染的方法; 一个是快速，容易和定性的分析，所谓的盘测定; 另一个是定量单细胞分析
【背景】单细胞藻类莱茵衣藻被用作各种研究领域的示范生物，包括微生物光合作用，光合作用和睫毛/鞭毛运动（Hegemann and Berthold，2009）。衣藻细胞在其眼窝感觉到光，观察细胞器作为位于细胞赤道附近的橙色斑点。眼窝包含位于细胞膜中的光感受器蛋白质通道视紫质和富含类胡萝卜素的颗粒层，其作用于光反射器之后的通道视紫质。由于它们的相对位置，眼睛受到高度定向的光感受，细胞可以准确地检测光照的方向（Foster和Smyth，1980; Ueki等，2016）。在光接收时，两个鞭毛改变它们的跳动平衡，并且细胞改变其游泳方向朝向或远离光源。
衣原体光镜方向（或“符号”）由细胞还原氧化态调节，其受细胞代谢如光合作用和呼吸活动的影响（Wakabayashi等，2011）。因此，光照标记间接地反映了体内的这些活性。例如，显示快速光敏反应的突变体已被证明具有高的光合活性（Kim等，2016）。此外，为了调节鞭毛打击细胞的光动力转动，鞭毛动力蛋白应严格调节（Kamiya和Witman，1984; ...
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