| Live Imaging of Myogenesis in Indirect Flight Muscles in Drosophila
|
|
Author:
Date:
2017-07-05
[Abstract] The indirect flight muscles (IFMs) are the largest muscles in the fly, making up the bulk of the adult thorax. IFMs in Drosophila are generated during pupariation by fusion of hundreds of muscle precursor cells (myoblasts) with larval muscle templates (myotubes). Prominent features, including the large number of fusion events, the structural similarity to vertebrate muscles, and the amenability to the powerful genetic techniques of the Drosophila system make the IFMs an attractive system to study muscle cell fusion. Here we describe methods for live imaging of IFMs, both in ...
[摘要] 间接飞行肌肉（IFM）是飞行中最大的肌肉，构成成年胸部的大部分。 通过将数百种肌肉前体细胞（成肌细胞）与幼虫肌肉模板（肌管）融合，在果蝇中产生IFMs 。 突出的特征，包括大量的融合事件，与脊椎动物肌肉的结构相似性，以及对果蝇系统强大的遗传技术的适应性使得IFM成为研究肌肉细胞融合的有吸引力的系统。 在这里，我们描述了在完整的蛹中和在离体的独立的IFM中实时成像IFM的方法。 （Segal等人，2016年）在手稿中使用了这里阐述的方案。
【背景】胚胎肌肉长期以来一直是肌肉发育研究的建立模型系统（Volk，1999; Chen和Olson，2004; Abmayr等人，2008; Richardson pup biological（Dutta，2006; Oas等人，2014; Weitkunat等人，2014; Shwartz等人，2016） ...
|
|
|
| Polyethylene Glycol-mediated Transformation of Drechmeria coniospora
|
|
Author:
Date:
2017-03-05
[Abstract] Drechmeria coniospora is a nematophagous fungus and potential biocontrol agent. It belongs to the Ascomycota. It is related to Hirsutella minnesotensis, another nematophagous fungus but, phylogenetically, it is currently closest to the truffle parasite Tolypocladium ophioglossoides. Together with its natural host, Caenorhabditis elegans, it is used to study host-pathogen interactions. Here, we report a polyethylene glycol-mediated transformation method (Turgeon et al., 2010; Ochman et al., 1988) for this fungus. The protocol can be used to ...
[摘要] Drechmeria coniospora 是一种无害真菌和潜在的生物防治剂。它属于子囊菌纲。它与另外一种没食子菌真菌Hirsutella minnesotensis有关，但在系统发育中，它目前最接近松露寄生虫Tolypocladium ophioglossoides 。与其天然宿主，秀丽隐杆线虫一起，它用于研究宿主 - 病原体相互作用。在这里，我们报告了这种真菌的聚乙二醇介导的转化方法（Turgeon等人，2010; Ochman等人，1988）。该方案可用于产生敲入或敲除菌株（Lebrigand等人，2016）。
背景 D。 coniospora 已被开发为用于研究先天免疫的模型病原体。 elegans （Lebrigand等人，2016和其中的参考文献）。 D。 coniospora 在标准生长培养基上缓慢增长，使得体外研究困难，难以开发转化方法。我们在这里报告一种允许快速生产大量的D的文化方法。 coniospora ，开辟了其遗传修饰的道路。聚乙二醇介导的转化可能是广泛应用于修饰真菌的最简单的方法。我们发现它可以与一起使用。 coniospora ，因此提供了故意修改其基因组的第一种方法。
|
|
|
| Gene Expression Analysis of Sorted Cells by RNA-seq in Drosophila Intestine
|
|
Author:
Date:
2016-12-20
[Abstract] RNA sequencing (RNA-seq) has become a popular method for profiling gene expression. Among many applications, one common purpose is to identify differentially expressed genes and pathways in different biological or pathological conditions. This protocol provides detailed procedure for RNA-seq analysis of ~250,000 sorted Drosophila intestinal cells (Chen et al., 2016), in which RNA amplification is not required.
[摘要] RNA测序（RNA-seq）已经成为描述基因表达的流行方法。 在许多应用中，一个共同目的是在不同的生物学或病理学条件下鉴定差异表达的基因和途径。 该方案提供了〜250,000个分选的果蝇肠细胞的RNA-seq分析的详细程序（Chen等，2016），其中不需要RNA扩增。
【背景】RNA-seq的转录组分析已经成为鉴定不同生物或病理条件下差异表达基因和途径的常用方法。 对于产生低mRNA水平的样品，通常在深度测序之前进行RNA或cDNA扩增（Dutta等，2015）。 然而，这个程序可能会潜在地省略以低丰度表达的重要候选人。 在这里，我们提供了不需要RNA扩增的分选的果蝇肠细胞的RNA-seq分析的详细程序。
|
|
|