| Plate Assay to Determine Caenorhabditis elegans Response to Water Soluble and Volatile Chemicals
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Author:
Date:
2018-02-20
[Abstract] The nematode Caenorhabditis elegans is widely used for behavioral studies ranging from simple chemosensation to associative learning and memory. It is vital for such studies to determine optimal concentrations of attractive and aversive chemicals that C. elegans can sense. Here we describe a resource localization assay in which a chemical compound of interest is placed in two compartments of a quadrant plate in order to determine optimal concentrations of the chemical in behavioral studies. Using the assay, we determined the optimal concentration of a water-soluble ...
[摘要] 线虫<秀秀隐杆线虫广泛用于从简单的化学感应到联想学习和记忆的行为研究。 这些研究对于确定吸引和厌恶化学物质的最佳浓度至关重要。="" 线虫可以感觉到。="" 在这里我们描述了一种资源定位测定法，其中将感兴趣的化学化合物置于象限板的两个隔室中以确定化学品在行为研究中的最佳浓度。="" 使用该测定，我们确定了水溶性引诱剂kcl的最佳浓度，作为研究关联学习和记忆的无条件刺激。="">
【背景】线虫线虫广泛用作动物行为研究的模式生物。 ℃。秀丽隐杆线虫感知主要由最大的化学感受器官（Ward，1973; Dusenbery，1974; Bargmann和Horvitz，1991; Bargmann等人）等介导的各种水溶性和挥发性化学物质。 1993）。行为研究必须确定可以被感知的化学物质的精确浓度。线虫。为了确定用于C的水溶性引诱剂的最佳浓度。线虫，Wicks等人（2000）使用象限琼脂平板进行行为测定，其中感兴趣的化学物质与琼脂在两个隔室中混合，并且该测定已广泛用于许多化学品（例如Jansen等人，2002; Ortiz等人，2009; Murayama和Maruyama，2013; Sassa＆lt; em＆gt; et al。，2013）。趋化性分析也被用于测量C的敏感性。 ...
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| Micro-computed Tomography to Visualize Vascular Networks in Maize Stems
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Author:
Date:
2018-01-05
[Abstract] Plant vascular systems in the stem connect roots with aerial organs to move solutes containing minerals, nutrients as well as signaling molecules, and therefore, they play pivotal roles in plant growth and development. However, stem vascular systems, especially in crop species, have been poorly described since they are deeply embedded in the tissue. Here we describe a protocol to utilize micro-computed tomography (micro-CT) scanning to visualize vascular networks in the maize stem. The protocol covers sample fixation and staining with contrasting reagents, data acquisition using micro-CT, ...
[摘要] 茎中的植物血管系统与空中器官连接根部以移动含有矿物质，营养素和信号分子的溶质，因此它们在植物生长和发育中起关键作用。 然而，由于它们深深地嵌入组织中，所以干燥的血管系统，特别是在作物种类中，描述得很差。 在这里我们描述一个协议，利用微型计算机断层扫描（微CT）扫描可视化玉米茎中的血管网络。 该协议涵盖样品固定和对比试剂染色，数据采集使用显微CT，重建三维（3D）模型的茎内部结构和提取血管网络模型。 该协议可以很容易地适用于各种类型的物种和器官/组织。
【背景】单子叶茎具有独特和独立的静脉的特征性血管网络。尽管支持生长发育的重要性，但单子叶植物的血管网络模式研究甚少。干血管网络的可视化是相当具有挑战性的，因为静脉深深地嵌入组织中。常规的组织切片可以用来观察网络，但是这是一个费时费力的过程，需要观察数百个部分。此外，作物茎的尺寸比显微镜下的视野大得多，因此很难捕捉整个系统。
最近，我们报道了玉米转录因子BEL1样同源异形体（BLH）12和BLH14在茎发育和静脉网络形成中起重要作用（Tsuda等人，2017）。为了全面了解血管系统，我们采用了先前描述的微型CT扫描并针对玉米茎杆进行了优化（Metscher，2009a和2009b，Degenhardt等人，2010，Staedler＆lt; et al。，2013，Gignac ...
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| Incubation of Cyanobacteria under Dark, Anaerobic Conditions and Quantification of the Excreted Organic Acids by HPLC
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Author:
Date:
2017-05-05
[Abstract] Succinate and lactate are commodity chemicals used for producing bioplastics. Recently, it was found that such organic acids are excreted from cells of the unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 under dark, anaerobic conditions. To conduct the dark, anaerobic incubation, cells were concentrated within a vial that was then sealed with a butyl rubber cap, following which N2 gas was introduced into the vial. The organic acids produced were quantified by high-performance liquid chromatography via post-labeling with bromothymol blue as a pH indicator. After ...
[摘要] 琥珀酸盐和乳酸盐是用于生产生物塑料的商品化学品。最近发现这样的有机酸从单细胞蓝细菌集胞藻的细胞中排出。 PCC 6803在黑暗，无氧条件下。为了进行黑暗的厌氧培养，将细胞浓缩在小瓶内，然后用丁基橡胶帽密封，随后将N 2气体引入小瓶中。通过用溴百里酚蓝作为pH指示剂的后标记，通过高效液相色谱定量产生的有机酸。通过离子排阻色谱分离后，通过将其保留时间与标准溶液的保留时间进行比较来鉴定有机酸。这些程序允许研究人员量化微生物产生的有机酸，有助于蓝藻生物学和生物技术的知识。
背景 蓝细菌是一组进行氧合光合作用的细菌。集胞藻 sp。 PCC 6803（以下称为集胞藻6803）是非固氮，单细胞蓝细菌，通常用于基础和应用研究。集胞藻6803细胞能够在黑暗和厌氧条件下分泌有机酸，如琥珀酸盐和乳酸盐（Osanai等，2015）。培养条件的遗传操作和修饰，例如添加钾或NaHCO 3，成功地提高了从集胞藻6803细胞排出的有机酸的水平（Osanai >等人，2015; Hasunuma等人，2016; Iijima等人，2016; Ueda等人。 ...
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