| Trimolecular Fluorescence Complementation (TriFC) Assay for Direct Visualization of RNA-Protein Interaction in planta
|
|
Author:
Date:
2017-10-20
[Abstract] RNA-Protein interactions play important roles in various eukaryotic biological processes. Molecular imaging of subcellular localization of RNA/protein complexes in plants is critical for understanding these interactions. However, methods to image RNA-Protein interactions in living plants have not yet been developed until now. Recently, we have developed a trimolecular fluorescence complementation (TriFC) system for in vivo visualization of RNA-Protein interaction by transient expression in tobacco leaves. In this method, we combined conventional bimolecular fluorescence ...
[摘要] RNA-蛋白质相互作用在各种真核生物过程中起重要作用。 RNA /蛋白质复合物在植物中亚细胞定位的分子成像对于理解这些相互作用至关重要。然而，到目前为止，尚未开发在活植物中形成RNA-蛋白质相互作用的方法。最近，我们开发了一种三分子荧光互补（TriFC）系统，用于在烟草叶中瞬时表达的RNA-蛋白质相互作用的体内可视化。在这种方法中，我们将传统的双分子荧光互补（BiFC）系统与MS2系统（噬菌体MS2外壳蛋白[MCP]及其结合RNA序列[MS2序列]）（Schonberger等人，2012）相结合， 。目标RNA用6xMS2标记，MCP和RNA结合蛋白与YFP片段融合。编码这种融合RNA和蛋白质的DNA构建体用土壤杆菌悬浮液渗入烟草叶中。通过共焦显微镜观察体内的RNA-蛋白质相互作用
【背景】近来，多种类型的长非编码RNA（lncRNA）已经被鉴定并显示出在转录调节和染色质修饰中起重要作用（St Laurent等人，2015）。到目前为止，lncRNA介导的功能的大多数分子机制与RNA-蛋白质相互作用密切相关（St ...
|
|
|
| Purifying Properly Folded Cysteine-rich, Zinc Finger Containing Recombinant Proteins for Structural Drug Targeting Studies: the CH1 Domain of p300 as a Case Example
|
|
Author:
Date:
2017-09-05
[Abstract] The transcription factor Hypoxia-Inducible Factor (HIF) complexes with the coactivator p300, activating the hypoxia response pathway and allowing tumors to grow. The CH1 and CAD domains of each respective protein form the interface between p300 and HIF. Small molecule compounds are in development that target and inhibit HIF/p300 complex formation, with the goal of reducing tumor growth. High resolution NMR spectroscopy is necessary to study ligand interaction with p300-CH1, and purifying high quantities of properly folded p300-CH1 is needed for pursuing structural and biophysical studies. ...
[摘要] 与共激活因子p300的转录因子缺氧诱导因子（HIF）复合物，激活缺氧反应途径并允许肿瘤生长。每个相应蛋白质的CH1和CAD结构域形成p300和HIF之间的界面。正在开发靶向和抑制HIF / p300复合物形成的小分子化合物，目的是减少肿瘤生长。研究配体与p300-CH1相互作用的高分辨NMR光谱是必要的，为了进行结构和生物物理学研究，需要净化大量正确折叠的p300-CH1。 p300-CH1具有3个锌指和9个半胱氨酸残基，构成与试剂相容性和蛋白氧化相关的挑战。已经开发了一种通过在表达过程中并入锌并简化纯化时间来克服这些问题的方案，导致适合于结构NMR研究的最佳折叠蛋白质（120mg / 4L表达介质）的高产率。已证实最终重组p300-CH1的结构完整性是使用一维1 H NMR光谱和圆二色性最优的。该方案适用于纯化其他含锌指蛋白质。
【背景】由于不适当的血管灌注，实体瘤的发展与缺氧区的发展有关。对于缺氧微环境，肿瘤细胞过表达低氧诱导因子（HIF），一种异二聚体转录因子家族（Semenza，2002; Brat和Van Meir，2004; Kaur等，2005）。 HIFs结合p300（一种转录共激活因子），形成诱导HIF靶基因的复合物，从而激活缺氧反应途径并促进肿瘤生长（Kasper and Brindle，2006; Liu，2008）。涉及HIF / p300蛋白 ...
|
|
|
| Preparation of Recombinant Galectin-3 for Cancer Studies
|
|
Author:
Date:
2016-01-05
[Abstract] Galectin-3 is a member of a class of proteins termed Galectins, characterized by their ability to bind glycans containing β-galactose (Cummings and Liu, 2009). Galectin-3 binds preferentially to proteoglycans terminating with N-acetyllactosamine (LacNAc) chains (i.e., tandem repeats of galactose) (Newlaczyl and Yu, 2011). Galectin-3 is unique among the galectins in its chimeric structure. It shares a conserved carbohydrate recognition domain (CRD) with the other galectins, but has a long amino-terminal tail that is thought to be involved in protein aggregation. It can also form ...
[摘要] Galectin-3是称为Galectins的一类蛋白质的成员，其特征在于它们结合含有β-半乳糖的聚糖的能力（Cummings和Liu，2009）。 Galectin-3优先结合以N-乙酰乳糖胺（LacNAc）链（即半乳糖的串联重复）终止的蛋白聚糖（Newlaczyl和Yu，2011）。 Galectin-3在其嵌合结构中的半乳凝素中是独一无二的。它与其他半乳凝素共享保守的碳水化合物识别结构域（CRD），但具有被认为参与蛋白质聚集的长氨基末端尾部。它也可以通过CRD形成同型二聚体（Cummings和Liu，2009）。已经发现Galectin-3在肿瘤发生中具有多种功能，包括：信号转导，凋亡抑制，免疫抑制，细胞生长和转移等。 ...
|
|
|