| MPM-2 Mediated Immunoprecipitation of Proteins Undergoing Proline-directed Phosphorylation
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Author:
Date:
2016-12-05
[Abstract] Immunoprecipitation (IP) represents a widely utilized biochemical method to isolate a specific protein from a complex mixture taking advantage of an antibody that specifically recognizes that particular target molecule. This procedure is extremely versatile and can be applied to concentrate a specific protein, to identify interacting partners in complex with it or to detect post-translational modifications. The mitotic protein monoclonal 2 (MPM-2) is an antibody originally raised against extracts of synchronized mitotic HeLa cells to identify proteins selectively present in mitotic, and not ...
[摘要] 免疫沉淀（IP）代表广泛使用的生物化学方法，以利用特异性识别特定靶分子的抗体从复杂混合物中分离特异性蛋白质。该程序是非常通用的，可以应用于集中特定蛋白质，识别与其复合的相互作用的配偶体或检测翻译后修饰。有丝分裂蛋白单克隆2（MPM-2）是最初针对同步有丝分裂HeLa细胞的提取物产生的抗体，以鉴定选择性存在于有丝分裂中的蛋白质，而不是在间期细胞中（Davis等，1983）。 MPM-2识别磷酸化的丝氨酸或苏氨酸残基，随后是脯氨酸（pS / T-P），由脯氨酸指导的蛋白激酶和磷酸酶的共同作用产生的共有表位（Lu等，2002）。这些可逆磷酸化事件已经出现以通过促进目标上的构象变化来控制各种细胞过程，这不仅仅是由于磷酸化事件本身。这些基序一旦被磷酸化，就能够招募Pin1（肽基 - 脯氨酰异构酶NIMA相互作用蛋白1）（Lu等人，1996; Lu和Zhou，2007），这是一个促进肽键上的顺式/反式异构化反应的伴侣，在基础功能不同的构象之间切换底层（Lu，2004; Wulf等人，2005）。该方案描述了使用支架分子突触后密度蛋白-95（PSD-95）（Chen等人，2005），神经元Pin1靶（Antonelli等，2016）作为示例的基于MPM-2的免疫沉淀策略以说明详细的程序。
【背景】由MPM-2抗体识别的抗原的鉴定代表了发现经过磷酸化脯氨酰异构化调控机制的靶分子的有用起点。 ...
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| RAB21 Activity Assay Using GST-fused APPL1
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Author:
Date:
2016-02-20
[Abstract] The Rab family of small GTPases are essential regulators of membrane trafficking events. As with other small GTPase families, Rab GTPases cycle between an inactive GDP- bound state and an active GTP-bound state. Guanine nucleotide exchange factors (GEFs) promote Rab activation with the exchange of bound GDP for GTP, while GTPase-activating proteins (GAPs) regulate Rab inactivation with GTP hydrolysis. Numerous methods have been established to monitor the activation status of Rab GTPases. Of those, FRET-based methods are used to identify when and where a Rab GTPase is activated in cells. ...
[摘要] 小GTP酶的Rab家族是膜运输事件的必要调节剂。与其他小GTP酶家族一样，Rab GTP酶在不活动的GDP结合状态和活性GTP结合状态之间循环。鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）促进Rab激活与交换绑定GDP GTP，而GTPase激活蛋白（GAP）调节Rab失活与GTP水解。已经建立了许多方法来监测Rab GTPases的活化状态。其中，基于FRET的方法用于鉴定细胞中Rab GTPase在何时和何地被激活。不幸的是，这种探针的产生是复杂的，并且只有有限数量的Rab已经以这种方式探测。来自细胞或组织提取物的活化的Rabs的生物化学纯化通过使用已知的Rab效应结构域以下拉特定的GTP结合的Rab形式是容易实现的。虽然这种方法不是理想的详细的亚细胞定位，它可以提供Rab活动的时间分辨率。越来越多的特异性效应物的鉴定现在允许在特定条件下测试许多Rab GTP酶的活化水平。在这里，我们描述了一种亲和纯化方法使用GST融合APPL1（一种已知的RAB21效应）来测试哺乳动物细胞中的RAB21激活。该方法成功地用于测定RAB21激活状态下营养丰富与饥饿条件下的变化，并测试在此过程中MTMR13 RAB21 GEF的需求。
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