| Antimicrobial Sensitivity Assay for Bdellovibrio bacteriovorus
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Author:
Date:
2020-12-20
[Abstract] Bdellovibrio bacteriovorus, an obligate predatory bacterium [i.e., bacteria that kill and feed on other bacteria (prey)], has the potential to be used as a probiotic for the disinfection of surfaces or for the treatment of bacterial infections. One option is to use this organism in combination with antimicrobials to potentiate the effectiveness of treatments. In order to make this approach feasible more has to be known about the ability of B. bacteriovorus to resist antibiotics itself. Standard assays to determine the minimum inhibitory concentration (MIC) are not suitable for B. ...
[摘要] [摘要]蛭弧菌弧菌，一种专性捕食细菌[即，细菌杀灭和进料的其它细菌（猎物）] ，有可能使被用作表面的消毒益生菌或细菌感染的治疗。一种选择是将这种生物体与抗菌素联合使用以增强治疗效果。为了使该方法可行，必须进一步了解细菌噬菌芽孢杆菌自身抵抗抗生素的能力。标准测定法来确定最小抑制浓度（MIC）是不适合B.弧菌，由于 的小尺寸该细菌（0.25-0.35由0.5-2的微米）防止在OD散射600 。由于这些细菌掠夺需要用于生长较大的捕食的细菌（例如，大肠杆菌（E.coli）尺寸为1由1-2微米），第这里描述的用于抗微生物敏感性测定方法E基础是OD的降低600期间引起的猎物裂解增长。以前关于掠食性细菌对抗菌素耐药性的研究采用的方法无法直接将抗菌素耐药性水平与其他细菌种类进行比较。在这里，我们描述了一种确定细菌对芽孢杆菌的抗药性的方法，该方法可与被测试的参照生物体尽可能接近相同的实验条件进行比较。简要地说，最低抑菌浓度（MIC）值的B.弧菌通过在存在和不存在不同浓度的抗微生物剂的混合捕食者/猎物培养物的600nm处测量的吸光度的减少来确定。值得注意的是，可以使用不同的条件，猎物细菌和/或抗菌剂来修改此方法以获得其他掠食性细菌的抗菌素MIC值。
[背景]噬菌蛭弧菌是一种革兰氏阴性细菌掠夺是“早”在其他革兰氏阴性细菌的物种，生长在他们的牺牲，并最终杀死它们。细菌噬菌芽孢杆菌以及其他掠食性细菌有潜力用作益生菌以消毒表面或治疗细菌感染（Tyson和Elizabeth ...
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| Quantification of the Composition Dynamics of a Maize Root-associated Simplified Bacterial Community and Evaluation of Its Biological Control Effect
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Author:
Date:
2018-06-20
[Abstract] Besides analyzing the composition and dynamics of microbial communities, plant microbiome research aims to understanding the mechanism of plant microbiota assembly and their biological functions. Here, we describe procedures to investigate the role of bacterial interspecies interactions in root microbiome assembly and the beneficial effects of the root microbiota on hosts by using a maize root-associated simplified seven-species (Stenotrophomonas maltophilia, Ochrobactrum pituitosum, Curtobacterium pusillum, Enterobacter cloacae, Chryseobacterium ...
[摘要] 除了分析微生物群落的组成和动态外，植物微生物群落研究的目的在于了解植物微生物群落组装的机制及其生物学功能。在这里，我们描述了通过使用与玉米根相关的简化的七种物种（嗜麦芽窄食单胞菌（Stenotrophomonas maltophilia），）来研究细菌种间相互作用在根微生物群组装中的作用以及根菌群对宿主的有益影响的程序。 Ochrobactrum pituitosum ，Curtobacterium pusillum ，阴沟肠杆菌， Chryseobacterium indologenes ，<在我们以前的工作中描述过的假单胞菌（pseudomonas putida））合成细菌群落。表面灭菌的玉米种子在含有多种细菌的悬浮液中浸泡后，在基于双管生长室的非生物体系中生长。通过对7种菌株中的每种菌株选择性培养基的培养依赖性方法追踪定殖在玉米根部的细菌群组成的动态。通过监测社区结构的变化来评估细菌相互作用对社区组装的影响。通过量化（1）真菌植物病原体，种子表面上的fusarium="" verticillioides和（2）幼苗枯萎的严重程度来评估简化的7种群落的植物保护效果真菌引起的疾病，在细菌群落的存在和不存在的情况下。我们的方案将作为研究实验室条件下植物="" -=""> ...
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| Isolation and Quantification of Plant Extracellular Vesicles
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Author:
Date:
2017-09-05
[Abstract] Extracellular vesicles (EVs) play an important role in intercellular communication by transporting proteins and RNA. While plant cells secrete EVs, they have only recently been isolated and questions regarding their biogenesis, release, uptake and function remain unanswered. Here, we present a detailed protocol for isolating EVs from the apoplastic wash of Arabidopsis thaliana leaves. The isolated EVs can be quantified using a fluorometric dye to assess total membrane content.
[摘要] 细胞外囊泡（EVs）通过传递蛋白质和RNA在细胞间通讯中发挥重要作用。 虽然植物细胞分泌电动汽车，但是它们最近才被孤立，并且关于它们的生物发生，释放，摄取和功能的问题仍然没有得到回答。 在这里，我们提出了一个详细的方案，用于从拟南芥叶片的脱水洗涤中分离EV。 可以使用荧光染料定量分离的EV，以评估总膜含量。
【背景】细胞外囊泡（EVs）是介导蛋白质，脂质和遗传物质的细胞与细胞转移的膜结合结构。由于哺乳动物EVs转运RNA和调节免疫反应的能力，对哺乳动物EV的兴趣已经增长。哺乳动物EV通常被分离用于从培养细胞的培养基中研究，以及生物流体的增长列表（Colombo等，2014）。植物电动车也被认为在免疫反应中起作用，但比较缺乏（An et al。，2007; Davis et al。，2016）。这在很大程度上归因于没有孤立的方法。
虽然植物EVs自1967年以来一直被观察到，使用透射电子显微镜，但直到2009年才开发出分离方法（Halperin和Jensen，1967）。 ...
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