| Lipidomic Analysis of Caenorhabditis elegans Embryos
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Author:
Date:
2017-09-20
[Abstract] Metabolomic is an emerging field of system biology. Lipidomic, a branch of metabolomic, aims to characterize lipophilic metabolites in biological systems. Caenorhabditis elegans (C. elegans) is a genetically tractable and versatile animal model for novel discovery of lipid metabolism. In addition, C. elegans embryo is simple and homogeneous. Here, we demonstrate detailed procedures of C. elegans culture, embryo isolation, lipid extraction and metabolomic data analysis.
[摘要] 在心肌梗死（MI）中，许多心肌细胞凋亡。 这些凋亡心肌细胞被吞噬细胞迅速吞噬。 如果死细胞没有被吞没，其有害物质被释放到外面，导致炎症的诱导。 因此，需要去除这些死细胞。 然而，每个吞噬细胞类型对梗塞心脏中凋亡细胞的去除的贡献仍未解决。 在这里，我们描述了吞噬作用测定的体外方案来比较心脏巨噬细胞和心脏肌成纤维细胞的吞噬能力。
【背景】长期以来一直认为，心脏巨噬细胞消除了在失败的心脏中产生的凋亡细胞。 然而，我们发现负责组织纤维化的心脏肌成纤维细胞也具有在MI后吞噬凋亡细胞的能力（Nakaya等，2017）。 这一发现促使我们比较心脏巨噬细胞和心脏肌成纤维细胞的吞噬能力。 在这里，我们提供了一个详细的体外吞噬试验方案来评估吞噬吞噬的程度。
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| Determination of the Predatory Capability of Bdellovibrio bacteriovorus HD100
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Author:
Date:
2017-03-20
[Abstract] Bdellovibrio bacteriovorus HD100 is an obligate predator that preys upon a wide variety of Gram negative bacteria. The biphasic growth cycle of Bdellovibrio includes a free-swimming attack phase and an intraperiplasmic growth phase, where the predator replicates its DNA and grows using the prey as a source of nutrients, finally dividing into individual cells (Sockett, 2009). Due to its obligatory predatory lifestyle, manipulation of Bdellovibrio requires two-member culturing techniques using selected prey microorganisms (Lambert et al., 2003). In this ...
[摘要] HDD是一种专有捕食者，可以用于各种革兰氏阴性菌。 Bdellovibrio的双相生长周期包括自由游泳攻击阶段和胞内生长期，其中捕食者复制其DNA并使用猎物作为营养源，最终分成单个细胞（Sockett ，2009）。由于其必要的掠夺性生活方式，使用选择的猎物微生物（Lambert等人，2003）的双重培养技术的操作需要Bdellovibrio 。在这个协议中，我们描述了一个详细的工作流程来增长和量化。细菌性HD100及其掠夺能力，轻松实施这些费时费力的技术。
在过去几年中，Bdellovibrio 已经吸引了科学界的兴趣，并且已经开发了若干应用，如进化研究（Davidov和Jurkevitch，2009），鉴定新的生物催化剂（Martínezet al。 （2012）），治疗应用（Atterbury等人，2011），或使用Bdellovibrio的生物技术应用作为回收附加值的溶解剂细胞内生物产物（Martínez等人，2016）。由于对Bdellovibrio 的兴趣日益增加，已经开发了用于量化这种掠食性细菌的不同间接方法（Mahmoud等人，2007; Lambert和Sockett，2008; Van Essche et al。，2009）。然而，通过双层方法直接量化B。o is is is is is is is is is to to to to ...
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| Olfactory Bulb (OB) Transplants
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Author:
Date:
2016-09-05
[Abstract] Transplantation in mouse brain slices is a powerful tool in order to study axon targeting and migrational events during development. Taking advantage of donors and recipients belonging to different genotypes, this technique allows researchers to assess the contribution of donor and/or recipient tissue by performing various combinations and to study cell-autonomous functions or effects that are influenced by the recipient’s environment (Bastakis, et al., 2015). Here we describe the transplantation procedure on sagittal brain slices containing olfactory bulb (OB). Specifically, we have ...
[摘要] 小鼠脑切片中的移植是一个强大的工具，以便研究轴突靶向和发展过程中的迁移事件。 利用属于不同基因型的供体和受体，该技术允许研究人员通过进行各种组合来评估供体和/或受体组织的贡献，并研究受受体环境影响的细胞自主功能或效应（Bastakis， em>等人，2015）。 在这里我们描述的矢状大脑切片包含嗅球（OB）的移植程序。 具体来说，我们已经将背侧OB的近端到外皮部分移植到受体切片上的相同区域。 移植的切片可以培养长达3天，之后由于3D中的生长它们的形态被破坏。 这些切片的重新切片允许更详细的免疫组织化学分析。
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